Re: [R-br] Fóruns e grupos

2017-02-14 Por tôpico Tito Conte via R-br
R Brasil no telegram

Tito Conte


Em 13 de fevereiro de 2017 22:31, Edson Lira via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Procure no Google
> "Foruns de Estatística usando o software R"
>
> Boa noite.
>
> Edson Lira
> Estatístico
> Manaus-Amazonas
>
>
> Em Sábado, 11 de Fevereiro de 2017 12:10, Roberto Guevara via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
>
>
> Colegas usuários de R, estou em busca de fóruns na internet ou grupos de
> whatsapp sobre Matemática e/ou Estatística (incluindo sobre R). Poderiam me
> indicar algum?
>
> Obrigado
>
> --
> Roberto Guevara Ferreira Lima
>
> Biólogo - CRBio 6ª Região: 73146/06-D
> Mestre em Zoologia
> Laboratório de Ecologia e Zoologia de Vertebrados
> Instituto de Ciências Biológicas
> Universidade Federal do Pará
> Rua Augusto Corrêa, nº 01 - Bairro: Guamá. CEP: 66075-110
> Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/7363382159007600
>
> ___
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a
> c�digo m�nimo reproduz�vel.
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> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Selecionar a extração de valores dos pixels em linhas a cada número de pixels arbitrário

2017-02-01 Por tôpico Tito Conte via R-br
Cara, não entendi direito o que você quer.

mas no meu entendimento vc precisa:

1- obter o nx,ny do seu raster

2- obter o index do seu ponto um i,j

e ai vc cria um vetor de 2 em 2 com seq (seq(i,ny,2))

E extrai pelo index

Caso não seja possíve extrair pelo index vc pode criar um vetor de
coordenadas e colocar o loop nelas.

Eu nunca mexi muito com raster no R (geralmente uso Py pra isso por que a
empresa usa mais py que R) mas acredito que funcione. Se tiver dificuldades
com os comandos da um alô que eu te dou uma força



Tito Conte


Em 26 de janeiro de 2017 17:43, ASANTOS via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
escreveu:

> Prezados Membros,
>
> Tenho um raster hipotético r:
>
> require(raster); require(sp)
>
> ## Criando um raster
> r <- raster(nc=10, nr=10)
> r <- setValues(r, round(runif(ncell(r))* 255))
>
>  Consigo extrair os valores dos pixels de interesse dadas as
> coordenadas centrais dos mesmos:
>
> x <- c(54,18,54,54)
> y <- c(27,81,9,63)
>
> pontos <- SpatialPoints(cbind(x,y))
>
> cells <- cellFromXY(r, pontos); cells
> p.cen <- xyFromCell(r, cells); p.cen
>
> values <- extract(r,p.cen)
> dados<-cbind(p.cen,cells,values)
>
> No entanto, eu gostaria de encontrar um modo para extrair o valor
> dos pixels, no qual, eu selecionaria uma coordenada e a função realizaria a
> extração dos pixels de linhas verticais inteiras do raster a cada dois
> pixels à partir da coordenada dada, por exemplo?
>
> Alguém poderia me dar uma ideia de como chegar a esse resultado?
>
> Obrigado,
>
> --
> ==
> Alexandre dos Santos
> Proteção Florestal
> IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
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>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e fornea cdigo
> mnimo reproduzvel.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Modificar um data frame em uma matriz de comparação múltipla específica

2017-01-16 Por tôpico Tito Conte via R-br
Alexandre,


Eu te sugiro converter seu resultado para vetor e inserir os nomes

out3 = list()

for(i in seq(1,length(out2)))
{
out3[[i]]=as.vector(out2[[i]])

names=
paste(
rep(rownames(out2[[i]]),each=ncol(out2[[i]])),
rep(colnames(out2[[i]]),nrow(out2[[i]]))
,sep='_')

names(out3[[i]])=names

}









Tito Conte


Em 11 de janeiro de 2017 21:28, ASANTOS via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
escreveu:

> Caros Membros,
>
>  Eu gostaria de modificar um data frame em uma matriz de
> comparação múltipla específica para tanto tenho um data frame DF com a nota
> dada por dois indivíduos (Indv) para cinco diferentes produtos químicos,
> sendo:
>
> Indv<-c(1,2)
> deltametrina<-c(1,1)
> fipronil<-c(5,3)
> imidaclopride<-c(7,5)
> sulfluramida<-c(3,7)
> tiametoxam<-c(9,9)
> DF<-cbind(Indv,deltametrina,fipronil,imidaclopride,sulfluram
> ida,tiametoxam)
> > DF
>  Indv deltametrina fipronil imidaclopride sulfluramida tiametoxam
> [1,]115 7 3  9
> [2,]213 5 7  9
>
>   Depois eu montei uma matriz de comparação múltipla com a
> seguinte regra, a variável (cada produto) com maior valor menos o de menor
> valor e armazenei a nota de cada Indv em um list, sendo:
>
> df <- as.data.frame(t(DF[, -1]))
> out <- lapply(df, function(x) outer(x, x, function(x, y) abs(x-y)))
> out2 <- lapply(out, function(m) {
>   dimnames(m) <- list(rownames(df), rownames(df))
>   m
> })
> out2
>
> $V1
>   deltametrina fipronil imidaclopride sulfluramida tiametoxam
> deltametrina 04 6 2  8
> fipronil   40 2 2  4
> imidaclopride62 0 4  2
> sulfluramida 22 4 0  6
> tiametoxam   84 2 6  0
>
> $V2
>   deltametrina fipronil imidaclopride sulfluramida tiametoxam
> deltametrina 02 4 6  8
> fipronil   20 2 4  6
> imidaclopride42 0 2  4
> sulfluramida 64 2 0  2
> tiametoxam   86 4 2  0
>
> No entanto, gostaria que meu output fosse:
>
> $V1
> - [deltametrina, fipronil, 4]
> - [deltametrina, imidaclopride, 6]
> - [deltametrina, sulfluramida, 2]
> - [deltametrina, tiametoxam, 8]
> - [fipronil, imidaclopride, 2]
> - [fipronil, sulfluramida, 2]
> - [fipronil, tiametoxam, 4]
> - [imidaclopride, sulfluramida, 4]
> - [imidaclopride, tiametoxam, 2]
> - [sulfluramida, tiametoxam, 6]
>
> $V2
> - [deltametrina, fipronil, 2]
> - [deltametrina, imidaclopride, 4]
> - [deltametrina, sulfluramida, 6]
> - [deltametrina, tiametoxam, 8]
> - [fipronil, imidaclopride, 2]
> - [fipronil, sulfluramida, 4]
> - [fipronil, tiametoxam, 6]
> - [imidaclopride, sulfluramida, 2]
> - [imidaclopride, tiametoxam, 4]
> - [sulfluramida, tiametoxam, 2]
>
> Alguém teria alguma sugestão para ajudar?
>
> Obrigado,
>
> Alexandre
>
> --
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Re: [R-br] Pacotes do R

2016-10-14 Por tôpico Tito Conte via R-br
Edmar, o que você precisa fazer exatamente? É mais fácil buscar o que você
precisa fazer na internet do que ficar consultando pacote por pacote.

Tito Conte


Em 14 de outubro de 2016 09:57, Edmar Caldas via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

>
> Bom Dia!
>
> Preciso baixar vários pacotes do R. São 120 pacotes onde posso encontrar
> porque ficar pesquisando um por um não dá.
>
> Edmar
>
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Re: [R-br] Problemas para instalar RNetCDF no Rstudio (linux)

2016-10-12 Por tôpico Tito Conte via R-br
Paulo, se o erro persistir, tente pelo conda!
https://www.continuum.io/downloads

Tito Conte


2016-10-11 18:19 GMT-03:00 Jônatan via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:

> Paulo, o link abaixo deve ajudar.
>
> http://stackoverflow.com/questions/11319698/how-to-
> install-r-packages-rnetcdf-and-ncdf-on-ubuntu
>
> On Tue, Oct 11, 2016 at 6:00 PM, Paulo Henrique Pimenta via R-br <
> r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
>> Olá a todos,
>>
>> Estou tentando instalar o RNetCDF no R do qual uso, num ubunutu 12.04 no
>> RStudio, porém não consigo instalar o pacote aparecendo o seguinte erro:
>>
>> ###
>>
>> > install.packages("RNetCDF")Installing package into 
>> > ‘/home/notemaster/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0’
>> (as ‘lib’ is unspecified)--2016-10-11 17:49:52--  
>> https://cran.rstudio.com/src/contrib/RNetCDF_1.8-2.tar.gzResolvendo 
>> cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)... 54.192.56.107Conectando-se a 
>> cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)|54.192.56.107|:443... conectado.A 
>> requisição HTTP foi enviada, aguardando resposta... 200 OKTamanho: 95693 
>> (93K) [application/x-gzip]Salvando em: 
>> “/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages/RNetCDF_1.8-2.tar.gz”
>>  0K .. .. .. .. .. 53% 68,7K 1s
>> 50K .. .. .. .. ...   100% 50,2K=1,6s
>> 2016-10-11 17:49:54 (58,7 KB/s) - 
>> “/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages/RNetCDF_1.8-2.tar.gz” salvo 
>> [95693/95693]
>> * installing *source* package ‘RNetCDF’ ...** package ‘RNetCDF’ successfully 
>> unpacked and MD5 sums checkedchecking for nc-config... yes
>> checking for gcc... gcc -std=gnu99
>> checking whether the C compiler works... yes
>> checking for C compiler default output file name... a.out
>> checking for suffix of executables...
>> checking whether we are cross compiling... no
>> checking for suffix of object files... o
>> checking whether we are using the GNU C compiler... yes
>> checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
>> checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
>> checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
>> checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
>> checking for egrep... /bin/grep -E
>> checking for ANSI C header files... yes
>> checking for sys/types.h... yes
>> checking for sys/stat.h... yes
>> checking for stdlib.h... yes
>> checking for string.h... yes
>> checking for memory.h... yes
>> checking for strings.h... yes
>> checking for inttypes.h... yes
>> checking for stdint.h... yes
>> checking for unistd.h... yes
>> checking netcdf linker flags... -L/usr/lib -lnetcdf
>> checking netcdf pre-processor and compiler flags... -I/usr/include -DgFortran
>> checking for library containing XML_StopParser... no
>> checking for library containing utFree... no
>> checking for library containing utScan... noconfigure: error: "unable to use 
>> udunits2 or udunits"ERROR: configuration failed for package ‘RNetCDF’
>> * removing ‘/home/notemaster/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/RNetCDF’Warning 
>> in install.packages :
>>   installation of package ‘RNetCDF’ had non-zero exit status
>>
>> The downloaded source packages are in
>>  ‘/tmp/Rtmpbh1Jqr/downloaded_packages’> library(RNetCDF)Erro em 
>> library(RNetCDF) : there is no package called ‘RNetCDF’
>>
>>
>> 
>>
>>
>> Tentei usar o pacote netcdf, mas não consegui devido ao pacote ter sido
>> descontinuado. Espero que alguém possa me ajudar, pois sou novo no uso de
>> netcdf no R.
>>
>> Abraços a todos.
>>
>>
>> Paulo Henrique de A. S. Pimenta.
>>
>> Graduando em Meteorologia (Bacharelado) - IAG/USP.
>> Fone: +5511981318435.
>>
>> ___
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>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>
> --
> ###
> ##  Jônatan Dupont Tatsch
> ##  Professor do Departamento de Física
> ##  Centro de Ciências Exatas e Naturais (CCNE)
> ##  Universidade Federal de Santa Maria - UFSM
> ##  Faixa de Camobi, Prédio 13 - Campus UFSM - Santa Maria, RS, Brasil -
> 97105-900
> ##  Telefone: +55(55)33012083
> ##  www.ufsm.br/meteorologia
> ###
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Re: [R-br] Extração de dados climáticos

2016-10-10 Por tôpico Tito Conte via R-br
Ana,
Que tal você usar o pacote netcdf? Ele é muito mais adequado para isso que
você deseja fazer (além de ser mais simples).
Segue o manual (é bem simples de fazer a extraçao de um ponto)
https://cran.r-project.org/web/packages/RNetCDF/RNetCDF.pdf






Tito Conte


Em 9 de outubro de 2016 20:09, Mauro Sznelwar via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Poderia enviar o arquivo correspondente para poder rodar?
>
>
> Prezados colegas, bom dia!
>
>
>
> Então, é o seguinte, no site http://berkeleyearth.org/ eu tenho dados de
> temperatura média de toda a terra. Eu preciso extrair de acordo com os meus
> pontos geográficos, a temperatura média anual para cada ponto. Só que eu
> tenho os específicos que eu preciso. Comecei o script de forma que eu
> pudesse extrair para um ponto específico e para todos os anos, para depois
> arrumar o script para fazer para todos os meus pontos e anos de interesse.
>
> Segue o script utilizado!
>
> library(raster)
>
> b <- brick("D:/Documentos/Desktop/analises_cap2/dados_climaticos/
> precipt.nc", varname <- "precip")
> print(b)
> b
>
> idx <- getZ(b)
> coords <- matrix(c(-55, -10), ncol = 2)
> vals <- extract(b, coords, df = T)
> df <- data.frame(idx, t(vals)[-1,])
>
> rownames(df) <- NULL
> names(df) <- c('date','value')
> head(df)
>
> Seguindo o script no local onde deveria apresentar as variáveis
> extraídas , aparece NA. Alguém já fez este tipo de extração? Peço ajuda.
>
> Desde já, muito obrigada.
>
> Ana Paula
>
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Re: [R-br] "alternativa não-paramétrica" para o teste de Dunnett

2016-10-03 Por tôpico Tito Conte via R-br
Achei isso:

"I'm pretty sure Dunnett's Test is for parametric data only. You can use
Mann Whitney follow up tests and just divide alpha by how many follow ups
you need to run to take a conservative approach."

