De uma olhada na análise de correspondência, ela esta implementada no pacote
MASS.
Att.
Tiago.
# Tiago de
Souza Marçal - Graduando em Agronomia pelo CCA-UFES Bolsista de Iniciação
Científica da área de Genética e Melhoramento
Também me interesso por este tópico, alguém sugere algum material de apoio
introdutório?
Em 20 de novembro de 2013 06:29, Tiago Souza Marçal
tiagosouzamar...@hotmail.com escreveu:
De uma olhada na análise de correspondência, ela esta implementada no
pacote MASS.
Att.
Tiago.
Fernando,
Acho que é assim:
## fatores cruzados
xtabs(~local+trat, dados)
## fatores aninhados
xtabs(~trat+eras, dados)
## local
## +bloco dentro de local
## +tratamento
## +interação local tratamento
mf1 - lm(terms(resp~local/rep+trat+local:trat, keep=TRUE),
data=dados)
anova(mf1)
Prezados,
estou tendo problemas em rodar a análise conforme manual do R: Genomic
prediction with rrBLUP 4
Jeffrey Endelman,June 15, 2013 . Ao rodar a análise igual ao solicitado no
manual a dim (X) resulta em NULL . Vcs poderiam me ajudar a encontrar a
dimensão correta desta matriz ??
Aqui
use apenas:
GBS = read.csv('tpg12-06-0006-dataset-s2', header=TRUE,
stringsAsFactors=FALSE)
a razao deixo como exercicio p vc...
b
Em 20 de novembro de 2013 11:37, Giselle Davi
giselle_d...@yahoo.com.brescreveu:
Prezados,
estou tendo problemas em rodar a análise conforme manual do R:
Agradeço pela ajuda, mas
Continua não dando certo.!!!
Olha só a saída:
GBS = read.csv('tpg12-06-0006-dataset-s2', header=TRUE, stringsAsFactors=FALSE)
Error in file(file, rt) : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(file, rt) :
cannot open file
O problema está aqui:
cannot open file 'tpg12-06-0006-dataset-s2': No such file or directory
o arquivo não existe no local que está.
veja o diretorio que vc está com getwd() e liste os arquivos do diretorio
com dir(getwd()), você verá que não há nenhum arquivo com esse nome.
Isso foi a primeira coisa que conferi Olha só a saída:
Sys.setenv(HTTP_PROXY=http://giselle:selecaogenomic@2...@proxy.cnpms.embrapa.br:3128;)
getwd()
[1] C:/GS_tutorial
dir(getwd())
[1] DatasetS2_29SAWSN_gbs.csv
[2] DatasetS2_29SAWSN_gbs.txt
[3] Geno_RRBLUP_All.txt
[4] RData
O melhor, Giselle, é vc tornar uma amostra do seu arquivo disponível (mesmo
que seja com valores trocados, etc). Eu usei como exemplo o arquivo que vc
passou como referência no sei primeiro email.
On Nov 20, 2013 1:44 PM, Giselle Davi giselle_d...@yahoo.com.br wrote:
Isso foi a primeira coisa
A mensagem de erro é clara. O arquivo não existe ou o diretório não pode
ser encontrado.
Use o mesmo caminho que estava usando, apagando
sep=;, dec=,,header=TRUE
e colocando o que o Benilton sugeriu, ou seja, faça:
GBS - read.csv(C:/GS_tutorial/DatasetS2_29SAWSN_gbs.csv,
Adriano e Walmes,
Obrigado pelas sugestões, e por compartilhar o livro!
O modelo ajustou corretamente, perfeito!
Obrigado mesmo.
abraço,
FH
2013/11/20 walmes . walmeszevi...@gmail.com
Fernando,
Acho que é assim:
## fatores cruzados
xtabs(~local+trat, dados)
## fatores aninhados
Boa tarde a todos!
Estou tentando realizar a leitura de arquivos shapefiles usando o maptools.
O código que estou usando é:
Loading required package: sp
require(maptools)
Carregando pacotes exigidos: maptools
Checking rgeos availability: TRUE
library(sp, lib=/home/est/paulojus/R-lib/)
Prezado Rudiney, boa tarde!
O erro se deve à incompatibilidade do pacote maptools() com shapefiles do
tipo M. O artigo do Wikipedia disponível em
http://en.wikipedia.org/wiki/Shapefile fala mais sobre tipos de shapefile.
O problema é relatado no link
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