Re: [R-br] Selecionar as variáveis físicas e químicas que melhor correlacionam com uma variável visual em experimento em fatorial 2x3

2013-11-20 Por tôpico Tiago Souza Marçal
De uma olhada na análise de correspondência, ela esta implementada no pacote MASS. Att. Tiago. # Tiago de Souza Marçal - Graduando em Agronomia pelo CCA-UFES Bolsista de Iniciação Científica da área de Genética e Melhoramento

Re: [R-br] Selecionar as variáveis físicas e químicas que melhor correlacionam com uma variável visual em experimento em fatorial 2x3

2013-11-20 Por tôpico André Lucas de Oliveira Moreira
Também me interesso por este tópico, alguém sugere algum material de apoio introdutório? Em 20 de novembro de 2013 06:29, Tiago Souza Marçal tiagosouzamar...@hotmail.com escreveu: De uma olhada na análise de correspondência, ela esta implementada no pacote MASS. Att. Tiago.

Re: [R-br] Parametrização com lme4

2013-11-20 Por tôpico walmes .
Fernando, Acho que é assim: ## fatores cruzados xtabs(~local+trat, dados) ## fatores aninhados xtabs(~trat+eras, dados) ## local ## +bloco dentro de local ## +tratamento ## +interação local tratamento mf1 - lm(terms(resp~local/rep+trat+local:trat, keep=TRUE), data=dados) anova(mf1)

[R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Giselle Davi
Prezados, estou tendo problemas em rodar a análise conforme manual do R: Genomic prediction with rrBLUP 4 Jeffrey Endelman,June 15, 2013 . Ao rodar a análise igual ao solicitado no manual a dim (X) resulta em NULL . Vcs poderiam me ajudar a encontrar a dimensão correta desta matriz ?? Aqui

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Benilton Carvalho
use apenas: GBS = read.csv('tpg12-06-0006-dataset-s2', header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE) a razao deixo como exercicio p vc... b Em 20 de novembro de 2013 11:37, Giselle Davi giselle_d...@yahoo.com.brescreveu: Prezados, estou tendo problemas em rodar a análise conforme manual do R:

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Giselle Davi
Agradeço pela ajuda, mas Continua não dando certo.!!! Olha só a saída:  GBS = read.csv('tpg12-06-0006-dataset-s2', header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE) Error in file(file, rt) : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, rt) :   cannot open file

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Leandro Marino
O problema está aqui: cannot open file 'tpg12-06-0006-dataset-s2': No such file or directory o arquivo não existe no local que está. veja o diretorio que vc está com getwd() e liste os arquivos do diretorio com dir(getwd()), você verá que não há nenhum arquivo com esse nome.

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Giselle Davi
Isso foi a primeira coisa que conferi Olha só a saída:   Sys.setenv(HTTP_PROXY=http://giselle:selecaogenomic@2...@proxy.cnpms.embrapa.br:3128;) getwd() [1] C:/GS_tutorial dir(getwd()) [1] DatasetS2_29SAWSN_gbs.csv [2] DatasetS2_29SAWSN_gbs.txt [3] Geno_RRBLUP_All.txt       [4] RData        

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Benilton Carvalho
O melhor, Giselle, é vc tornar uma amostra do seu arquivo disponível (mesmo que seja com valores trocados, etc). Eu usei como exemplo o arquivo que vc passou como referência no sei primeiro email. On Nov 20, 2013 1:44 PM, Giselle Davi giselle_d...@yahoo.com.br wrote: Isso foi a primeira coisa

Re: [R-br] dim(X)

2013-11-20 Por tôpico Ivan Bezerra Allaman
A mensagem de erro é clara. O arquivo não existe ou o diretório não pode ser encontrado. Use o mesmo caminho que estava usando, apagando sep=;, dec=,,header=TRUE e colocando o que o Benilton sugeriu, ou seja, faça: GBS - read.csv(C:/GS_tutorial/DatasetS2_29SAWSN_gbs.csv,

Re: [R-br] Parametrização com lme4

2013-11-20 Por tôpico FHRB Toledo
Adriano e Walmes, Obrigado pelas sugestões, e por compartilhar o livro! O modelo ajustou corretamente, perfeito! Obrigado mesmo. abraço, FH 2013/11/20 walmes . walmeszevi...@gmail.com Fernando, Acho que é assim: ## fatores cruzados xtabs(~local+trat, dados) ## fatores aninhados

[R-br] Erro ao fazer a leitura de arquivos shapefiles.

2013-11-20 Por tôpico Rudiney S Pereira
Boa tarde a todos! Estou tentando realizar a leitura de arquivos shapefiles usando o maptools. O código que estou usando é: Loading required package: sp require(maptools) Carregando pacotes exigidos: maptools Checking rgeos availability: TRUE library(sp, lib=/home/est/paulojus/R-lib/)

Re: [R-br] Erro ao fazer a leitura de arquivos shapefiles.

2013-11-20 Por tôpico Éder Comunello
Prezado Rudiney, boa tarde! O erro se deve à incompatibilidade do pacote maptools() com shapefiles do tipo M. O artigo do Wikipedia disponível em http://en.wikipedia.org/wiki/Shapefile fala mais sobre tipos de shapefile. O problema é relatado no link