Tito Conte


2016-10-03 13:24 GMT-03:00 Luiz Leal via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>:

> Boa tarde a todos.
> Alguém sabe se existe uma "alternativa não-paramétrica" para o teste de
> Dunnett?
> Desde já agradeço
> Luiz
>
> ...
> *Dunnett's test* is a multiple comparison
> <https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_comparisons> procedure to compare
> each of a number of treatments with a single control.
> ...
>
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Re: [R-br] Processamento paralelo para um modelo de treinamento

2016-10-03 Por tôpico Tito Conte via R-br
Ele está rodando paralelo? Você verificou?

Se unix use o comando top e aperte 1
Se windows abra o gerenciador de tarefas e verifique os núcleos de trabalho.

Aproveite para ver se é a CPU do seu PC o problema. Pode ser a memória ou a
escrita do disco.

Uma solução de baixissimo nível, mas que funciona. é você quebrar o código.
Em partes e rodar vários Rs, cada um com uma etapa, gerar uns arquivos
intermediários e depois concatena tudo.


Tito Conte


Em 2 de outubro de 2016 08:41, Fernando Gama via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Pessoal,
>
> Estou tentando treinar um modelo com 192 atributos e meu objetivo é, no
> pós-treinamento, identificar os atributos mais importantes. (seleção de
> features).
>
> A questão é que estou tendo problemas para treinar o modelo porque o
> processamento é extremamente lento. Pesquisei sobre o parallel e o
> doParallel e coloquei no meu código mas aparentemente não obtive resultados
> segue um trecho do código:
>
> library(caret)
> library(doParallel)
>
> myControl <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats = 3,
> allowParallel = TRUE)
>
> t<-proc.time()
>
> cl <- makeCluster(detectCores())
>
> registerDoParallel(cl)
>
> model <- train(GENRE~., data=dtset_genres, method="lvq", preProcess =
> "scale", trControl = myControl)
>
> stopCluster(cl)
>
> proc.time()-t
>
>
> ​Alguma sugestão?​
>
> --
> Att,
>
> | Fernando Gama da Mata |
> | Database Specialist | Master's Degree UFPA |
>
> | Contacts: +55 91 99150 0365 | f.fabiogam...@gmail.com | Social
> Networks: [ <https://www.facebook.com/fernando.gama.13>][
> <https://plus.google.com/+FernandoGama13>][
> <https://www.linkedin.com/in/fernandogama>] |
>
>
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Título de gráficos em mais de uma linha

2016-09-30 Por tôpico Tito Conte via R-br
use strwrap
ou conte caracteres e insira \n no espaço anterior (isso depende do tamanho
do seu gráfico)
Isso depende do que você precisa

Tito Conte


Em 30 de setembro de 2016 12:29, Guilherme Biz via R-br <
r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

> Boa tarde.
> Estou tentando fazer um gráfico com título extenso e gostaria que fosse
> dividido em duas ou mais linhas de forma automática, sem ser pelo comando
> \n.
> Ex:
>
> a=rnorm(100)
> b=rnorm(100)
> plot(a,b,main="Este título é muito grande para ficar só em uma linha e
> gostaria de dividi-lo em duas ou mais linhas de forma automática")
>
> Sei que usando "\n" eu passo para a linha de baixo e no Rstudio se eu
> escrever o título em duas linhas também ocorre isso, mas preciso de forma
> automática, pois são muitos gráficos e estou fazendo de forma iterativa.
>
> Alguém tem uma solução?
>
> Agradeço desde já.
> Att,
>
> Guilherme Biz
>
>
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> código mínimo reproduzível.
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m�nimo reproduz�vel.

Re: [R-br] Fwd: Erro

2015-08-06 Por tôpico Tito Conte
Pedro, você esta rodando em linux ou windows?

Tito Conte


Em 29 de julho de 2015 09:27, Pedro Mestre pmes...@pesca.sp.gov.br
escreveu:

 Prezad@s, boa tarde.
 Estou tentando atualizar o R pelo installr seguindo os passos
 disponíveis no link (
 http://www.r-bloggers.com/a-step-by-step-screenshots-tutorial-for-upgrading-r-on-windows/),
 porém, está dando o seguinte erro:

 Erro em file(con, r) : não é possível abrir a conexão

 As linhas de comando que executei (inclusive com as explicações) foram
 essas:

 # installing/loading the latest installr package:
 install.packages(installr); library(installr) # install+load installr

 updateR() # updating R.


 Alguém sabe o que pode ser?


 PS. Desculpem se a dúvida é básica, mas não domino linguagem de programação.
 Abraços e obrigado,



 PS. Poderiam me confirmar o recebimento da mensagem?
 Obrigado de novo.
 --
 Pedro Mestre Ferreira Alves
 Assistente Técnico de Pesquisa
 Instituto de Pesca
 Av. Bartolomeu de Gusmão, 192
 Ponta da Praia - Santos - SP
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Re: [R-br] Fwd: Erro

2015-08-06 Por tôpico Tito Conte
E em qual step você esta tendo este erro?

Tito Conte


Em 6 de agosto de 2015 10:55, Tito Conte tito.co...@gmail.com escreveu:

 Pedro, você esta rodando em linux ou windows?

 Tito Conte


 Em 29 de julho de 2015 09:27, Pedro Mestre pmes...@pesca.sp.gov.br
 escreveu:

 Prezad@s, boa tarde.
 Estou tentando atualizar o R pelo installr seguindo os passos
 disponíveis no link (
 http://www.r-bloggers.com/a-step-by-step-screenshots-tutorial-for-upgrading-r-on-windows/),
 porém, está dando o seguinte erro:

 Erro em file(con, r) : não é possível abrir a conexão

 As linhas de comando que executei (inclusive com as explicações) foram
 essas:

 # installing/loading the latest installr package:
 install.packages(installr); library(installr) # install+load installr

 updateR() # updating R.


 Alguém sabe o que pode ser?


 PS. Desculpem se a dúvida é básica, mas não domino linguagem de programação.
 Abraços e obrigado,



 PS. Poderiam me confirmar o recebimento da mensagem?
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Re: [R-br] MCA gráfico

2015-02-26 Por tôpico Tito Conte
Edson, da um help(par) lá vai ter boa parte das coisas que você precisa
E sim, aumente os limites do eixo

Tito Conte


Em 26 de fevereiro de 2015 11:41, Edson Lira edinhoes...@yahoo.com.br
escreveu:

 Bom dia caros amigos. Novamente retomo um problema que ainda não consegui
 resolver.

 Download MCA COMUNICACAO.docx http://www.datafilehost.com/d/8d884324 #
 nesse link  tem o script o gráfico e as dúvidas


 [image: image] http://www.datafilehost.com/d/8d884324





 Download MCA COMUNICACAO.docx http://www.datafilehost.com/d/8d884324
 Download MCA COMUNICACAO.docx free. File hosted free by DataFileHost.
 Visualizar em www.datafileho... http://www.datafilehost.com/d/8d884324
 Visualizado por Yahoo


  Download mj1.csv http://www.datafilehost.com/d/71e81372 # os dados


 [image: image] http://www.datafilehost.com/d/71e81372





 Download mj1.csv http://www.datafilehost.com/d/71e81372
 Download mj1.csv free. File hosted free by DataFileHost.
 Visualizar em www.datafileho... http://www.datafilehost.com/d/71e81372
 Visualizado por Yahoo


 No geral, necessito melhorar a aparência e a escala do gráfico e ainda não
 consegui.

 [  ]'s.
 Edson Lira
 Estatístico
 Manaus-Amazonas

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Re: [R-br] Extrair coordenadas de um raster dada uma condição

2015-02-17 Por tôpico Tito Conte
Talvez ajude

valores=t(matrix(r$layer[,],10,10))








Tito Conte


Em 1 de fevereiro de 2015 23:48, ASANTOS alexandresanto...@yahoo.com.br
escreveu:


 Caros Listeiros,

   Fiz a seleção da coordenada dos pixels (p.cen) em um raster
 que continham pontos de interesse (pontos) no CRM abaixo, gostaria de
 saber como impor uma condição para selecionar as coordenadas dos pixels
 que não contém nenhum ponto. Tentei criar um novo objeto com todas as
 coordenadas no raster e remover as coordenadas p.cen sem sucesso, alguém
 poderia me ajudar? Obrigado,

 ### code r
 require(raster); require(sp)

 ## Criando um raster
 r - raster(nc=10, nr=10)
 r - setValues(r, round(runif(ncell(r))* 255))

 ##Pontos selecionados
 x - c(44.25,33.06,63.22,71.35)
 y - c(22.00,81.90,15.18,71.03)
 pontos - SpatialPoints(cbind(x,y))
 cells - cellFromXY(r, pontos); cells
 coordinates(r)[cells,]
 p.cen - xyFromCell(r, cells); p.cen
 plot(r)
 points(pontos, col=red)
 points(p.cen)
 values - extract(r,p.cen) ##Extrai as coordendas
 dados-cbind(p.cen,cells,values)
 dados
 ### /code

 --
 ==
 Alexandre dos Santos
 Proteção Florestal
 IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
 Campus Cáceres
 Caixa Postal 244
 Avenida dos Ramires, s/n
 Bairro: Distrito Industrial
 Cáceres - MT  CEP: 78.200-000
 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM)   (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
 e-mails:alexandresanto...@yahoo.com.br
 alexandre.san...@cas.ifmt.edu.br
 Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680
 ==




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 http://www.avast.com

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Re: [R-br] Extração de coordenadas e tempo em múltiplas imagens

2013-12-05 Por tôpico Tito Conte
Alexandre,

Fiz isso para imagens de satélite

O procedimento que usei para criar o laço foi com um array de 3 dimensões,
onde as duas primeiras eram o x e o y e coloquei um matriz a traz da
outra como se fosse construindo um cubo então tinha um objeto com x,y e t .
O registro do nome de cada figura, eu armazenei em um vetor

Pra ser sincero, não entendi muito bem sua rotina pois não domino algumas
das funções que vc usou mesmo assim mando um exemplo do que fiz, que espero
que te ajude.

# carregar os arquivos de interesse no diretorio
my.dir = dir(/home/tito/tcc/tau,pattern=.nc,full.names=T)

# criar a variável nula do array para não dar problema
TAU =NULL

# loop para ler cada um dos arquivos
for(arquivo in my.dir){

# carregar o arquivo pelo nome
nc = open.ncdf(arquivo)

# extrair variavel de tau em x
taux = get.var.ncdf(arquivo,x)

# armazenar a variavel em um array segundo as dimenções e o numero da
figura e de acordo com o nome do arquivo
TAU =
array(c(TAU,taux),dim=c(nrow(taux),ncol(tauy),which(my.dir==arquivo

}

Espero ter ajudado











Tito Conte



2013/12/4 ASANTOS alexandresanto...@yahoo.com.br

 Caros Membros,

 Estou precisando de ajuda para criar um laço para extrair as
 coordenadas e o tempo (no nome do arquivo) em múltiplas figuras. No meu
 exemplo abaixo e usando apenas a figura 1, tenho uma regiões de pixels de
 interesse em branco e o nome da figura Fig1-0_00_00.png, preciso das
 coordenadas x e y das regiões em branco (Valor digital = 0), representado
 pelo objeto fig.data.pix e juntei ao tempo que é 0:00:00, pois o nome da
 Figura é 0_00_00. Conforme CRM abaixo, fazendo figura por figura esta OK,
 mas gostaria de fazer um laço para extrair essas informações das três
 figuras abaixo e armazená-las em um único objeto, alguém teria alguma
 sugestão?



