Liubov Chuprikova pushed to branch master at Debian Med / ncbi-tools6
Commits: c526581f by Liubov Chuprikova at 2018-04-12T15:24:10+00:00 Autopkgtest: commented tests which require internet connection - - - - - 1 changed file: - debian/tests/run-unit-test Changes: ===================================== debian/tests/run-unit-test ===================================== --- a/debian/tests/run-unit-test +++ b/debian/tests/run-unit-test @@ -113,21 +113,21 @@ end_out="$(grep -c "<Object-id_id>${last_id}</Object-id_id>" dsRNA_viruses.xgs)" [ $end_in -eq $end_out ] -# _insdseqget_ and _idfetch_ testing requires internet connection. -# Comment the lines below to skip the testing. -grep 'GI:' nc0225.gbk | head | sed 's/.*GI://' > GIs.txt -################################################################## -echo '---insdseqget test---' -################################################################## -/usr/bin/insdseqget -i GIs.txt > insdset.xml -[ -s insdset.xml ] -check_GI insdset.xml GIs.txt -################################################################## -echo '---idfetch test---' -################################################################## -/usr/bin/idfetch -G GIs.txt -o idfetch.text -[ -s idfetch.text ] -check_GI idfetch.text GIs.txt +## _insdseqget_ and _idfetch_ testing requires internet connection. +## Uncomment the lines below to run the tests provided. +#grep 'GI:' nc0225.gbk | head | sed 's/.*GI://' > GIs.txt +################################################################### +#echo '---insdseqget test---' +################################################################### +#/usr/bin/insdseqget -i GIs.txt > insdset.xml +#[ -s insdset.xml ] +#check_GI insdset.xml GIs.txt +################################################################### +#echo '---idfetch test---' +################################################################### +#/usr/bin/idfetch -G GIs.txt -o idfetch.text +#[ -s idfetch.text ] +#check_GI idfetch.text GIs.txt ################################################################## View it on GitLab: https://salsa.debian.org/med-team/ncbi-tools6/commit/c526581f868b2845af42aa7df9edf7d8ce847117 --- View it on GitLab: https://salsa.debian.org/med-team/ncbi-tools6/commit/c526581f868b2845af42aa7df9edf7d8ce847117 You're receiving this email because of your account on salsa.debian.org.
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