Ставить файрфокс с официального сайта вполне можно. Но не с правами пользователя. Лучше пожертвовать автоматическими обновлениями (хотя я думаю, что придумать способ автоматизировать обновления так, чтобы при этом при нормальной работе пользователя не возникало риска - можно).
Кстати, в случае с убунтовским репозиторием, жертвовать ничем не придётся.