 #---
 
 # Rotina para extração de coordenadas e tempo em imagens
 #---
 

 # Abertura das imagens

 require(RCurl)

 #Figura 1 
 --
 get.dropbox - function(file, token) {
  require(RCurl, quietly=TRUE)
  bin - getBinaryURL(paste0(https://www.dropbox.com/s/
 8b99gn9ve1yo7is/Fig1-0_00_00.png, token, /, file),
  ssl.verifypeer = FALSE)
  con - file(file, open = wb)
  writeBin(bin, con)
  close(con)
  message(noquote(paste(file, read into, getwd(
 }
 #
 get.dropbox(Fig1-0_00_00.png, Fig1-0_00_00.png)

 #Figura 2 
 --
 get.dropbox - function(file, token) {
  require(RCurl, quietly=TRUE)
  bin - getBinaryURL(paste0(https://www.dropbox.com/s/
 8b99gn9ve1yo7is/Fig2-0_20_00.png, token, /, file),
  ssl.verifypeer = FALSE)
  con - file(file, open = wb)
  writeBin(bin, con)
  close(con)
  message(noquote(paste(file, read into, getwd(
 }
 #
 get.dropbox(Fig2-0_20_00.png, Fig2-0_20_00.png)

 #Figura 3 
 -
 get.dropbox - function(file, token) {
  require(RCurl, quietly=TRUE)
  bin - getBinaryURL(paste0(https://www.dropbox.com/s/
 bo6gbt3ca6xwxm0/Fig3-0_40_00.png, token, /, file),
  ssl.verifypeer = FALSE)
  con - file(file, open = wb)
  writeBin(bin, con)
  close(con)
  message(noquote(paste(file, read into, getwd(
 }
 #
 get.dropbox(Fig3-0_40_00.png, Fig3-0_40_00.png)

 # Extraido as coordenadas dos pixels para figura 1
 -

 require(raster)
 r - raster(Fig1-0_00_00.png)
 image(r)
 r2-as.data.frame(r)

 # Cria as coordenadas --
 
 grid0 - expand.grid(x=seq(0,length.out=r@nrows),
  y=seq(0,length.out=r@ncols))

 # Coordenadas + valor dos pixels

 fig.data-cbind(grid0,r2)

 # Região de interesse - Número digital = 0

 fig.data.pix-fig.data[fig.data[,3]==0,]

 # Extrai o tempo do nome do arquivo
 tempo2-r@data@names
 tempo1-gsub(Fig1., , tempo2)
 tempo-gsub(_, :, tempo1)

 # Cria o arquivo final

 dados-cbind(fig.data.pix[,1:2],rep(tempo))

 head(dados)

 #---
 

 Obrigado,

 --
 ==
 Alexandre dos Santos
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 alexandre.san...@cas.ifmt.edu.br
 Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680

Re: [R-br] Gráfico de pontos

2013-12-05 Por tôpico Tito Conte
O que exatamente você quer na legenda? uma barra de cores degrade?

Tito Conte



2013/12/4 Tiago Souza Marçal tiagosouzamar...@hotmail.com

 Nos envie um CMR para que possamos tentar ajudá-lo.

 Att.

 Tiago.

 #

 Tiago de Souza Marçal - Graduando em Agronomia pelo CCA-UFES

 Bolsista de Iniciação Científica da área de Genética e Melhoramento de
 Plantas

 #


 --
 Date: Wed, 4 Dec 2013 08:12:29 -0200
 From: alxc...@gmail.com
 To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
 Subject: [R-br] Gráfico de pontos


 Ao grupo r-br,
 por favor, eu criei um gráfico de pontos onde o tamanho e cor de cada um é
 baseado no quartil ao qual ele pertence, o trecho do código está abaixo.
 Entretanto estou com dificuldades de criar a legenda. Alguém poderia me
 orientar?


 *attach(dadosT1)*
 *par(mfrow=c(1,1))*
 *ramp-colorRamp(c(yellow, red))*
 *points(dadosT1,xlab=Coordenada X (coluna),*
 *ylab=Coordenada Y (linha),*
 *pt.divide=quartiles, col=rgb(ramp(seq(0,1, length=5)), max=255))*



 Desde já agradeço,
 Alex Santos



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Re: [R-br] Arquivos hdf

2013-08-28 Por tôpico Tito Conte
Thiago, sua solução foi MUITO BOA! OBRIGADO!

Tito Conte



2013/8/13 Eder Comunello ecomu...@gmail.com

 Caro Tito, bom dia!

 Apenas cogitando... Os arquivos podem ser HDF4 e não HDF5. Não sei se foi
 corrigido, mas no passado o pacote hdf5() não abria arquivos HDF4
 diretamente e era necessário convertê-los primeiro.

 No endereço que segue abaixo tem inclusive o link pra um conversor:

 [R] hdf files
 https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2010-January/225901.html


 --
 Éder Comunello e comunello.e...@gmail.comcomu...@gmail.com
 Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]

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Re: [R-br] Arquivos hdf

2013-08-12 Por tôpico Tito Conte
Benilton, o hdf5 não abre o arquivo

Thiago os arquivos são do seawifs, ao que parece não tem que processar a
imagem, o problema é abri-los mesmo

Tito Conte
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[R-br] Arquivos hdf

2013-08-06 Por tôpico Tito Conte
Caros, estou processadno arquivos de imagens de satélite e muitos deles vem
em formto .hdf,

alguns de vocês faz ideia de como abri-los (o pacote hdf5, foi testado
exaustivamente e não tive bons resultados)

Tito Conte
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Re: [R-br] Coordenadas e distâncias

2013-07-11 Por tôpico Tito Conte
utilize um laço,
o comando for ou while  resolvem, dependendo do que você deseje fazer

Tito Conte



2013/7/8 Roberto Guevara robertoguevara@gmail.com

 Olá pessoal do R-br.

 Meus dados consistem basicamente em coordenadas e o horário em que
 cada ponto foi obtido, como exemplificado a seguir:

 obs  dia  minxy
   11400  425 475
   21410  425 425
   31 420 475 325
   41 430 525 325
   51435  525 275
   61443  525 275

 obs se refere a cada unidade de amostra, dia a cada dia de coleta (um
 total de 73), min é o horário em unidades de minutos e x e y cada
 elemento do ponto cartesiano.

 O que preciso obter desses dados é a distribuição de distâncias
 euclidianas entre um ponto escolhido aleatoriamente e todos os pontos
 seguintes de um mesmo dia. Ou seja, preciso escolher aleatoriamente um
 ponto por dia, calcular, para todos os dias, a euclidiana entre este
 ponto e todos os pontos posteriores do mesmo dia e relacionar a
 distância espacial com a diferença de tempo entre os pontos e o dia em
 que cada distância está associada.

 Eu já elaborei um código pra isso. Caso tenham sugestões para melhorar
 o código, ficarei agradecido. Porém, não consigo passar para uma
 próxima etapa. Como poderia fazer para repetir esse procedimento o
 número de vezes que fosse necessário? Por exemplo, existem milhares de
 combinações de pontos escolhidos aleatoriamente ao longo dos 73 dias.
 Eu gostaria de repetir o procedimento 1000 vezes para ter uma ideia da
 variação de distribuição de distâncias que posso obter em decorrência
 da escolha aleatória de um ponto de origem por dia.

 Código já elaborado:

 arquivo-read.table(arquivo.txt,head=T)

 fixo-numeric() #vetor com origens de cada dia
 ult-numeric()  #vetor com últimos pontos de cada dia
 xy-list()  #lista para armazenar a parte dos pontos de cada dia
 delimitadas por fixo e ult
 hor-list() #lista para armazenar a parte dos horarios de cada dia
 delimitadas por fixo e ult
 distancias-list()#distancias euclidianas
 tempo-list()#diferença de tempo entre os pontos
 dia-list()#dia de coleta
 for (i in 1:max(unique(arquivo$dia))){  #repetindo até o total de dias
 fixo[i]-sample(arquivo$obs[arquivo$dia==i],1)#sorteio ponto de
 origem
 ult[i]-max(arquivo$obs[arquivo$dia==i])#armazenando último ponto
 de cada dia
 xy[[i]]-arquivo[fixo[i]:ult[i],4:5]#armazenando parte dos pontos
 de cada dia
 hor[[i]]-arquivo[fixo[i]:ult[i],6]#armazenando parte dos horários
 de cada dia
 distancias[[i]]-dist(xy[[i]])[1:nrow(xy[[i]])-1]#somente as
 distâncias em relação ao primeiro ponto interessam
 tempo[[i]]-dist(horarios[[i]])[1:length(horarios[[i]])-1]#somente
 diferenças ao primeiro ponto
 dia[[i]]-rep(i,length(arquivo$dia[fixo[i]:ult[i]])-1)$cada dia de
 coleta
 }

 distancias-unlist(distancias)
 tempo-unlist(tempo)
 dia-unlist(dia)

 dtd-data.frame(distancias,tempo,dia)

 Este data.frame seria como uma unidade de amostra das milhares de
 distribuições que são possíveis de obter. Como otimizar para que
 qualquer número desejado não seja dispendioso de obter?

 Obrigado pela atenção

 --
 Roberto Guevara Ferreira Lima

 Biólogo - CRBio 6ª Região: 73146/06-D
 Mestre em Zoologia
 Laboratório de Ecologia e Zoologia de Vertebrados
 Instituto de Ciências Biológicas
 Universidade Federal do Pará
 Rua Augusto Corrêa, nº 01 - Bairro: Guamá. CEP: 66075-110
 Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/7363382159007600
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Re: [R-br] #plotar nome mês/ano no eixo x

2013-06-24 Por tôpico Tito Conte
De uma olhada no pacote zoo

Tito Conte



On Mon, Jun 24, 2013 at 3:05 PM, walmes . walmeszevi...@gmail.com wrote:

 Uma forma de formatar é usar a função axis.POSIX() veja,


 #--
 # gráficos de séries no tempo

 met - read.table(http://www.leg.ufpr.br/~walmes/data/metereologia.txt;,
   header=TRUE, sep=\t, stringsAsFactors=FALSE)
 str(met)
 names(met) - tolower(names(met)) # passa os nomes para minúsculas


 #--
 # conversão com a função as.POSIX*

 met$data - as.POSIXct(met$data, format=%Y-%m-%d)
 plot(temp~data, data=met, type=l, xaxt=n)
 axis.POSIXct(1, at=seq(as.POSIXct(2009-10-01),
 as.POSIXct(2011-10-01), by=month), format=%B,
 col=2)

 plot(temp~data, data=met, type=l, xaxt=n)
 axis.POSIXct(1, at=seq(as.POSIXct(2009-10-01),
 as.POSIXct(2011-10-01), by=month), format=%m/%y,
 col=2)


 #--
 # duas séries em um mesmo gráfico

 par(mar=c(5.1,4.1,4.1,4.1))
 plot(temp~data, data=met, type=l, xaxt=n)
 par(new=TRUE)
 plot(urel~data, data=met, type=l, xaxt=n, yaxt=n, ylab=NA, col=2)
 axis(4, col=2)
 mtext(urel, side=4, line=3)
 axis.POSIXct(1, at=seq(as.POSIXct(2009-10-01),
 as.POSIXct(2011-10-01), by=month), format=%m/%y)

 À disposição.
 Walmes.

 ==
 Walmes Marques Zeviani
 LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
 Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
 fone: (+55) 41 3361 3573
 VoIP: (3361 3600) 1053 1173
 e-mail: wal...@ufpr.br
 skype: walmeszeviani
 twitter: @walmeszeviani
 homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
 linux user number: 531218
 ==


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Re: [R-br] arquivo netcdf

2013-06-13 Por tôpico Tito Conte
Heloíse verifique os seus pacotes do windows para netcdf

Tito Conte



2013/6/13 Thiago V. dos Santos thi_vel...@yahoo.com.br

 Heloíse,

 O pacote ncdf é antigo e deve ser descontinuado em breve. Instale o ncdf4
 no lugar. Os binários para windows não existem no CRAN, mas estão
 disponíveis no site do autor: http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/. Esse
 pacote deve suportar o protocolo opendap.

 Caso ele não suporte, uma solução temporária é baixar o arquivo para
 testar localmente 
 (download.file('url_to_file'http://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/transition.zip',%C2%A0'transition.zip'
 )), e em seguida escrever para os autores dos pacotes (incluindo o Robert
 Hijmans do raster) perguntando se eles têm algum plano de incluir o opendap
 em um futuro próximo.

 Alternativamente, existe uma opção mais complicada de compilar o pacote
 gdal com suporte a opendap. Porém, não sei se isso pode ser feito em
 Windows.

 Saudações,
 --
 Thiago V. dos Santos
 PhD student
 Land and Atmospheric Science
 University of Minnesota

 http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
 Phone: (612) 323 9898
   --
  *From:* Heloíse Pavanato helopavan...@gmail.com
 *To:* r-br@listas.c3sl.ufpr.br
 *Sent:* Wednesday, June 12, 2013 9:45 PM
 *Subject:* [R-br] arquivo netcdf

 Olá,
 Tenho tentado abrir um arquivo netcdf mas sem êxito.
 Tentei com o pacote ncdf para abrir um arquivo através de um link OPeNDAP
 dataset - open.ncdf('
 http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967
 ')
 e através do RNetCDF
 dataset - open.nc('
 http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000a1c5967
 ')
 e sempre dá o Error in open.ncdf trying to open file.

 Estou trabalhando em ambiente Windows. Isso seria um problema?
 Alguém tem alguma dica para me dar?

 Grata,
 Heloise

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[R-br] média entre pontos de uma mesma matrix

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
Bom dia,

Preciso calcular a média de pontos entre matrizes que possuem NA i
gnorando-os

exemplo: média entre estas matrizes

[,1] [,2] [,3]
[1,]369
[2,]47   10
[3,]58   11


 [,1] [,2] [,3]
[1,]  1.5  3.0  4.5
[2,]  2.0  3.5  5.0
[3,]  2.5  4.0  5.5


 [,1] [,2] [,3]
[1,]22   NA
[2,]222
[3,]22   NA

e obter um resultado que fosse uma matriz do mesmo tamnho com a média de
cada ponto ignoradno NAs

alguém pode me ajudar com essa?

