Si, hubo serios problemas, especialmente con el multiprocesamiento y con procesadores HT que se resolvian deshabilitandolo.
En mi caso no tuve problemas con mis clientes que decidieron instalarlo.
Yo no lo recomiento sobre plataforma Intel a menos que solucione algun problema especifico para lo cual debes ver la lista de problemas que resuelve. Sobre procesadores AMD me han reportado buen comportamiento y Hp entiendo que lo recomienda sobre esa plataforma.
La mayoria de las mejoras de fondo son en 64bits por lo que si ese no es tu caso analizaria con sumo cuidado antes de instalarlo.
No te olvides que debes tambien verificar los hotfix posteriores que debes instalar ya que alguno arregla problemas que genera el SP4.
Yo sugeriria que le pidas recomendacon especifica al vendedor del hardware.
Si no sabes como funcionan las aplicaciones sobre ese servidor sugeriria que pruebes y tengas un procedimiento de emergencia para la  vuelta a SP3 listo y preparado.
 
No te olvides de leer cuidadosamente el README y las modificaciones al mismo.
Additions to the SQL Server 2000 Service Pack 4 readme files
http://support.microsoft.com/kb/884525

FIX: Not all memory is available when AWE is enabled on a computer that is running a 32-bit version of SQL Server 2000 SP4
http://support.microsoft.com/kb/899761



Saludos

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Atte.
Ing. Jose Mariano Alvarez

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