Eles tem um github (taxize) envie um Pull request na função.
Em 10 de maio de 2013 17:12, Augusto Ribas <[email protected]> escreveu: > Sim, se saise um NA, um Null seria perfeito. > Eu estava sugerindo no fórum oficial dos pacotes uma forma > mais amigável de testar um vetor ou lista de nomes de forma mais simples. > Agora com exemplos acho que consigo propor algo mais amigável e razoável. > Mas na pagina do try tinha uma menção ao trycatch, mas eu não consegui > usar de forma eficiente. Daquele jeito ficou bem legal. > > Bem agradeço novamente a ajuda e comentários de todos :) > > > Em 10 de maio de 2013 15:51, David Valentim Dias > <[email protected]>escreveu: > > Bom que o problema se resolveu com os exemplos acima dos colegas da lista. >> Checagem de erro no R fora da biblioteca padrão é um caos mesmo. Poderia >> muito bem retornar algo diferente de string (NA por exemplo) e você ia >> checar e substituir como foi sugerido acima. >> >> Abraços >> >> >> Em 10 de maio de 2013 15:34, Augusto Ribas <[email protected]>escreveu: >> >> # >>> sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = >>> function(...)"verificar")) >>> # >>> >>> Isso era o que eu queria :), funcionou perfeitamente. >>> >>> David, o taxisize retorna uma mensagem de erro que é uma String. Por >>> exemplo eu guardava os resultados numa matriz de characters, onde uma >>> coluna é o nome que usei para fazer a busca, a resposta quando da certo são >>> o nome sugerido, um score que é referente a se o nome não esta >>> desatualiado, se tem erro de digitação, se não mudou que são as coisas que >>> eu guardo. >>> >>> Ai usando o try() tava ficando uma mensagem enorme nas células, ai no r >>> so imprimia 1 coluna por vez, ai eu queria que ele deixa-se uma palavra >>> menor so para facilitar a visualização, ja que se não deu certo eu quero >>> verificar caso a caso mesmo, ou posso tentar denovo so com o que falhou, >>> porque existem muitos erros de nome de especie muito antigas, que mudou, >>> essas coisas que não é para dar certo mesmo >>> Mas acho que usando esse tryCatch ai dar certo agora. >>> Eu imaginei que seria melhor deixar um exemplo mais simples, que >>> produzia o mesmo efeito aqui, o efeito é mais ou menos o mesmo. >>> >>> Mas muito obrigado pelas resposta. me ajudaram muito. >>> >>> Abraços >>> Augusto Ribas >>> >>> >>> Em 10 de maio de 2013 14:54, Henrique Dallazuanna >>> <[email protected]>escreveu: >>> >>> Tente assim: >>>> >>>> sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = >>>> function(...)"verificar")) >>>> >>>> >>>> 2013/5/9 Augusto Ribas <[email protected]> >>>> >>>>> Ola, eu gostaria de saber, se tem como eu mudar de forma simples a >>>>> mensagem de erro que o R envia ao tentar usar uma função e receber um >>>>> erro. >>>>> >>>>> Por exemplo: >>>>> >>>>> #Imagine que eu tenho a seguinte lista, e precise aplicar uma função >>>>> >>>>> #Exemplo de lista de dados >>>>> teste<-list(2, "a", 1 , 10 , "b") >>>>> teste >>>>> >>>>> #Preparando um lugar para guardar os resultados >>>>> saida<-list() >>>>> >>>>> #Se eu tentar fazer um loop com for, ele vai parar >>>>> #quando chegar a letra, porque nao da para fazer o log de caracter >>>>> for( i in 1:length(teste)) { >>>>> saida[i] <-log(teste[i]) >>>>> } >>>>> >>>>> #nesse caso o loop para e eu nao tenho a saida que desejo >>>>> saida >>>>> >>>>> #Mas então eu tentei usar a função try >>>>> #minha ideia era que se der para calcular, calcule >>>>> #senão de uma msg de erro e siga em frente pro proximo >>>>> >>>>> for( i in 1:length(teste)) { >>>>> saida[[i]] <-try( log(teste[[i]][1]) ) >>>>> } >>>>> >>>>> #agora eu tenho minha saida, com erro onde não deu para calcular, isso >>>>> que eu queria >>>>> saida >>>>> >>>>> #o que eu queria saber se é possivel fazer o seguinte >>>>> #se der certo, execute a função, senão imprima o erro que eu falar >>>>> #nesse caso eu gostaria de uma saida desse tipo: >>>>> >>>>> saida.exemplo<-list(0.6931472,"Verificar",0,2.302585,"Verificar") >>>>> saida.exemplo >>>>> >>>>> ############################################################# >>>>> >>>>> Esse exemplo eu peguei na função try. >>>>> >>>>> Mas na verdade eu estou usando o pacote taxize >>>>> (http://ropensci.github.io/taxize_/) >>>>> para conferir nomes de especies, e para conferir listas grandes, as >>>>> vezes para quando a conexão com a internet falha, ou o nome da especie >>>>> não é encontrado, resumindo eu queria saber se existe uma forma de >>>>> falar pro R, fazer isso (minha função), se der erro retorne isso >>>>> (minha mensagem). >>>>> >>>>> Agradeço desde ja a atenção. >>>>> >>>>> -- >>>>> Grato >>>>> Augusto C. A. Ribas >>>>> >>>>> Site Pessoal: http://recologia.com.br/ >>>>> Github: https://github.com/Squiercg >>>>> Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056 >>>>> _______________________________________________ >>>>> R-br mailing list >>>>> [email protected] >>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>>> código mínimo reproduzível. >>>>> >>>> >>>> >>>> >>>> -- >>>> Henrique Dallazuanna >>>> Curitiba-Paraná-Brasil >>>> 25° 25' 40" S 49° 16' 22" O >>>> >>>> _______________________________________________ >>>> R-br mailing list >>>> [email protected] >>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >>>> código mínimo reproduzível. >>>> >>> >>> >>> >>> -- >>> Grato >>> Augusto C. A. 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