Tito Conte
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Re: [R-br] média entre pontos de uma mesma matrix

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
Benilton, como criar um array 3d (nunca fiz isso)?

Tito Conte



2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 Crie um array 3d e use rowMeans com o argumento na.rm=TRUE
 On 12 Jun 2013 11:14, Tito Conte tito.co...@gmail.com wrote:

  Bom dia,

 Preciso calcular a média de pontos entre matrizes que possuem NA i
 gnorando-os

 exemplo: média entre estas matrizes

 [,1] [,2] [,3]
 [1,]369
 [2,]47   10
 [3,]58   11


  [,1] [,2] [,3]
 [1,]  1.5  3.0  4.5
 [2,]  2.0  3.5  5.0
 [3,]  2.5  4.0  5.5


  [,1] [,2] [,3]
 [1,]22   NA
 [2,]222
 [3,]22   NA

 e obter um resultado que fosse uma matriz do mesmo tamnho com a média de
 cada ponto ignoradno NAs

 alguém pode me ajudar com essa?

 Tito Conte


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Re: [R-br] Como ordenar os elementos das linhas de uma matriz de dados?

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
apply(suamatrix,1,sort)

Tito Conte



2013/6/12 Gilenio Borges Fernandes gile...@ufba.br

 Prezados(as)

 Como ordenar os elementos das linhas de uma matriz de dados?
 Exemplo, 10 linhas e 7 colunas:
  C1   C2   C3   C4   C5   C6   C7
 L1   28   33   36   69   35   45   62
 L2   21   28   33   36   16   22   59
 L3   23   37   40   61   22   26   30
 L4   20   61   74   78   15   22   62
 L5   13   51   61   637   41   45
 L6   13   20   21   424   41   62
 L7   13   21   28   4368   12
 L8   32   42   43   44   45   48   50
 L95   20   69   741   50   52
 L10  20   36   51   78   12   49   79

 Grato
  Gilenio

 --
 Gilenio Borges Fernandes
 Professor Associado III
 Universidade Federal da Bahia
 Instituto de Matemática
 Departamento de Estatística
 Av. Adhemar de Barros, s/n – Ondina.
 40.170-110 - Salvador - BA, Brasil
 Tel.: (071)3283-6280/6336  Fax:  (071)3283-6276
 URL: http://lattes.cnpq.br/6764860618464860

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Re: [R-br] média entre pontos de uma mesma matrix

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
ok

Tito Conte



2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 o comando eh array(), use o argumento dim= apropriadamente... qdo
 houver um exemplo reproduzivel, nao me incomodarei em dar as duas
 linhas de comando q vc procura.

 Em 12 de junho de 2013 11:36, Tito Conte tito.co...@gmail.com escreveu:
  Benilton, como criar um array 3d (nunca fiz isso)?
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  Crie um array 3d e use rowMeans com o argumento na.rm=TRUE
 
  On 12 Jun 2013 11:14, Tito Conte tito.co...@gmail.com wrote:
 
  Bom dia,
 
  Preciso calcular a média de pontos entre matrizes que possuem NA i
  gnorando-os
 
  exemplo: média entre estas matrizes
 
  [,1] [,2] [,3]
  [1,]369
  [2,]47   10
  [3,]58   11
 
 
   [,1] [,2] [,3]
  [1,]  1.5  3.0  4.5
  [2,]  2.0  3.5  5.0
  [3,]  2.5  4.0  5.5
 
 
   [,1] [,2] [,3]
  [1,]22   NA
  [2,]222
  [3,]22   NA
 
  e obter um resultado que fosse uma matriz do mesmo tamnho com a média
 de
  cada ponto ignoradno NAs
 
  alguém pode me ajudar com essa?
 
  Tito Conte
 
 
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  código mínimo reproduzível.
 
 
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  código mínimo reproduzível.
 
 
 
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 código
  mínimo reproduzível.
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mínimo reproduzível.

Re: [R-br] média entre pontos de uma mesma matrix

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
usei um
a=cbind(matrix1,matrix2,matrix3)
dim(a)=c(3,3,3)
rowMeans(a,dims=2)

Muito obrigado pessoal

Tito Conte



2013/6/12 andre...@bol.com.br

 Mais simples do que isso, impossível, rs
 Benilton resumiu o que tinha feito em uma única linha de comando.

 Então Benilton, o atributo dims=2 na função rowMeans, foi pegar cada
 elemento de cada matrix em igual posição e fazer a média? Pelo resultado eu
 vi que sim, agora, é dificil de enxergar isso num plano tridimensional.

 No caso para dim=1 ou 3, o que se teria como resultado?

 *Att.*
 *André*

 --
 Em 12/06/2013 14:55, *Benilton Carvalho  beniltoncarva...@gmail.com 
 *escreveu:

 mais simples que isso, dado seu array 3d 'M',

 M rowMeans(M, dims=2, na.rm=T)


 (bem mais simples qdo ha' um exemplo q pode ser reproduzido)

 Em 12 de junho de 2013 14:51, andre...@bol.com.br escreveu:
  Olá Tito, acredito que seja essa solução a qual procuras:
 
  # Matriz Tridimensional:
 
  M 
  A  nM  nE 
  S1  S2 

  for (i in 1:(nM*nE))
  {
  A[i]  }
 
  Result  Result

 
  Espero ter ajudado colega.
 
  Att.
  André BVS
 
  
  Em 12/06/2013 14:31, Tito Conte  tito.co...@gmail.com  escreveu:
  ok
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  o comando eh array(), use o argumento dim= apropriadamente... qdo
  houver um exemplo reproduzivel, nao me incomodarei em dar as duas
  linhas de comando q vc procura.
 
  Em 12 de junho de 2013 11:36, Tito Conte tito.co...@gmail.com
 escreveu:
   Benilton, como criar um array 3d (nunca fiz isso)?
  
   Tito Conte
  
  
  
   2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
  
   Crie um array 3d e use rowMeans com o argumento na.rm=TRUE
  
   On 12 Jun 2013 11:14, Tito Conte tito.co...@gmail.com wrote:
  
   Bom dia,
  
   Preciso calcular a m édia de pontos entre matrizes que possuem NA i

   gnorando-os
  
   exemplo: média entre estas matrizes
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 3 6 9
   [2,] 4 7 10
   gt; [3,] 5 8 11
 
  
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 1.5 3.0 4.5
   [2,] 2.0 3.5 5.0
   [3,] 2.5 4.0 5.5
  
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 2 2 NA
   [2,] 2 2 2
   [3,] 2 2 NA
  
   e obter um resultado que fosse uma matriz do mesmo tamnho com a
 média
   de
 gt ;  cada ponto ignoradno NAs

  
   alguém pode me ajudar com essa?
  
   Tito Conte
  
  
   ___
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   Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
 forneça
   código mínimo reproduzível.
  
  
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   Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
   código mínimo reproduzível.
  g t;
 
  
  
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   código
   mà ­nimo reproduzível.

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 código
  mínimo reproduzív el.
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mínimo reproduzível.

Re: [R-br] média entre pontos de uma mesma matrix

2013-06-12 Por tôpico Tito Conte
Isso pq estava dentro de um loop que cria cada matriz

Tito Conte



2013/6/12 Tito Conte tito.co...@gmail.com

 usei um
 a=cbind(matrix1,matrix2,matrix3)
 dim(a)=c(3,3,3)
 rowMeans(a,dims=2)

 Muito obrigado pessoal

 Tito Conte



 2013/6/12 andre...@bol.com.br

 Mais simples do que isso, impossível, rs
 Benilton resumiu o que tinha feito em uma única linha de comando.

 Então Benilton, o atributo dims=2 na função rowMeans, foi pegar cada
 elemento de cada matrix em igual posição e fazer a média? Pelo resultado eu
 vi que sim, agora, é dificil de enxergar isso num plano tridimensional.

 No caso para dim=1 ou 3, o que se teria como resultado?

 *Att.*
 *André*

 --
 Em 12/06/2013 14:55, *Benilton Carvalho  beniltoncarva...@gmail.com 
 *escreveu:

 mais simples que isso, dado seu array 3d 'M',

 M rowMeans(M, dims=2, na.rm=T)


 (bem mais simples qdo ha' um exemplo q pode ser reproduzido)

 Em 12 de junho de 2013 14:51, andre...@bol.com.br escreveu:
  Olá Tito, acredito que seja essa solução a qual procuras:
 
  # Matriz Tridimensional:
 
  M 
  A  nM  nE 
  S1  S2 

  for (i in 1:(nM*nE))
  {
  A[i]  }
 
  Result  Result

 
  Espero ter ajudado colega.
 
  Att.
  André BVS
 
  
  Em 12/06/2013 14:31, Tito Conte  tito.co...@gmail.com  escreveu:
  ok
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  o comando eh array(), use o argumento dim= apropriadamente... qdo
  houver um exemplo reproduzivel, nao me incomodarei em dar as duas
  linhas de comando q vc procura.
 
  Em 12 de junho de 2013 11:36, Tito Conte tito.co...@gmail.com
 escreveu:
   Benilton, como criar um array 3d (nunca fiz isso)?
  
   Tito Conte
  
  
  
   2013/6/12 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
  
   Crie um array 3d e use rowMeans com o argumento na.rm=TRUE
  
   On 12 Jun 2013 11:14, Tito Conte tito.co...@gmail.com wrote:
  
   Bom dia,
  
   Preciso calcular a m édia de pontos entre matrizes que possuem NA i

   gnorando-os
  
   exemplo: média entre estas matrizes
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 3 6 9
   [2,] 4 7 10
   gt; [3,] 5 8 11
 
  
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 1.5 3.0 4.5
   [2,] 2.0 3.5 5.0
   [3,] 2.5 4.0 5.5
  
  
   [,1] [,2] [,3]
   [1,] 2 2 NA
   [2,] 2 2 2
   [3,] 2 2 NA
  
   e obter um resultado que fosse uma matriz do mesmo tamnho com a
 média
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  g t;
 
  
  
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Re: [R-br] Coordenadas UTM para Lat Lon

2013-06-04 Por tôpico Tito Conte
Obrigado a todos!

Tito Conte



2013/6/4 Luciano F. Sgarbi luciano.f.sga...@gmail.com

 Veja se isso funciona:

 UTM.to.Lat_Long-function(coord){

b=6356752.3142
a=6378137
e=0.0818191909
eisq=0.0067394968
k0=0.9996
ei=(1-(1-e*e)^(1/2))/(1+(1-e*e)^(1/2))
C1=3*ei/2-27*ei^3/32
C2=21*ei^2/16-55*ei^4/32
C3=151*ei^3/96
C4=1097*ei^4/512
polo=coord[,1]
zone=coord[,2]
lon=coord[,3]
lat=coord[,4]
Corrected.Northing=ifelse(polo==N,lat,1000-lat)
East.Prime=50-lon
Arc.Length=lat/k0
mu=Arc.Length/(a*(1-e^2/4-3*e^4/64-5*e^6/256))
phl=mu+C1*sin(2*mu)+C2*sin(4*mu)+C3*sin(6*mu)+C4*sin(8*mu)
C=eisq*cos(phl)^2
T=tan(phl)^2
N=a/(1-(e*sin(phl))^2)^(1/2)
R=a*(1-e*e)/(1-(e*sin(phl))^2)^(3/2)
D=East.Prime/(N*k0)
F1=N*tan(phl)/R
F2=D*D/2
F3=(5+3*T+10*C-4*C*C-9*eisq)*D^4/24
F4=(61+90*T+298*C+45*T*T-252*eisq-3*C*C)*D^6/720
LF1=D
LF2=(1+2*T+C)*D^3/6
LF3=(5-2*C+28*T-3*C^2+8*eisq+24*T^2)*D^5/120
delta.lon=(LF1-LF2+LF3)/cos(phl)
zone.cm=6*zone-183
raw.lat=180*(phl-F1*(F2+F3+F4))/pi
LAT=ifelse(polo==N,raw.lat,-1*raw.lat)
LON=zone.cm-delta.lon*180/pi
lon.deg=as.integer(LON)
lon.min=abs(as.integer(60*(LON-lon.deg)))
lon.sec=3600*(abs(LON)-abs(lon.deg)-lon.min/60)
lat.deg=as.integer(LAT)
lat.min=abs(as.integer(60*(LAT-lat.deg)))
lat.sec=3600*(abs(LAT)-abs(lat.deg)-lat.min/60)

  df=data.frame(coord,LON,LAT,lon.deg,lon.min,lon.sec,lat.deg,lat.min,lat.sec)
return(df)
 }

 coord=data.frame(polo=sample(c(N,S),100,r=T),zone=sample(0:23,100,r=T),lon=sample(0:9,100,r=T),lat=sample
(0:9,100,r=T))

 UTM.to.Lat_Long(coord)



 Em 4 de junho de 2013 09:21, Elias Teixeira Krainski 
 eliaskrain...@yahoo.com.br escreveu:

 Vc precisa informar a projeção no formato Proj4 na função  project()

 On 03/06/13 19:08, Tito Conte wrote:

 Alguém poderia me explicar como faço a converção de utm para lat lon,

 estou tentando pelo rgdal, mas não consegui entender direito como
 funciona as funções de conversão


 Tito Conte


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 --

 *Luciano F. Sgarbi*
 *
 Mestre em Ecologia e Evolução
 Dep. Ecologia, Instituto de Ciências Biológicas I*
 *Universidade Federal de Goiás, campus II, Goiânia-GO, Brasil*

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Re: [R-br] teste de Jonckheere

2013-06-04 Por tôpico Tito Conte
google it teste Jonckheere r project

Tito Conte



2013/6/4 Cristina d...@ufscar.br

 **
  Olá pessoal!

 Gostaria de saber se alguém já usou, no R,  o teste de Jonckheere.

 tentei usar o teste mas consigo encontrar qual pacote está instalado.

