Si no he entendido mal, lo que quieres hacer es unir las redes de dos
oficinas separadas y hacer la comunicación mediante Internet. no?
Si eso es correcto, lo que deberías hacer es crear una red privada
virtual o VPN. Mírate http://openvpn.net/
En el supuesto de que uses los dos terminales que quieres usar Debian
mírate http://eureka-linux.com.ar/docs/openvpn.html pero hay montones
de manuales en la red para su configuración.

Salud!
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jabber: triptik(at)12jabber.com

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