%use engine XeLaTeX. suren
\listfiles
\documentclass[a4paper,12pt]{article}
\usepackage[margin=1in]{geometry}
\usepackage{fontspec}
\defaultfontfeatures{Ligatures=TeX}	%[Mapping=tex-text]
\usepackage{polyglossia}
\setdefaultlanguage{malayalam}
\setotherlanguage{english}
\newfontfamily\malayalamfont[Script=Malayalam,Mapping=malayalamnumerals]{Rachana}
\newfontfamily\englishfont{FreeSerif}
\begin{document}
\lefthyphenmin=2
\righthyphenmin=2
%\thispagestyle{empty}
\setmainfont[Script=Malayalam]{Rachana}
\setlength{\baselineskip}{1.25\baselineskip}\addtolength{\parskip}{10pt}
%\textenglish{1,2,3.}
മലയാളം  3 .\\  
മലയാളം  \textenglish{3.} \\
ജനനമരണദുഃഖദുരിതങ്ങളിൽ നിന്ന് മുക്തി നേടി ആത്മസാക്ഷാത്കാരം ലഭിയ്ക്കുകയാണ് മനുഷ്യജന്മത്തിന്റെ  പരമോന്നതലക്ഷ്യം\textenglish{.} ദ്വന്ദങ്ങളിൽ കഴിയുമ്പോൾ അദ്വൈതാനുഭൂതിയിലേയ്ക്ക് 

\end{document}