 Obrigada

 Teresa Cristina

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Re: [R-br] MObilidade urbana

2013-06-03 Por tôpico Tito Conte
Edson, não entendo de mobilidade urbana, então vou perguntar se o que você
esta dizendo é o que estou entendendo

voce tem placas de carro no ponto X, estes carros podem ir pra Y1,Y2,Y3,Y4.
Neste caso você quer saber quais carros de X foram para cada um dos Ys
certo?

se eu estiver certo o comando which pode ajudar


Tito Conte



2013/5/31 Edson Lira edinhoes...@yahoo.com.br

 Caros amigos, estou tentando estabalecer uma amostra para o seguinte
 problema:

 Tenho uma origem e quatro destinos. Na origem consigo coletar 1326 placas
 de carros em 60 minutos, São 4 destinos e consigo identificar 620 placas
 desta origem, como estabelecer uma amostra nos 4 destinos para identificar
 o origem?

  [ ]'s.

 Edson Lira
 Estatístico
 Manaus-Amazonas

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Re: [R-br] Plotagem 3D

2013-06-03 Por tôpico Tito Conte
da uma olhada na função cloud do lattice

Tito Conte



2013/6/3 Tiago Souza Marçal tiagosouzamar...@hotmail.com

 Bom dia pessoal,

 estou querendo plotar um gráfico tridimensional com os escores canônicos
 que estão abaixo:

 dados-structure(list(V1 = c(-18.7175, -20.1915, -21.1557, -17.5965,
 -18.142, -13.857, -18.0086, -14.0436, -12.571), V2 = c(38.3004,
 36.4955, 34.4964, 39.9303, 40.4819, 38.3763, 34.9869, 35.0723,
 35.9022), V3 = c(-20.9237, -20.12, -17.8586, -17.0183, -17.9961,
 -20.8457, -19.5551, -17.5703, -18.7393)), .Names = c(V1, V2,
 V3), class = data.frame, row.names = c(NA, -9L))

 require(lattice)

 zlab - VC2
 xlab - VC1
 ylab - VC3

 wireframe(V2~V1*V3, scales=list(arrows=FALSE), zlab=list(zlab, rot=90),
 xlab=list(xlab, rot=24), ylab=list(ylab,
 rot=-37),xlim=c(-12,-20),ylim=c(-18,-22),type=c(on,bottom))

 No entanto, não estou conseguindo fazer com que os pontos apareçam no
 gráfico e gostaria de eliminar as 3 arestas frontais.

 Agradeço desde já pela ajuda.

 att.

 Tiago


 #

 Tiago de Souza Marçal - Graduando em Agronomia pelo CCA-UFES

 Bolsista de Iniciação Científica da área de Genética e Melhoramento de
 Plantas

 #

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[R-br] Coordenadas UTM para Lat Lon

2013-06-03 Por tôpico Tito Conte
Alguém poderia me explicar como faço a converção de utm para lat lon,

estou tentando pelo rgdal, mas não consegui entender direito como funciona
as funções de conversão


Tito Conte
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Re: [R-br] DE - PARA

2013-05-29 Por tôpico Tito Conte
Não entendi o que você quer edmar

Tito Conte



2013/5/28 Edmar Caldas edmar_cal...@yahoo.com.br

 Bom Dia!

 Alguém poderia me dizer se dá pra fazer um de - para.

 Ex:

 Tenho uma tabela:

 Cod_item   Produto  JanFev   mAR   ABRIL
 maiojunhojlhoagostoset  out
 nov dez
 001 AAA  1015 108
 900000
 000
 002 BBB 00   0
 0   0 54
 5 4  444

 agora quero fazer que o cod_item 002 que tem valor diferente de  ZERO
 paraa para a serie do produto AAA fica assim então.

 Cod_item  Produto Jan  Fev
 mAR  ABRIL   maio   junho
 jlho  aosto set   out nov
 dez
 001AAA 10  15
10 8 9
 5   4  5   4  4
4 4




 Edmar

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Re: [R-br] Detecçção de pontos externos

2013-05-29 Por tôpico Tito Conte
Então na verdade o problema com estes dados foram levantados por terceiros
e repassados.
O problema é que estou questionando os resultados, e quera eu mesmo
interpola-los, mas ao que parece esses já são os interpolados. Pra esse
caso solicitei os brutos. Estou aguardando.

Agradeço a sua disposição e discussão, me ajudaram a criticar um pouco o
que tenho recebido desse pessoal.

Tito Conte



2013/5/27 Hélio Gallo Rocha heliogalloro...@gmail.com

 Tito,

 Andei olhando, parece que o comando over extrai dados como uma seleção,

 Talvez tenha me expresso mal, o que tava pensando era detectar os pontos
 mais externos da área, para fazer a borda na krigagem.

 Como estão os estudos da krigagem?

 Consegui ver seus dados usando o pacote RgoogleMaps, é em são luis do
 maranhão?

 mas pra te dizer a verdade, não tem o que krigar ali, já tem informação
 demais ali.



 Hélio


 Em 25 de maio de 2013 11:54, TitoConte [via R-br] 
 ml-node+s2285057n4659465...@n4.nabble.com escreveu:

 Funcao over do pacote sp ( desculpe sofri correção automática)


 On Saturday, May 25, 2013, Tito Conte wrote:

 Overdose do pacote sp

 On Saturday, May 25, 2013, Hélio Gallo Rocha wrote:

 Bom dia a todos da lista,

 Pegando o exemplo do Tito onde seus dados possuem 25000 coordenadas,
 teria uma função onde se possa separar apenas os pontos externos para fazer
 a borda?

 Grato

 --
 Hélio Gallo Rocha
 IFSULDEMINAS - Câmpus Muzambinho



 --
 Tito Conte




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 Tito Conte



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 Hélio Gallo Rocha
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Re: [R-br] Detecçção de pontos externos

2013-05-25 Por tôpico Tito Conte
Overdose do pacote sp

On Saturday, May 25, 2013, Hélio Gallo Rocha wrote:

 Bom dia a todos da lista,

 Pegando o exemplo do Tito onde seus dados possuem 25000 coordenadas, teria
 uma função onde se possa separar apenas os pontos externos para fazer a
 borda?

 Grato

 --
 Hélio Gallo Rocha
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Tito Conte
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Re: [R-br] Detecçção de pontos externos

2013-05-25 Por tôpico Tito Conte
Funcao over do pacote sp ( desculpe sofri correção automática)

On Saturday, May 25, 2013, Tito Conte wrote:

 Overdose do pacote sp

 On Saturday, May 25, 2013, Hélio Gallo Rocha wrote:

 Bom dia a todos da lista,

 Pegando o exemplo do Tito onde seus dados possuem 25000 coordenadas,
 teria uma função onde se possa separar apenas os pontos externos para fazer
 a borda?

 Grato

 --
 Hélio Gallo Rocha
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 --
 Tito Conte




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Re: [R-br] Cluster com var categorica e continua

2013-05-23 Por tôpico Tito Conte
Princípios de Estatística Em Ecologia - Gotelli, Nicholas J./ Ellison
é um bom começo

Tito Conte



2013/5/23 nani nani.des...@bol.com.br

 Conhece alguma apostila/ livro um pouco mais didático sobre o assunto?

 Obrigada!
 N.


 --
 Em 22/05/2013 17:43, *Tito Conte  tito.co...@gmail.com * escreveu:
 pacote vegan de uma olhada nos métodos

 Tito Conte



 2013/5/22 nani 
 nani.des...@bol.com.brhttp://../../../undefined/compose?to=nani.des...@bol.com.br
 


  Olá,

 Alguém tem algum exemplo de clusterização utilizando variáveis
 categóricas conjuntamente com variáveis contínuas?
 Ou alguma sugestão de material?

 Obr,
 N.

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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
Os dados pertencem a levantamentos batimétricos
SObre o SO eu uso o Unix  então esse não é um problema

Tito Conte



2013/5/21 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 Note que nao adianta ter 3 ou 8 ou XYZ  2 gigas de RAM, se o sistema
 operacional for 32 bits

 Em 21 de maio de 2013 12:19, Hélio Gallo Rocha
 heliogalloro...@gmail.com escreveu:
  Ok Elias,
 
  testei numa máquina com 3 gb, vou testar no not que tem 8
 
  Abraço
 
  Hélio
 
 
  Em 21 de maio de 2013 10:48, Elias Krainski [via R-br]
  ml-node+s2285057n4659371...@n4.nabble.com escreveu:
 
  On 05/20/2013 09:31 PM, Hélio Gallo Rocha wrote:
 
  Tito,
 
  krigagem sempre me interessa, pretendo trabalhar com soft livre e
  agricultura de precisão,
 
  Olhei seus dados, tem tanta informação que parecem ser provenientes de
  krigagem, o R não conseguiu processar os dados, parece que o R  tem
 algum
  limite de memória, não sei ao certo, talvez o Elias saiba...
 
 
  O R não possui limite de memória. Num bom sistema operacional você pode
  usar toda a memória RAM disponível no seu computador. O problema é usar
 um
  algoritmo em que há necessidade em se trabalhar em memória e se seus
 dados
  tiverem tamanho em memória maior que a memória do seu computador.
 
  Sobre krigagem para grande número de pontos, o problema é a necessidade
 de
  inverter uma matriz n por n. Você pode evitar isso se usar low rank
 kriging
  or the SPDE approach.
 
  Att.
  Elias
  ___
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  NAML
 
 
 
 
  --
  Hélio Gallo Rocha
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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
Tito Conte



2013/5/22 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 Ainda assim, se seu *nix for 32 bits, vc podera encontrar problemas no
 enderecamento de memoria.

 Em 22 de maio de 2013 14:01, Tito Conte tito.co...@gmail.com escreveu:
  Os dados pertencem a levantamentos batimétricos
  SObre o SO eu uso o Unix  então esse não é um problema
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/5/21 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  Note que nao adianta ter 3 ou 8 ou XYZ  2 gigas de RAM, se o sistema
  operacional for 32 bits
 
  Em 21 de maio de 2013 12:19, Hélio Gallo Rocha
  heliogalloro...@gmail.com escreveu:
   Ok Elias,
  
   testei numa máquina com 3 gb, vou testar no not que tem 8
  
   Abraço
  
   Hélio
  
  
   Em 21 de maio de 2013 10:48, Elias Krainski [via R-br]
   ml-node+s2285057n4659371...@n4.nabble.com escreveu:
  
   On 05/20/2013 09:31 PM, Hélio Gallo Rocha wrote:
  
   Tito,
  
   krigagem sempre me interessa, pretendo trabalhar com soft livre e
   agricultura de precisão,
  
   Olhei seus dados, tem tanta informação que parecem ser provenientes
 de
   krigagem, o R não conseguiu processar os dados, parece que o R  tem
   algum
   limite de memória, não sei ao certo, talvez o Elias saiba...
  
  
   O R não possui limite de memória. Num bom sistema operacional você
 pode
   usar toda a memória RAM disponível no seu computador. O problema é
 usar
   um
   algoritmo em que há necessidade em se trabalhar em memória e se seus
   dados
   tiverem tamanho em memória maior que a memória do seu computador.
  
   Sobre krigagem para grande número de pontos, o problema é a
 necessidade
   de
   inverter uma matriz n por n. Você pode evitar isso se usar low rank
   kriging
   or the SPDE approach.
  
   Att.
   Elias
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   Hélio Gallo Rocha
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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
Hélio,

Estes dados eu recebi do pessoal que fez o levantamento pra mim,
Será que eles mesmo já submeteram os dados brutos a krigagem pela cara dos
dados. Se for este o caso isso justificaria por que o plot com o image
para teste está tão estranho

Tito Conte



2013/5/22 Tito Conte tito.co...@gmail.com



 Tito Conte



 2013/5/22 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 Ainda assim, se seu *nix for 32 bits, vc podera encontrar problemas no
 enderecamento de memoria.

 Em 22 de maio de 2013 14:01, Tito Conte tito.co...@gmail.com escreveu:
  Os dados pertencem a levantamentos batimétricos
  SObre o SO eu uso o Unix  então esse não é um problema
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/5/21 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  Note que nao adianta ter 3 ou 8 ou XYZ  2 gigas de RAM, se o sistema
  operacional for 32 bits
 
  Em 21 de maio de 2013 12:19, Hélio Gallo Rocha
  heliogalloro...@gmail.com escreveu:
   Ok Elias,
  
   testei numa máquina com 3 gb, vou testar no not que tem 8
  
   Abraço
  
   Hélio
  
  
   Em 21 de maio de 2013 10:48, Elias Krainski [via R-br]
   ml-node+s2285057n4659371...@n4.nabble.com escreveu:
  
   On 05/20/2013 09:31 PM, Hélio Gallo Rocha wrote:
  
   Tito,
  
   krigagem sempre me interessa, pretendo trabalhar com soft livre e
   agricultura de precisão,
  
   Olhei seus dados, tem tanta informação que parecem ser provenientes
 de
   krigagem, o R não conseguiu processar os dados, parece que o R  tem
   algum
   limite de memória, não sei ao certo, talvez o Elias saiba...
  
