A função devtools::install_deps() é uma função que verifica se os pacotes do qual o seu depende (descritos no DESCRIPTION) estão instalados e então instala aqueles que não estiverem. Nunca usei com pacotes do Bioconductor, mas pacotes do CRAN, logicamente, que funciona. Pacotes no GitHub também. Eu suponho que ao passar o endereço do repositório do Bioconductor deve funcionar. Veja abaixo um exemplo.
library(devtools) install_deps(dependencies = TRUE, quiet = TRUE, upgrade = FALSE, repos = "http://cran-r.c3sl.ufpr.br/") À disposição. Walmes.
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