Re: [R-br] COMPARANDO CURVAS [DÚVIDA]

Mauro Sznelwar por (R-br) Mon, 22 Oct 2018 18:51:25 -0700

Não consegui instalar o pacote minipack.lm, diz que não existe na versão R3.4.3. Estou usando o Windows, por acaso é só no Linux que êle existe?

Boa tarde pessoal,

Estou querendo fazer a comparação de duas curvas ajustadas utilizando a função "nlsLM" do pacote "minpack.lm". No entanto, não consigo ajustar as duas curvas em um único nlsLM, para depois usar a anova para realizar um teste da razão de verossimilhança para testar a restrição em A, B e C. Alguém pode me ajudar a solucionar esse problema. Desde já agradeço muito a todas as sugestões. Além disso, preciso usar esse pacote por causa do algoritmo de Levenberg-Marquardt. Segue o script reproduzível.

if(!require("minpack.lm")){install.packages("minpack.lm",dependencies=T);require("minpack.lm")}

if(!require("lattice")){install.packages("lattice",dependencies=T);require("lattice")}

d <- expand.grid(parA=c(1,1.99,3,4,5,6,6), sistema = factor(c("TRAT1","TRAT2")))

d$diversidade <- c(55.000, 19.572, 10.231, 7.225, 6.004, 5.4022, 5.0566,

62.000, 31.6952, 21.4178, 17.6125, 15.7654, 14.7072, 14.0334)

#ajusta as duas curvas em um unico nlsLM

n0 <- nlsLM(diversidade ~ A[sistema]/(1+B[sistema]*exp(-C[sistema]*parA)),

data = "" start = list(A = c(-2.790,11.106), B = c(-1.050,-0.821),

C = c(-0.090, 0.248)))

#Mensagem de erro:

# Error in dimnames(x) <- dn :

# length of 'dimnames' [2] not equal to array extent

# In addition: Warning message:

# In matrix(out$hessian, nrow = length(unlist(par))) :

# data length [9] is not a sub-multiple or multiple of the number of rows [6]

#ajusta o modelo em que A, B e C seja comum aos dois tratamentos

n1 <- nlsLM(diversidade ~ A/(1+B*exp(-C*parA)),

data = "" start = list(A = 4.158, B = -0.9355, C = 0.079))

anova(n0,n1)

--

Diego dos Santos Vieira

Engenheiro Florestal - UFRA

Mestre em Ciência Florestal - UFVJM

Doutorando em Ciência Florestal - UFVJM

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