  
   O R não possui limite de memória. Num bom sistema operacional você
 pode
   usar toda a memória RAM disponível no seu computador. O problema é
 usar
   um
   algoritmo em que há necessidade em se trabalhar em memória e se seus
   dados
   tiverem tamanho em memória maior que a memória do seu computador.
  
   Sobre krigagem para grande número de pontos, o problema é a
 necessidade
   de
   inverter uma matriz n por n. Você pode evitar isso se usar low rank
   kriging
   or the SPDE approach.
  
   Att.
   Elias
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Re: [R-br] Tratamento de imagens no R

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
Gilbert,
tanto é possível que estudantes de ecologia se utilizam de imagens de ossos
de ouvido de peixe, para estimar a idade através do R

Tito Conte



2013/5/21 Alejandro C. Frery acfr...@gmail.com

 Bom dia Gilbert e demais redistas,

 Recentemente Springer publicou o seguinte livro
 @BOOK{IntroImageProcessingR,
   title = {Introduction to Image Processing with R: Learning by Examples},
   publisher = {Springer},
   year = {2013},
   author = {A. C. Frery and T. Perciano},
   quality = {1},
   url = {
 http://www.springer.com/computer/image+processing/book/978-1-4471-4949-1}}
 que, embora não trate especificamente de imagens satelitais, trata do
 uso de R em processamento de imagens.

 Alejandro

 2013/4/6 Gilbert Queiroz gilbert_quei...@yahoo.com.br:
  Pessoal,
  Semana passada, um amigo me disse que vium livro sobre tratamento de
 imagens
  de satelite no R. É possível isto???
  Outra pergunta: sobre aqruivos raster - é possível utilizá-los no R e
 fazer
  um tratamento vetorial (vetorização)?.
  Abs.
  Gilbert.
 
  ___
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 --
 Alejandro C. Frery
 Maceió, AL - Brazil
 http://sites.google.com/site/acfrery/
 http://www.researcherid.com/rid/A-8855-2008
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Re: [R-br] Tratamento de imagens no R

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
QUanto a imagens de satélite eu estou fazendo isso no meu TCC, dependendo
do que você precisar posso te ajudar com isso

Tito Conte



2013/5/22 Tito Conte tito.co...@gmail.com

 Gilbert,
 tanto é possível que estudantes de ecologia se utilizam de imagens de
 ossos de ouvido de peixe, para estimar a idade através do R

 Tito Conte



 2013/5/21 Alejandro C. Frery acfr...@gmail.com

 Bom dia Gilbert e demais redistas,

 Recentemente Springer publicou o seguinte livro
 @BOOK{IntroImageProcessingR,
   title = {Introduction to Image Processing with R: Learning by Examples},
   publisher = {Springer},
   year = {2013},
   author = {A. C. Frery and T. Perciano},
   quality = {1},
   url = {
 http://www.springer.com/computer/image+processing/book/978-1-4471-4949-1
 }}
 que, embora não trate especificamente de imagens satelitais, trata do
 uso de R em processamento de imagens.

 Alejandro

 2013/4/6 Gilbert Queiroz gilbert_quei...@yahoo.com.br:
  Pessoal,
  Semana passada, um amigo me disse que vium livro sobre tratamento de
 imagens
  de satelite no R. É possível isto???
  Outra pergunta: sobre aqruivos raster - é possível utilizá-los no R e
 fazer
  um tratamento vetorial (vetorização)?.
  Abs.
  Gilbert.
 
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Re: [R-br] concatenar dados de muitas estações

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
?

Tito Conte



2013/5/17 Helena Turon helena.tu...@gmail.com

 prec é a quantidade de precipitação diária, que deveria ser um vetor
 numérico, você acha que é lista?

 Como posso resolver isto?


 Obrigada,


 Helena

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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-22 Por tôpico Tito Conte
Alias tem como avaliar a qualidade destes dados?

Tito Conte



2013/5/22 Tito Conte tito.co...@gmail.com

 Hélio,

 Estes dados eu recebi do pessoal que fez o levantamento pra mim,
 Será que eles mesmo já submeteram os dados brutos a krigagem pela cara
 dos dados. Se for este o caso isso justificaria por que o plot com o image
 para teste está tão estranho

 Tito Conte



 2013/5/22 Tito Conte tito.co...@gmail.com



 Tito Conte



 2013/5/22 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com

 Ainda assim, se seu *nix for 32 bits, vc podera encontrar problemas no
 enderecamento de memoria.

 Em 22 de maio de 2013 14:01, Tito Conte tito.co...@gmail.com escreveu:
  Os dados pertencem a levantamentos batimétricos
  SObre o SO eu uso o Unix  então esse não é um problema
 
  Tito Conte
 
 
 
  2013/5/21 Benilton Carvalho beniltoncarva...@gmail.com
 
  Note que nao adianta ter 3 ou 8 ou XYZ  2 gigas de RAM, se o sistema
  operacional for 32 bits
 
  Em 21 de maio de 2013 12:19, Hélio Gallo Rocha
  heliogalloro...@gmail.com escreveu:
   Ok Elias,
  
   testei numa máquina com 3 gb, vou testar no not que tem 8
  
   Abraço
  
   Hélio
  
  
   Em 21 de maio de 2013 10:48, Elias Krainski [via R-br]
   ml-node+s2285057n4659371...@n4.nabble.com escreveu:
  
   On 05/20/2013 09:31 PM, Hélio Gallo Rocha wrote:
  
   Tito,
  
   krigagem sempre me interessa, pretendo trabalhar com soft livre e
   agricultura de precisão,
  
   Olhei seus dados, tem tanta informação que parecem ser
 provenientes de
   krigagem, o R não conseguiu processar os dados, parece que o R  tem
   algum
   limite de memória, não sei ao certo, talvez o Elias saiba...
  
  
   O R não possui limite de memória. Num bom sistema operacional você
 pode
   usar toda a memória RAM disponível no seu computador. O problema é
 usar
   um
   algoritmo em que há necessidade em se trabalhar em memória e se
 seus
   dados
   tiverem tamanho em memória maior que a memória do seu computador.
  
   Sobre krigagem para grande número de pontos, o problema é a
 necessidade
   de
   inverter uma matriz n por n. Você pode evitar isso se usar low rank
   kriging
   or the SPDE approach.
  
   Att.
   Elias
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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-20 Por tôpico Tito Conte
Não, obrigado pelo documento

Tito Conte



On Fri, May 17, 2013 at 5:01 PM, Elias Krainski
eliaskrain...@yahoo.com.brwrote:

  Ja viu os exemplos em
 http://www.leg.ufpr.br/geoR/geoRdoc/tutorialsBR.html
 ?


 On 05/17/2013 04:32 PM, Tito Conte wrote:

 Sim essa parte eu sei, mas não sei como utilizar a função de krigagem, em
 ambos os casos a minha dificuldade é q o R faça a interpolação, coisa que
 não estou conseguindo

 Tito Conte



 2013/5/17 Elias Krainski eliaskrain...@yahoo.com.br

 Basicamente, vc precisa de um modelo geoestatístico para isso. Mas há
 métodos de interpolação que não usam geoestatística/krigagem.

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Re: [R-br] teste de Jonckheere

2013-05-20 Por tôpico Tito Conte
http://lmgtfy.com/?q=r+project+Jonckheere

Tito Conte



2013/5/20 Cristina d...@ufscar.br

 **
 Olá pessoal!

 Gostaria de saber se alguém já usou no R o teste de Jonckheere.

 tentei usar o teste mas  não sei qual pacote está instalado.

 Obrigada

 Teresa Cristina

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Re: [R-br] Dúvida sobre Krigagem

2013-05-17 Por tôpico Tito Conte
Interpolar por krigagem os dados do arquivo em anexo txt

Tito Conte



2013/5/16 Elias Krainski eliaskrain...@yahoo.com.br


  krigar o arquivo em anexo

 Como seria krigar um arquivo? :)

 Sobre krigagem, veja exemplos em
 http://www.leg.ufpr.br/geoR/**geoRdoc/tutorialsBR.htmlhttp://www.leg.ufpr.br/geoR/geoRdoc/tutorialsBR.html
 Basicamente, vc precisa de um modelo geoestatístico para isso.
 __**_
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 Leia o guia de postagem 
 (http://www.leg.ufpr.br/r-br-**guiahttp://www.leg.ufpr.br/r-br-guia)
 e forneça código mínimo reproduzível.

___
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Re: [R-br] concatenar dados de muitas estações.

2013-05-17 Por tôpico Tito Conte
o que seria prec?
e você criou uma matrix e esta adicionando como lista?

Tito Conte



2013/5/17 Helena Turon helena.tu...@gmail.com

  Desculpe-me, o problema é:


 prect - matrix(nrow= 15000,ncol=i)

 prect[[,t]] - prec

 Erro em prect[[, t]] - prec :

   mais elementos fornecidos do que podem ser substituídos.

 Eu penso que é por conta do número de observações ser diferente nas
 estações (por conta dos dados faltantes), será?


 Obrigada,

 Helena

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Re: [R-br] construção de um objecto para calcular os outliers

2013-05-17 Por tôpico Tito Conte
Ana,

você  em primeiro lugar você esta colocando uma lista dentro de uma matrix
se você quer contabilizar o número de outliers veja o tamanho do vetor que
você obteve dado as condições
para tal faça as alterações em vermelho

porano-apply(dados[-c(19,23,3
6,37),-1],2,function(x)c(summary(x),0)[1:7])
desviopadrao-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,sd,na.rm=TRUE)
variancia-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,var,na.rm=TRUE)
r-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,range,na.rm=TRUE)
diffr-diff(r)
iqr-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,function(x){quantile(x,na.rm=TRUE)[4]-quantile(x,na.rm=TRUE)[2]})
besq-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,function(x){quantile(x,
na.rm=TRUE)[2]})-1.5*iqr
bdt-apply(dados[-c(19,23,36,37),-1],2,function(x){quantile(x,
na.rm=TRUE)[4]})+1.5*iqr
outliers-rep(0,ncol(dados)-1)
for(i in names(dados[-c(19,23,36,37),-1])){
tmp-dados[-c(19,23,36,37),i]
outliers[i]-length(tmp[tmp  bdt[i] | dados[-c(19,23,36,37),i]  besq[i]])
}
row.names(diffr) - Diferen?a do range # Como o resultado do comando diff
? uma matriz, voc? precisa colocar o nome da linha antes de juntar todos os
resultados
rownames(porano)-c(Mínimo,Primeiro Quartil,Mediana,Média,Terceiro
Quartil,Máximo,NAs)
todos_resultados_dados-rbind(porano,Desvio padr?o=desviopadrao,
Vari?ncia=variancia, diffr, iqr,besq,bdt,outliers)
todos_resultados_dados



Tito Conte



2013/5/17 alanaro...@sapo.pt


 Boa tarde estou a criar objectos para poder fazer o calculo dos outliers
 mas está a dar tudo NULL, eu queria saber porque..
 dados lidos:
2008 2009 2010 2011 2012
 149 54 57 54 56
 253 54 55 53 59
 352   51   52   53   52
 457   59   59   60   63
 563 60 63 64 62
 658   57   59   58   63
 estatísticas:
 #estatísticas descritivas
 porano-apply(dados[-c(19,23,**36,37),-1],2,function(x)c(**
 summary(x),0)[1:7])
 desviopadrao-apply(dados[-c(**19,23,36,37),-1],2,sd,na.rm=**TRUE)
 variancia-apply(dados[-c(19,**23,36,37),-1],2,var,na.rm=**TRUE)
 r-apply(dados[-c(19,23,36,37)**,-1],2,range,na.rm=TRUE)
 diffr-diff(r)
 iqr-apply(dados[-c(19,23,36,**37),-1],2,function(x){**
 quantile(x,na.rm=TRUE)[4]-**quantile(x,na.rm=TRUE)[2]})
 besq-apply(dados[-c(19,23,36,**37),-1],2,function(x){**quantile(x,
 na.rm=TRUE)[2]})-1.5*iqr
 bdt-apply(dados[-c(19,23,36,**37),-1],2,function(x){**quantile(x,
 na.rm=TRUE)[4]})+1.5*iqr
 outliers-list()
 for(i in names(dados[-c(19,23,36,37),-**1])){
 tmp-dados[-c(19,23,36,37),i]
 outliers[[i]]-tmp[tmp  bdt[i] | dados[-c(19,23,36,37),i]  besq[i]]
 }
 row.names(diffr) - Diferen?a do range # Como o resultado do comando
 diff ? uma matriz, voc? precisa colocar o nome da linha antes de juntar
 todos os resultados
 rownames(porano)-c(Mínimo,**Primeiro 
 Quartil,Mediana,Média,**Terceiro
 Quartil,Máximo,NAs)
 todos_resultados_dados-rbind(**porano,Desvio padr?o=desviopadrao,
 Vari?ncia=variancia, diffr, iqr,besq,bdt,outliers)
 todos_resultados_dados
 porano
 resultado:
2008  2009 2010  2011 2012
 Mínimo 4852   5655.3358
 Primeiro Quartil   4.708149  4.198439 4.554801  5.255589 4.6888
 Mediana22.16667  17.62689 20.74621  27.62121 21.98485
 Média  1919   1922   18
 Terceiro Quartil   6 57 67
 Máximo 4344.5 41.5  44   41.5
 NAs6764.5 69.5  68   69.5
 Desvio padr?o  Numeric,0 44   Numeric,0 43   Numeric,0
 Vari?ncia  NULL  NULL NULL  NULL NULL
 Diferen?a do range NULL  NULL NULL  NULL NULL
 iqrNULL  NULL NULL  NULL NULL
 besq   NULL  NULL NULL  NULL NULL
 bdtNULL  NULL NULL  NULL NULL
 outliers   NULL  NULL NULL  NULL NULL
 porquê NULL?
 Cumprimentos Ana Rocha

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[R-br] Krigagem

2013-05-03 Por tôpico Tito Conte
Bom dia,

Alguém poderia me ajudar com krigagem? Estou usando o fields, e tenho uma
matriz com 57703, com x, y, z pontos, quando uso o comando Krig ele da
vários erros.
O comando é

 K = Krig(xy,z)

xy são as posições e z é a altura


Tito Conte
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Re: [R-br] Legenda no eixo X entre dois gráficos

2013-01-23 Por tôpico Tito Conte
De um
?mtext

Lá vai ter tudo o que você precisa!

