Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Ah, me acabo de dar cuenta que ya habías respondido a lo del LOOV...
Sí, para guardar la categoría simplemente tienes que guardar la predicción
como "character()".
Como ejemplo:
#
library(rpart)
data <- iris
preds <- {}
for (i in 1:nrow(data)) {
print(i)
training <- data[-i, ]
fitrp <- rpart(Species ~ .,data=training, cp=0)
Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
preds[i] <- *as.character*(Pred)
}
#---
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El mar., 19 feb. 2019 a las 13:21, Manuel Mendoza ()
escribió:
> Hola Carlos ¿sabes tú qué se puede hacer para que añada la categoría
> en vez del nº al que corresponde?
>
>
> Quoting Carlos Ortega :
>
> > Es una forma de hacer el LOOV (Leave One Out Validation).
> >
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
> >
> > El mar., 19 feb. 2019 a las 12:45, Manuel Mendoza (<
> mmend...@mncn.csic.es>)
> > escribió:
> >
> >> Bueno, creo que no contesté tu pregunta. Con training <- data[-i, ]
> >> crea una df llamada training, sin la muestra i, que después utiliza
> >> para entrenar el algoritmo.
> >>
> >>
> >> Quoting Javier Marcuzzi :
> >>
> >> > Estimado Manuel Mendoza
> >> >
> >> > Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <-
> data[-i,
> >> ]?
> >> >
> >> > Javier Rubén Marcuzzi
> >> >
> >> > El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza (<
> >> mmend...@mncn.csic.es>)
> >> > escribió:
> >> >
> >> >> Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor.
> El
> >> >> árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
> >> >> el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías
> se
> >> >> trate.
> >> >>
> >> >>
> >> >> Quoting Jorge I Velez :
> >> >>
> >> >> > Estimado Manuel,
> >> >> >
> >> >> > Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
> >> >> >
> >> >> > factor(ecsta, levels = ...)
> >> >> >
> >> >> > antes de ajustar el modelo.
> >> >> >
> >> >> > Dale una mirada a
> >> >> >
> >> >> > ?factor
> >> >> >
> >> >> > para má detalles.
> >> >> >
> >> >> > Saludos,
> >> >> > Jorge.-
> >> >> >
> >> >> > El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
> >> >> > mmend...@mncn.csic.es> escribió:
> >> >> >
> >> >> >>
> >> >> >> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación
> cada
> >> >> >> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
> >> >> >> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
> >> >> >> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
> >> >> >> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
> >> >> >> categoría (la letra), pero no sé cómo.
> >> >> >>
> >> >> >> preds <- {}
> >> >> >>
> >> >> >> for (i in 1:nrow(data)) {
> >> >> >>
> >> >> >>training <- data[-i, ]
> >> >> >>
> >> >> >>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
> >> >> >>
> >> >> >>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
> >> >> >>
> >> >> >>preds[i] <- Pred
> >> >> >>
> >> >> >> }
> >> >> >>
> >> >> >> Gracias como siempre,
> >> >> >> Manuel
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >>
> >> >> >> .
> >> >> >>
> >> >> >> --
> >> >> >> Dr Manuel Mendoza
> >> >> >> Department of Biogeography and Global Change
> >> >> >> National Museum of Natural Science (MNCN)
> >> >> >> Spanish Scientific Council (CSIC)
> >> >> >> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> >> >> >> Spain
> >> >> >>
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> >> >> >> R-help-es mailing list
> >> >> >> R-help-es@r-project.org
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> >> >> >>
> >> >> > --
> >> >> > Sent from my phone. Please excuse my brevity and misspelling.
> >> >>
> >> >>
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> >> Dr Manuel Mendoza
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> >> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
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> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >>
> >
> >
> > --
> > Saludos,
> > Carlos Ortega
> > www.qualityexcellence.es
>
>
> --
> Dr Manuel Mendoza
> Department of Biogeography and Global Change
> National Museum of Natural Science (MNCN)
Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Hola Carlos ¿sabes tú qué se puede hacer para que añada la categoría
en vez del nº al que corresponde?
Quoting Carlos Ortega :
Es una forma de hacer el LOOV (Leave One Out Validation).
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El mar., 19 feb. 2019 a las 12:45, Manuel Mendoza ()
escribió:
Bueno, creo que no contesté tu pregunta. Con training <- data[-i, ]
crea una df llamada training, sin la muestra i, que después utiliza
para entrenar el algoritmo.
Quoting Javier Marcuzzi :
> Estimado Manuel Mendoza
>
> Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i,
]?
>
> Javier Rubén Marcuzzi
>
> El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza (<
mmend...@mncn.csic.es>)
> escribió:
>
>> Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
>> árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
>> el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
>> trate.
