DTT? Inviato da Outlook per Android<https://aka.ms/AAb9ysg> ________________________________ From: CCP4 bulletin board <CCP4BB@JISCMAIL.AC.UK> on behalf of Rafal Dolot <0000b44974de149e-dmarc-requ...@jiscmail.ac.uk> Sent: Wednesday, November 15, 2023 3:00:50 PM To: CCP4BB@JISCMAIL.AC.UK <CCP4BB@JISCMAIL.AC.UK> Subject: [ccp4bb] Problem with ligand identification
Hello everyone, I need help identifying the ligand I found on the electron density maps. I have soaked ribonuclease A crystals with the phosphorothioate dinucleotide. The diffraction experiment was performed on a home source (Cu). When I analysed the data, I found both the dinucleotide and this strange object near two histidines. Since I did not find anything similar on the list of possibly used compounds, it could be a contamination but still unknown to me. I tried modelling glycolic acid (GOA) here, but it looks like the electron density around the hydroxyl group is greater. Maybe a sulphur containing compound - MCR? Do you have any other idea? Regards Rafal -- ---------------------------------------------- Rafal Dolot, Ph.D. Polish Academy of Sciences Centre of Molecular and Macromolecular Studies Division of Bioorganic Chemistry Macromolecular Crystallography Laboratory Sienkiewicza 112 90-363 Lodz, Poland Phone: +48(42)6803325 Cell: +48 502897781 ---------------------------------------------- ------------------------- Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Centrum Badań Molekularnych i Makromolekularnych Polskiej Akademii Nauk, ul. Sienkiewicza 112, 90-363 Łódź. Przetwarzamy dane osobowe w celu wykonywania działalności Instytutu, w szczególności w zakresie prowadzenia badań naukowych w zakresie nauk chemicznych, fizycznych i technicznych oraz upowszechniania wyników tych badań czy też wykonywania umów w zakresie realizowania projektów badawczych, praktyk, staży, konferencji naukowych, stypendiów, przeprowadzanych przewodów doktorskich/habilitacyjnych. Przechowujemy dane przez okres niezbędny do realizacji ww. celów, dochodzenia lub obrony roszczeń oraz przez czas wymagany przepisami prawa. Ma Pani/Pan prawo dostępu do informacji o przetwarzaniu danych, prawo żądania ich sprostowania, usunięcia, prawo do sprzeciwu wobec przetwarzania, prawo do przenoszenia danych oraz prawo wniesienia skargi do Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych. Decyzji wobec Pani/Pana danych osobowych nie podejmujemy w sposób zautomatyzowany, w tym nie dokonujemy profilowania. Szczegółowe informacje o ochronie danych osobowych zgodnie z RODO znajdują się na stronie www.cbmm.lodz.pl<http://www.cbmm.lodz.pl>. W sprawach ochrony danych osobowych prosimy o kontakt z naszym Inspektorem Ochrony Danych pod adresem: e-mail: i...@cbmm.lodz.pl<mailto:i...@cbmm.lodz.pl>. ------------------------- NOTICE: This message and any attachment are confidential. If you are not the intended recipient, please notify the sender and delete this e-mail and any copies. Incoming e-mails are not accepted as legally binding unless legal validity is confirmed by us by reply-mail. An automatically generated acknowledgement of receipt cannot be considered as confirmation of legal validity. ------------------------- ________________________________ To unsubscribe from the CCP4BB list, click the following link: https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/WA-JISC.exe?SUBED1=CCP4BB&A=1 ######################################################################## To unsubscribe from the CCP4BB list, click the following link: https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/WA-JISC.exe?SUBED1=CCP4BB&A=1 This message was issued to members of www.jiscmail.ac.uk/CCP4BB, a mailing list hosted by www.jiscmail.ac.uk, terms & conditions are available at https://www.jiscmail.ac.uk/policyandsecurity/