Tito Conte



On Thu, Jan 17, 2013 at 12:37 PM, Humberto Hazin hgha...@hotmail.comwrote:

  Bom dia pessoal,

 Como faço para colocar para colocar a legenda no eixo x, meio entre dois
 gráficos? Por exemplo gostaria de adicional o texto “Relative Catchability”
 entre os dois gráficos. Segue o link do gráfico resultado so script abaixo (
 https://www.dropbox.com/s/36tw2eabk3sc7lr/FigureOR_4.pdf)

 Abraços

 Humberto

 tableMat1a:

   Specieslci   or   uci
 1 Bigeye tuna 0.0999 0.17 0.280
 2  Yellowfin tuna 0.0366 0.07 0.135
 3Albacore 0.0850 0.18 0.391
 4   Swordfish 0.0939 0.13 0.191
 5Sailfish 0.1257 0.25 0.498
 6White marlim 0.1500 0.30 0.390
 7 Blue marlim 0.1291 0.29 0.637
 8  Blue shark 0.1280 0.19 0.287
 9 Crocodile shark 0.1120 0.16 0.223
 10   Pelagic stingray 0.0449 0.17 0.619
 11   Turtle oliva 0.1230 0.23 0.296
 12 Oceanic whitetip shark 0.1881 0.50 0.770



 tableMat1b:


   Species lci   oruci
 1 Bigeye tuna 0.00651 0.02 0.0647
 2  Yellowfin tuna 0.08973 0.16 0.2702
 3Albacore 0.01370 0.05 0.1867
 4   Swordfish 0.07696 0.12 0.1709
 5Sailfish 0.16000 0.20 0.4000
 6White marlim 0.05645 0.14 0.3382
 7 Blue marlim 0.01200 0.18 0.2200
 8  Blue shark 0.14176 0.21 0.3183
 9 Crocodile shark 0.02888 0.12 0.5212
 10   Pelagic stingray 0.04961 0.19 0.6875
 11   Turtle oliva 0.15200 0.20 0.3220
 12 Oceanic whitetip shark 0.23250 0.52 0.7700



 tableMat1a-read.csv(tableMetaGW.csv, header = TRUE, sep = ,,
 quote=\, dec=.,fill =TRUE)
 tableMat1b-read.csv(tableMetaGB.csv, header = TRUE, sep = ,,
 quote=\, dec=.,fill = TRUE)

 library(tools)
 pdf(file='FigureOR_4.pdf', height=50, width=50, onefile=TRUE,
 family='Helvetica', paper='a4r', pointsize=12)
 par(mfrow=c(1,2))
 par(mar=c(5,11, 3, 0))
 y.axis - c(length(tableMat1a$or):1)
 plot(tableMat1a$or,y.axis, type = p, axes = F, xlab = , ylab = , pch
 = 19, cex = 1.2,xlim = c(0,1.2), xaxs = r, main = Green vs
 White,yaxt='n')
 segments(tableMat1a$lci, y.axis, tableMat1a$uci, y.axis, lwd =  1.5)
 axis(1,at=seq(0,1.2,by=0.1),labels = F,tick =T,cex.axis = 1.2,mgp =
 c(2,.7,0))
 axis(2, at = y.axis, label = tableMat1a$Specie, las = 1, tick = F, mgp =
 c(2,.6,0),cex.axis = 1.2)
 segments(1,1,1,30,lty=1)
 box(bty = n)

 par(mar=c(5,5, 3, 5))
 y.axis - c(length(tableMat1b$or):1)
 plot(tableMat1b$or,y.axis, type = p, axes = F, xlab = , ylab = , pch
 = 19, cex = 1.2,xlim = c(0,1.2), xaxs = r, main = Green vs
 Blue,yaxt='n')
 segments(tableMat1b$lci, y.axis, tableMat1b$uci, y.axis, lwd =  1.5)
 axis(1,at=seq(0,1.2,by=0.1),labels = F,tick =T,cex.axis = 1.2,mgp =
 c(2,.7,0))
 segments(1,1,1,30,lty=1)
 box(bty = n)
 dev.off()





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Re: [R-br] recorte

2013-01-18 Por tôpico Tito Conte
você pode colocar NA nos pontos que estão interligados

suponha o seguinte: duas áreas limitadas por quadrados

a=c(1,1,3,3,1,4,4,5,5,4)
b=c(2,4,4,2,2,6,7,7,6,6)
f=matrix(c(a,b),ncol=2)
plot(f,type='l')

# caso vc queira  remover a linha basta adicionar um NA

a=c(a[1:5],NA,a[6:10])
 b=c(b[1:5],NA,b[6:10])
 f=data.frame(a,b)
plot(f,type='l')

Seria isso?
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Re: [R-br] recorte

2013-01-18 Por tôpico Tito Conte
Caso você quira fazer um recorte no mapa, faça uma máscara

Criar uma matriz de zero e um (onde zero é o que você quer omitir e 1 os
seus dados), através de uma equação da forma geométrica que você deseja

multiplique essa máscara pelos seus dados, e plote novamente

segue um exemplo abaixo de função que remove as bordas de um circulo

mask - function (dados){
  # tamanho da coluna
  Y=c(1:dim(dados)[1])
  # calcular o raio
  r=floor(length(Y)/2)
  # centro do círculo
  cp = round(length(Y)/2,0)
  # matriz com zeros
  TT=matrix(0,nrow=dim(dados)[1],ncol=dim(dados)[2])
  # fazer uma máscara de um e zero
  for(X in c(1:dim(dados)[2])){
# calcula o raio de todos os Y e X com dados
R=sqrt((X-cp)^2+(Y-cp)^2)
#o maior valor do raio do circulo
zeros=which(R=r)
# remove os pontos de fora do circulo
TT[X,-zeros]=1
  }
  return(TT)
}

aplicando aos meus dados fica

dados.recortados-dados*mask(dados)

espero ter ajudado



Tito Conte



2013/1/18 Tito Conte tito.co...@gmail.com

 você pode colocar NA nos pontos que estão interligados

 suponha o seguinte: duas áreas limitadas por quadrados

 a=c(1,1,3,3,1,4,4,5,5,4)
 b=c(2,4,4,2,2,6,7,7,6,6)
 f=matrix(c(a,b),ncol=2)
 plot(f,type='l')

 # caso vc queira  remover a linha basta adicionar um NA

 a=c(a[1:5],NA,a[6:10])
  b=c(b[1:5],NA,b[6:10])
  f=data.frame(a,b)
 plot(f,type='l')

 Seria isso?



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Re: [R-br] ajuda loop

2012-08-21 Por tôpico Tito Conte
Heloíse,

experimente fazer assim:

lat - read.table(file=lat.txt)
lon - read.table(file=lon.txt)

library(R.matlab)   # para ler .mat
sx - readMat('SX.mat',maxLength=NULL,
fixNames=TRUE,verbose=F,sparseMatrixClass='SparseM')

# limites de longitude
lonSX - sx$SX[3,1,1]
lonmin - min(as.numeric(lonSX$Lon[1:130]))
lonmax - max(as.numeric(lonSX$Lon[1:130]))

# limites de latitude
latSX - sx$SX[4,1,1]
latmin - min(as.numeric(latSX$Lat[1:130]))
latmax - max(as.numeric(latSX$Lat[1:130]))

indice=which(latlatmax) #indices das latitudes menores do que a máxima
indice=which(lat[indice]latmin) #indices das latitudes maiores do que a
minima
indice=which(lon[indice]lonmax) #indices das longitudes menores do que a
máxima
indice=which(lon[indice]lonmin) #indices das longitudes maiores do que a
minima

no final vc terá os indices das coordenadas que encerram a área de interesse





Atenciosamente,
Tito Conte

Instituto Oceanográfico
Universidade de São Paulo
LabPesq - Laboratório Oceanografia Pesqueira
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Re: [R-br] regressão polinomial

2012-07-26 Por tôpico Tito Conte
Paulo mas o polinomio corresponde a uma borda por isso dentro fora

o trabalho que estou realizando corresponde a saber se as partículas
jogadas ao acaso em uma determinada área ultrapassam ou não as bordas. Os
dados que passei para vocês corresponde a uma dessas bordas,  Porém os
dados não são responsáveis pela construção de nenhuma dessas bordas
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Re: [R-br] regressão polinomial

2012-07-26 Por tôpico Tito Conte
Paulo e Walmes,

encontrei a seguinte forma para resolver o problema, gostaria que dessem
uma olhada

#dados do limite da borda direitra
y=c(-26.,-25.9862,-25.9343,-25.8822,-25.8433,-25.8054,-25.7948,-25.7872,-25.7668,-25.7284,-25.7015,-25.6282,-25.4612,-25.3016,-25.2564,-25.2412,-25.2412,-25.2232,-25.0869,-25.,-25.,-24.9856,-24.9397,-24.8976,-24.8533,-24.6587,-24.6373,-24.5740,-24.5406,-24.4379,-24.3934,-24.3628,-24.3277,-24.3042,-24.2972,-24.2973,-24.3020,-24.3068,-24.3068,-24.2956,-24.2920)
x=c(-45.8529,-45.8302,-45.7575,-45.6680,-45.6107,-45.5050,-45.4574,-45.4058,-45.3538,-45.2913,-45.2634,-45.2264,-45.1667,-45.0719,-45.0213,-45.,-45.,-44.9748,-44.8726,-44.8405,-44.8405,-44.8351,-44.8259,-44.7972,-44.7764,-44.6867,-44.6674,-44.5912,-44.5587,-44.4927,-44.4515,-44.4115,-44.3314,-44.2664,-44.2171,-44.1729,-44.1288,-44.0820,-44.0509,-44.0118,-44.)