>>
>>
>> Quoting Jorge I Velez :
>>
>> > Estimado Manuel,
>> >
>> > Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
>> >
>> > factor(ecsta, levels = ...)
>> >
>> > antes de ajustar el modelo.
>> >
>> > Dale una mirada a
>> >
>> > ?factor
>> >
>> > para má detalles.
>> >
>> > Saludos,
>> > Jorge.-
>> >
>> > El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
>> > mmend...@mncn.csic.es> escribió:
>> >
>> >>
>> >> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
>> >> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
>> >> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
>> >> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
>> >> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
>> >> categoría (la letra), pero no sé cómo.
>> >>
>> >> preds <- {}
>> >>
>> >> for (i in 1:nrow(data)) {
>> >>
>> >>training <- data[-i, ]
>> >>
>> >>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
>> >>
>> >>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
>> >>
>> >>preds[i] <- Pred
>> >>
>> >> }
>> >>
>> >> Gracias como siempre,
>> >> Manuel
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
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>> >>
>> >>
>> >>
>> >>
>> >> .
>> >>
>> >> --
>> >> Dr Manuel Mendoza
>> >> Department of Biogeography and Global Change
>> >> National Museum of Natural Science (MNCN)
>> >> Spanish Scientific Council (CSIC)
>> >> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
>> >> Spain
>> >>
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>> >> R-help-es@r-project.org
>> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>> >>
>> > --
>> > Sent from my phone. Please excuse my brevity and misspelling.
>>
>>
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>> Spanish Scientific Council (CSIC)
>> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
>> Spain
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Es una forma de hacer el LOOV (Leave One Out Validation).
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El mar., 19 feb. 2019 a las 12:45, Manuel Mendoza ()
escribió:
> Bueno, creo que no contesté tu pregunta. Con training <- data[-i, ]
> crea una df llamada training, sin la muestra i, que después utiliza
> para entrenar el algoritmo.
>
>
> Quoting Javier Marcuzzi :
>
> > Estimado Manuel Mendoza
> >
> > Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i,
> ]?
> >
> > Javier Rubén Marcuzzi
> >
> > El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza (<
> mmend...@mncn.csic.es>)
> > escribió:
> >
> >> Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
> >> árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
> >> el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
> >> trate.
> >>
> >>
> >> Quoting Jorge I Velez :
> >>
> >> > Estimado Manuel,
> >> >
> >> > Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
> >> >
> >> > factor(ecsta, levels = ...)
> >> >
> >> > antes de ajustar el modelo.
> >> >
> >> > Dale una mirada a
> >> >
> >> > ?factor
> >> >
> >> > para má detalles.
> >> >
> >> > Saludos,
> >> > Jorge.-
> >> >
> >> > El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
> >> > mmend...@mncn.csic.es> escribió:
> >> >
> >> >>
> >> >> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
> >> >> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
> >> >> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
> >> >> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
> >> >> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
> >> >> categoría (la letra), pero no sé cómo.
> >> >>
> >> >> preds <- {}
> >> >>
> >> >> for (i in 1:nrow(data)) {
> >> >>
> >> >>training <- data[-i, ]
> >> >>
> >> >>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
> >> >>
> >> >>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
> >> >>
> >> >>preds[i] <- Pred
> >> >>
> >> >> }
> >> >>
> >> >> Gracias como siempre,
> >> >> Manuel
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
> >> >>
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> >> >> C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
> >> >> Spain
> >> >>
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> >> >> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
> >> >>
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> >>
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> >>
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Bueno, creo que no contesté tu pregunta. Con training <- data[-i, ]
crea una df llamada training, sin la muestra i, que después utiliza
para entrenar el algoritmo.
Quoting Javier Marcuzzi :
Estimado Manuel Mendoza
Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i, ]?
Javier Rubén Marcuzzi
El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza ()
escribió:
Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
trate.
Quoting Jorge I Velez :
> Estimado Manuel,
>
> Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
>
> factor(ecsta, levels = ...)
>
> antes de ajustar el modelo.
>
> Dale una mirada a
>
> ?factor
>
> para má detalles.
>
> Saludos,
> Jorge.-
>
> El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
> mmend...@mncn.csic.es> escribió:
>
>>
>> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
>> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
>> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
>> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
>> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
>> categoría (la letra), pero no sé cómo.
