Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Leonardo Ferreira Fontenelle
Luiz Roberto, como estou sem R ao alcance vou fornecer uma solução aproximada. Em primeiro lugar, você vai querer transformar esses vetores de texto em vetores de números inteiros, utilizando a função as.integer()[1]. Quanto à comparação dos vetores propriamente dita, a solução mais simples é com

[R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Luiz Roberto Martins Pinto
Caros companheiros da Lista R, # Os dados abaixo referem-se a 2 acessos de mandioca (A1 e A2), e 101 marcadores RAPD (1=presença da marca; 0=ausência da marca; NA=dado perdido); portanto os dados são binários. # Preciso de uma função que me retorne a probabilidade (p-value) do acesso A1 ser

Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Luiz Roberto Martins Pinto
Leonardo, Agradeço a sugestão. Mas é possível que as proporções sejam as mesmas entre dois acessos diferentes, se os marcadores estiverem em posições diferentes. Luiz Roberto. Luiz Roberto Martins Pinto Prof. Pleno/DCET/UESC Laboratório de Estatística Computacional Universidade Estadual de

Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Luiz Roberto Martins Pinto
Semelhança no perfil. O perfil de cada acesso é descrito por 101 marcadores moleculares. Pensando, agora, na sugestão do Leonardo, e pensando no seu questionamento, talvez avaliar a proporção de marcadores iguais fosse uma boa análise deste perfil. Não tinha pensado nisto... Luiz Roberto.

Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Cesar Rabak
Luiz Roberto, Frente a sua resposta para o Leonardo, é imperioso propor-lhe a questão: Qual seria a definição de semelhança entre os dois acessos? Com essa informação podemos tentar encontrar um teste estatístico com mais potência para a comparação... HTH -- Cesar Rabak 2015-08-19 16:10

Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Luiz Roberto Martins Pinto
Eu recorri à função que o Leonardo sugeriu... e rodei.. # Sugestão do Leonardo: A1=

Re: [R-br] Função para comparar acessos. Dados binários. RAPD.

2015-08-19 Por tôpico Leonardo Ferreira Fontenelle
Luiz Roberto, O que o exemplo está medindo é se a proporção de fumantes é diferente entre os quatro grupos; pacientes é o denominador e fumantes é o numerador. O exemplo não está comparando uma terceira característica entre dois grupos diferentes. Por isso a função não aceita valores faltantes: é