# partícula 1
amostra=c(x=-45.3,y=-25.111)

# inserir dados das amostras no limite
x[length(x)+1]=amostra['x']
y[length(y)+1]=amostra['y']

#criar polinomio
m=lm(y~poly(x,3))

xpred - data.frame(x = seq(min(x), max(x), len=250))

#plotar dados
plot(y,x)
lines(xpred$x, predict(m, newdata=xpred))

if(abs(resid(m[length(m)]))0.1 or  resid(m[length(m)]))0 )
i='dentro'
else i='fora'
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Re: [R-br] regressão polinomial

2012-07-25 Por tôpico Tito Conte


 Paulo agora outra dúvida, tenho dez mil pontos, como comparar os que estão
a direita e a esquerda dessa curva (como se fosse um dentro ou fora do
sistema), já que não consigo extrair o coeficiente de da função poly?
Necessito dos dados numericamente pois estes pontos serão submetidos a
novos tratamentos posteriormente
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Re: [R-br] regressão polinomial

2012-07-25 Por tôpico Tito Conte
Walmes vou criar um exemplo para facilitar o entendimento

o que eu preciso é comparar pontos amostrados com os resultados de um
modelo de interpolação polinomial

por exemplo

#minhas amostras
y=seq(1:9)
x=seq(3:11)

#pontos do modelo
xm=seq(2,11)
ym=seq(0:8)

#tirando os valores do modelo da reta
r=lm(ym~poly(xm,1))

#extraindo coeficientes
a=r$coefficients[1]
b=r$coefficients[0]

validacao=vector()
#comparando cada ponto obtido pelo modelo ajustado com a amostra
for(i in c(1:length(y)){
# calculando valor do modelo
m=a*x[i]+b
# comparando modelo com amostra
ifelse(my[i],a='fora',a='dentro')
validacao[i]=a
}

 é algo deste estilo porém com um polinomio de grau elevado, Quando ploto
os resultados eles estão bonitos, mas quando calculo ele como o método
abaixo os valores extrapolam muito da realidade e não entendo o porque,
veja o  exemplo aqui


y=c(-26.,-25.9862,-25.**9343,-25.8822,-25.8433,-25.**
 8054,-25.7948,-25.7872,-25.**7668,-25.7284,-25.7015,-25.**
 6282,-25.4612,-25.3016,-25.
 2564,-25.2412,-25.2412,-25.**2232,-25.0869,-25.,-25.**
 ,-24.9856,-24.9397,-24.**8976,-24.8533,-24.6587,-24.**
 6373,-24.5740,-24.5406,-24
 .4379,-24.3934,-24.3628,-24.**3277,-24.3042,-24.2972,-24.**
 2973,-24.3020,-24.3068,-24.**3068,-24.2956,-24.2920)



 x=c(-45.8529,-45.8302,-45.**7575,-45.6680,-45.6107,-45.**
 5050,-45.4574,-45.4058,-45.**3538,-45.2913,-45.2634,-45.**
 2264,-45.1667,-45.0719,-45.
 0213,-45.,-45.,-44.**9748,-44.8726,-44.8405,-44.**
 8405,-44.8351,-44.8259,-44.**7972,-44.7764,-44.6867,-44.**
 6674,-44.5912,-44.5587,-44
 .4927,-44.4515,-44.4115,-44.**3314,-44.2664,-44.2171,-44.**
 1729,-44.1288,-44.0820,-44.**0509,-44.0118,-44.)



r=lm(y~poly(x,5))

b0=r$coefficient[1]
b1=r$coefficient[2]
b2=r$coefficient[3]
b3=r$coefficient[4]
b4=r$coefficient[5]
b5=r$coefficient[6]

modelo=b0+b1*x+b2*x^2+b3*x^3+b4*x^4+b5*x^5

modelo

veja que os resultados estão muito fora. mas deveriam ser os mesmos, como
proceder?
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Re: [R-br] Geoprocessamento

2012-07-24 Por tôpico Tito Conte
Geologia ou geografia?
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[R-br] regressão polinomial

2012-07-24 Por tôpico Tito Conte
Pessoal tenho o seginte conjunto de dados:

f=c(-26.,-25.9862,-25.9343,-25.8822,-25.8433,-25.8054,-25.7948,-25.7872,-25.7668,-25.7284,-25.7015,-25.6282,-25.4612,-25.3016,-25.2564,-25.2412,-25.2412,-25.2232,-25.0869,-25.,-25.,-24.9856,-24.9397,-24.8976,-24.8533,-24.6587,-24.6373,-24.5740,-24.5406,-24.4379,-24.3934,-24.3628,-24.3277,-24.3042,-24.2972,-24.2973,-24.3020,-24.3068,-24.3068,-24.2956,-24.2920)
w=c(-45.8529,-45.8302,-45.7575,-45.6680,-45.6107,-45.5050,-45.4574,-45.4058,-45.3538,-45.2913,-45.2634,-45.2264,-45.1667,-45.0719,-45.0213,-45.,-45.,-44.9748,-44.8726,-44.8405,-44.8405,-44.8351,-44.8259,-44.7972,-44.7764,-44.6867,-44.6674,-44.5912,-44.5587,-44.4927,-44.4515,-44.4115,-44.3314,-44.2664,-44.2171,-44.1729,-44.1288,-44.0820,-44.0509,-44.0118,-44.)

se vocês plotarem eles, obteram uma curva, gostaria de obter a função desta
curva ou uma regressão polinomial de grau elevado dela

já tentei usar a função lm e não deu um bom resultado, quando chego em
graus elevados e calculo utilizando os coeficientes obtidos os valores dão
10 vezes maiores (não sei bem porque) mas quando ploto ela aparece
bonitinha no lugar que deveria aprecer

em outro caso tentei na raça mesmo por multiplicação matricial mas também
deu errado pois os valores da multiplicação da inversa são muito pequenos

alguém pode me dar uma sugestão ou uma luz do que eu estou fazendo de
errado?

Tito Conte
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Re: [R-br] regressão polinomial

2012-07-24 Por tôpico Tito Conte
Segue o código

 # pontos
 y=c(-26.,-25.9862,-25.**9343,-25.8822,-25.8433,-25.**
 8054,-25.7948,-25.7872,-25.**7668,-25.7284,-25.7015,-25.**
 6282,-25.4612,-25.3016,-25.
 2564,-25.2412,-25.2412,-25.**2232,-25.0869,-25.,-25.**
 ,-24.9856,-24.9397,-24.**8976,-24.8533,-24.6587,-24.**
 6373,-24.5740,-24.5406,-24
 .4379,-24.3934,-24.3628,-24.**3277,-24.3042,-24.2972,-24.**
 2973,-24.3020,-24.3068,-24.**3068,-24.2956,-24.2920)



 x=c(-45.8529,-45.8302,-45.**7575,-45.6680,-45.6107,-45.**
 5050,-45.4574,-45.4058,-45.**3538,-45.2913,-45.2634,-45.**
 2264,-45.1667,-45.0719,-45.
 0213,-45.,-45.,-44.**9748,-44.8726,-44.8405,-44.**
 8405,-44.8351,-44.8259,-44.**7972,-44.7764,-44.6867,-44.**
 6674,-44.5912,-44.5587,-44
 .4927,-44.4515,-44.4115,-44.**3314,-44.2664,-44.2171,-44.**
 1729,-44.1288,-44.0820,-44.**0509,-44.0118,-44.)



# regressão polinomial
m=lm(y~x+I(x^2)+I(x^3)+I(x^4)+I(x^5)) # criar polinomio de ordem 5

# extraindo os coeficientes
b0=coefficient(m)[1]
b1=coefficient(m)[2]
b2=coefficient(m)[3]
b3=coefficient(m)[4]
b4=coefficient(m)[5]
b5=coefficient(m)[6]

# recalculando
m_teste=b0+b1*x+b2*x^2+b3*x^3+b4*x^4+b5*x^5



A idéia seria que os pontos de m_teste dessem semelhantes a y mas isso não
acontece
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Re: [R-br] Como precificar um treinamento de R básico?

2012-07-18 Por tôpico Tito Conte
Curso de 4 horas por uma semana 100 reais por aluno
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Re: [R-br] Como precificar um treinamento de R básico?

2012-07-17 Por tôpico Tito Conte
Passei um treinamento pra um grupo de 10 pessoas, a idéia foi saber o nível
de conhecimento de R e programação primeiro, depois sondei o que esperavam
do curso e as apostilas que tinha. Elaborei um roteiro direcionado
atendendo as espectativas do grupo e termieni dando o conselho do 'use o
help
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Re: [R-br] Correlação entre vetores de comprimentos diferentes

2012-05-12 Por tôpico Tito Conte
De forma genérica a lista gerada, corresponde a x e y de uma reta
quero saber quais pontos do arquivo estão acima ou abaixo dessa reta porém
o maior vetor eh o da reta e não o meu conjunto de dados
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Re: [R-br] Problemas com comando witch

2012-05-11 Por tôpico Tito Conte
para esse caso preciso saber quais posições de um vetor de 1 elementos
são maiores do que os valores de um vetor de 203900 elementos (há NANs e
elementos repetidos) e comparar um outro vetor de 1 com outro vetor de
203900 e ver se há posições iguais entre os resultados obtidos.

como uso o match ou o which nesse casou ou outra função que resolva meu
problema
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[R-br] Problemas com comando witch

2012-05-10 Por tôpico Tito Conte
tenho dois vetores:

p=c(2,3,4,5,6,7,8,9)
r=c(3,4,5)

quando uso

which(p==r) ou which(r==p)

ele me retorna as posições onde r ocorre em p como fazer para saber onde p
ocorre em r?

obrigado (já dei um google nisso e não encontrei )


Tito Conte
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Re: [R-br] Escalas

2012-05-10 Por tôpico Tito Conte
se quiser ir mais a fundo vá em axis
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Re: [R-br] Problemas com comando witch

2012-05-10 Por tôpico Tito Conte
e para maior e menor?
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Re: [R-br] Problemas com comando witch

2012-05-10 Por tôpico Tito Conte
e não da certo para vetores de tamanhos diferentes
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Re: [R-br] Problemas com comando witch

2012-05-10 Por tôpico Tito Conte
e para o caso de maior e menor?
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Re: [R-br] Problemas com R 2.15

2012-05-03 Por tôpico Tito Conte
Instalei alguns pacotes NetCDF e deu certo, valeu pessoal
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[R-br] Problemas com R 2.15

2012-05-02 Por tôpico Tito Conte
Acabei de instalar o R para Ubuntu e não estou conseguindo instalar nenhum
pacote novo, fiz isso para o pacote ncdf, e tentei pra mais alguns e nada
todos dão o mesmo erro (achava que era problema com o NetCDF)

a mensagem que aparece segue abaixo

installing *source* package ‘ncdf’ ...
** package ‘ncdf’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for nc-config... /usr/bin/nc-config
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include -fpic
 -O3 -pipe  -g  -c ncdf.c -o ncdf.o
ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [ncdf.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’
* removing ‘/home/tito/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/ncdf’

The downloaded source packages are in
‘/tmp/Rtmpn8hiQ4/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages(ncdf) :
  installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status


Obrigado Tito
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Re: [R-br] Loop varrendo quantidade enorme de arquivos

2012-05-02 Por tôpico Tito Conte
Cara quando eu executo vários arquivos faço o seguinte


a-dir(diretório dos seus arquivos) # aqui cria um vetor com as strings
dos diretórios (nome dos arquivos no seu caso)

tabela-matrix(NA,2,2)
resultados-tabela

s=0

e para dar nome para eles do jeito que vc está querendo e criar a variável
vc pode pegar o nome

while(s length(a)){
s=1+s   # conta
+1 na leitura do arquivo
nome_do_arquivo-substr(a[s],0,nchar(a[s])-4)  # retira o nome da
variável do nome do arquivo (subtrai o .tif)
arquivo-raster('lai{ano}{diajuliano}.tif')#carrega seu tif
multiplicado-arquivo*0.001   # multiplica por
0.001
tabela[s,]-assing(nome_do_arquivo,multiplicado) # atribui o resultado da
multiplicação a vaiavel gerada e armazena em uma tabela na linha escolhida
lá
}

s=0
f=0

while(f length(a)){
s=s+1
f=4*s
g=f-3
resultados[s,]-tabela[c(g:f),]
colnames(resultados)-cut(seq(ISOdate(2001,1,1),to=ISOdate(2011,12,31),by=month),month)
}


deve funcionar
qualquer coisa de uma olhada no que as funções fazem
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Re: [R-br] precisão numérica e which.max com empates

2012-05-02 Por tôpico Tito Conte
Tito Conte




2012/5/2 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil 
emmanuel.bra...@gmail.com

 Amigos de R,

 Estou tentando comparar alguns métodos de estimação e um dos passos
 necessários é encontrar valores maximos ou minimos de vetores numéricos.

 O problema numero 1 é que quando comparo visualmente os vetores ocorre que
 ocasionalmente acontece 2 ou 3 empates nos valores máximos ou mínimos como
 no vetor abaixo. Reparem que o valor .7 aparece na posição 21 e 23. Mas
 quando utilizo a função which.max ou max eu so encontro a posição 23.
 POssivlemente ha alguma coisa relacionado com precisão nume´rica apesar de
 não fazer muito sentido no momento.

  test.values$Youden [1] 0.00 0.05 0.10 0.15 0.20 0.25 0.30 0.35 0.40 0.45 
  0.50 0.55 0.60 0.55 0.60 0.65 0.60 0.65 0.60 0.65
 [21] 0.70 0.65 0.70 0.65 0.60 0.65 0.60 0.65 0.60 0.55 0.50 0.45 0.40 0.35 
 0.30 0.25 0.20 0.15 0.10 0.05 max(test.values$Youden)[1] 0.7

  which.max(test.values$Youden)[1] 23

  which(test.values$Youden==max(test.values$Youden)) [1] 23 
 test.values$Youden[21]==test.values$Youden[23]

 [1] FALSE

 O problema 2 é que quando de fato ocorrem empates a função which.max retorna 
 somente a primeira posição. Então, a questão

 seria como retornar todas as posições com valores máximos ou encontrar uma 
 mediana dos valores empatados?

 Qualquer luz é bem vinda.


 Dr. Pedro Emmanuel A. A. do Brasil
 Curriculum Lattes:  http://lattes.cnpq.br/6597654894290806
 Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas
 Fundação Oswaldo Cruz
 Rio de Janeiro - Brasil
 Av. Brasil 4365,
 CEP 21040-360,
 Tel 55 21 3865-9648
 email: pedro.bra...@ipec.fiocruz.br
 email: emmanuel.bra...@gmail.com

 ---Apoio aos softwares livres
 www.zotero.org - gerenciamento de referências bibliográficas.
 www.broffice.org ou www.libreoffice.org - textos, planilhas ou
 apresentações.
 www.epidata.dk - entrada de dados.
 www.r-project.org - análise de dados.
 www.ubuntu.com - sistema operacional


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Re: [R-br] precisão numérica e which.max com empates

2012-05-02 Por tôpico Tito Conte
Tente isso:


which(test.values$Youden==max(test.values$Youden),arr.ind=TRUE)
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