>>
>> preds <- {}
>>
>> for (i in 1:nrow(data)) {
>>
>>training <- data[-i, ]
>>
>>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
>>
>>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
>>
>>preds[i] <- Pred
>>
>> }
>>
>> Gracias como siempre,
>> Manuel
>>
>>
>>
>>
>>
>>
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Es un leave one out. Con todas las muestras menos una se entrena el
algoritmo, se predice la categoría de la muestra que falta, y se añade
al vector, que finalmente incluye la predicción para todas las
muestras y sin que hayan sido utilizada para entrenar los modelos. Es
especialmente útil cuando hay pocas muestras y con una validación
cruzada k-fold, los entrenamientos se hacen con pocas muestras. Aunque
es una técnica común, este código lo acabo de diseñar yo, por lo que,
hasta que no analice los resultados no estoy seguro de que lo hace
bien. Supongo que sí.
Quoting Javier Marcuzzi :
Estimado Manuel Mendoza
Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i, ]?
Javier Rubén Marcuzzi
El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza ()
escribió:
Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
trate.
Quoting Jorge I Velez :
> Estimado Manuel,
>
> Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
>
> factor(ecsta, levels = ...)
>
> antes de ajustar el modelo.
>
> Dale una mirada a
>
> ?factor
>
> para má detalles.
>
> Saludos,
> Jorge.-
>
> El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
> mmend...@mncn.csic.es> escribió:
>
>>
>> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
>> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
>> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
>> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
>> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
>> categoría (la letra), pero no sé cómo.
>>
>> preds <- {}
>>
>> for (i in 1:nrow(data)) {
>>
>>training <- data[-i, ]
>>
>>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
>>
>>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
>>
>>preds[i] <- Pred
>>
>> }
>>
>> Gracias como siempre,
>> Manuel
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Estimado Manuel Mendoza
Con sus datos y a modo de curiosidad, ¿que pasa en training <- data[-i, ]?
Javier Rubén Marcuzzi
El lun., 18 feb. 2019 a las 19:39, Manuel Mendoza ()
escribió:
> Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
> árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
> el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
> trate.
>
>
> Quoting Jorge I Velez :
>
> > Estimado Manuel,
> >
> > Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
> >
> > factor(ecsta, levels = ...)
> >
> > antes de ajustar el modelo.
> >
> > Dale una mirada a
> >
> > ?factor
> >
> > para má detalles.
> >
> > Saludos,
> > Jorge.-
> >
> > El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
> > mmend...@mncn.csic.es> escribió:
> >
> >>
> >> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
> >> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
> >> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
> >> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
> >> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
> >> categoría (la letra), pero no sé cómo.
> >>
> >> preds <- {}
> >>
> >> for (i in 1:nrow(data)) {
> >>
> >>training <- data[-i, ]
> >>
> >>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
> >>
> >>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
> >>
> >>preds[i] <- Pred
> >>
> >> }
> >>
> >> Gracias como siempre,
> >> Manuel
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
> >>
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Gracias Jorge. No entiendo bien; la variable objetivo es ya factor. El
árbol me la predice bien, como factor, también. Es al ir construyendo
el vector que lo anota con un nº, según de cuál de las 4 categorías se
trate.
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Estimado Manuel,
Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
factor(ecsta, levels = ...)
antes de ajustar el modelo.
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?factor
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Saludos,
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El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
mmend...@mncn.csic.es> escribió:
Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
categoría (la letra), pero no sé cómo.
preds <- {}
for (i in 1:nrow(data)) {
training <- data[-i, ]
fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
preds[i] <- Pred
}
Gracias como siempre,
Manuel
.
--
Dr Manuel Mendoza
Department of Biogeography and Global Change
National Museum of Natural Science (MNCN)
Spanish Scientific Council (CSIC)
C/ Serrano 115bis, 28006 MADRID
Spain
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https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
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Re: [R-es] crear un vector con las categorías
Estimado Manuel,
Debes definir ecsta como factor usando, por ejemplo,
factor(ecsta, levels = ...)
antes de ajustar el modelo.
Dale una mirada a
?factor
para má detalles.
Saludos,
Jorge.-
El El lun, 18 de feb. de 2019 a las 1:03 p. m., Manuel Mendoza <
mmend...@mncn.csic.es> escribió:
>
> Buenas tardes, tengo un loop que hace un árbol de clasificación cada
> vez y va creando un vector con una predicción que hace. Son 4
> categorías (pongamos a, b, c y d), pero en vez de ir añadiendo la
> categoría predicha me añade al vector el nº (del 1 al 4) al que
> corresponde esa categoría. Supongo que se puede hacer que añada la
> categoría (la letra), pero no sé cómo.
>
> preds <- {}
>
> for (i in 1:nrow(data)) {
>
>training <- data[-i, ]
>
>fitrp <- rpart(ecsta ~ .,data=training, cp=0)
>
>Pred <- predict(fitrp,data[i,], type="class")
>
>preds[i] <- Pred
>
> }
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> Gracias como siempre,
> Manuel
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