Si no he entendido mal, lo que quieres hacer es unir las redes de dos oficinas separadas y hacer la comunicación mediante Internet. no? Si eso es correcto, lo que deberías hacer es crear una red privada virtual o VPN. Mírate http://openvpn.net/ En el supuesto de que uses los dos terminales que quieres usar Debian mírate http://eureka-linux.com.ar/docs/openvpn.html pero hay montones de manuales en la red para su configuración.
Salud! -- jabber: triptik(at)12jabber.com