On Thu, Sep 26, 2013 at 09:56:11PM +0200, George Blackhead wrote: > Spis bych se na vyraz PRIMER dival z pohledu matematickeho vyznamu. Slysel > jsi uz nekdy o druho-cislech a treto/treti-cislech? :-D
<troll> Samozrejme. http://necyklopedie.wikia.com/wiki/Druho%C4%8D%C3%ADslo </troll> Stevko > > (Detrollification) > > > > From: brmlab-boun...@brmlab.cz [mailto:brmlab-boun...@brmlab.cz] On Behalf Of > cored.co...@gmail.com > Sent: Thursday, September 26, 2013 1:38 PM > To: Brmlab: Hackerspace Prague (main discussion) > Subject: Re: [Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC > > > > Ahoj, mozna trochu trolovaci, ale vazne mineny dotaz: > kdyz mame primery, jsou i secundery, tercery, ...? > > sachy > > > > ---------- Původní zpráva ---------- > Od: Jakub Friedl <jakub.fri...@gmail.com> > Datum: 26. 9. 2013 > Předmět: Re: [Brmlab] Biolab: PCR Primery RFC > > > > > > 2013/9/26 Petr Baudis <pa...@ucw.cz> > > Ahoj! > > > On Thu, Sep 26, 2013 at 01:40:15AM +0200, Jakub Friedl wrote: > > v rámci aktuálního biolab grantu je nějaká částka (přesně ví bluebear) > > vyhrazená pro nákup primerů pro PCR. > > > > Bylo by fajn, aby jsme se zamysleli nad tím, jaké primery objednáme (grant > > by se měl vyúčtovat do 3 měsíců) - a pokud není sekvence dostupná v > > literatuře, primery navrhnout. > > Mozna by bylo dobre upresnit, k cemu jsou takove primery dobre. Sam > tomu moc nerozumim, laicky bych to mozna rekl (doufam ze priblizne > spravne) tak, ze primery jsou male kousky DNA, ktere se matchuji na DNA, > kterou analyzujeme, a tak urcuji, jake casti DNA pak vizualne uvidime v > podobe carek na elektroforeze. Zajimaji nas tedy takove kusy DNA, ktere > se lisi podle toho, jestli obsahuji featuru, ktera nas pri analyze > zajima (pritomnost geneticke vady, druhovy puvod, ...) a podle toho > musime primery vybrat. Poradneho vysvetleni toho procesu se jiste > dockate od chido na hackathonu v sobotu. :) > > > > no ten mail byl spíš adresovát těm, co to vědí :) nevím, zda se někdo čerstvě > obeznámený > > s teorií pustí do plánování experimentů a grantu (tím nechci nikoho > odrazovat), bych spíš čekal, > > že si to nechá nejdříve předvést > > > > > Pak by myslím bylo fajn mít kromě specifických primerů něco univerzálního, > > nejspíše nějaké zavedené sekvence používané na barcoding. I když si myslím, > > že produkt vhodný k sekvenaci se nám jen tak nepovede. > > Co je to barcoding? > > s pouzitim vicemene univerzalnich primeru (navrzenych pro cele velke skupiny > organismu) > > a porovnanim sekvence s databazi můžeš identifikovat jinak těžko > rozpoznatelné druhy > > > > > > > > K > > _______________________________________________ > Brmlab mailing list > Brmlab@brmlab.cz > http://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/brmlab > > = > > _______________________________________________ > Brmlab mailing list > Brmlab@brmlab.cz > http://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/brmlab _______________________________________________ Brmlab mailing list Brmlab@brmlab.cz http://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/brmlab
