Quizá esto no viene mucho a cuento, pero ¿por qué no usas un kernel estable (2.6.1) en lugar de una versión test? Digo yo que así se podría acotar mejor el problema.
También sería interesante que compilaras el núcleo a la "manera Debian", que es bastante más sencilla y potente que la de toda la vida. Por si no tienes claro cómo hacerlo sigue esos pasos: - Instalas el paquete kernel-package. - Vas a /usr/src/linux y haces: make menuconfig | xconfig | gconfig (<-- como siempre) make-kpkg clean make-kpkg --revision=nombre_que_quieras_más_un_número kernel_image make-kpkg modules make-kpkg modules_image Ahora tendrás un deb en /usr/src que instalas con dpkg y punto. Él solito revisa el /etc/lilo.conf, ejecuta el /sbin/lilo y copia el núcleo a /boot. No tienes que hacer nada más. Así de fácil.