Cara Angela,

 

La maggioranza degli utenti di questa mailing list (incluso il team di
freesurfer, che mi ha chiesto di risponderti) non parla italiano. Per
comunicazioni future ti suggerirei di scrivere in inglese, in modo da
assicurarti assistenza diretta dal team.

 

Per preprocessare i tuoi dati devi seguire questi step:

 

1)      Utilizzando il comando 'setenv' devi specificare il path completo
della directory contenente i tuoi soggetti.

Per esempio, se la tua directory si trova in /DATI/SOGGETTI, devi usare il
comando: 

setenv SUBJECTS_DIR /DATI/SOGGETTI

 

2)      cd $SUBJECTS_DIR

3)      mkdir -p NOMESOGGETTO/mri/orig 

4)      mri_convert FILE_NAME.nii NOMESOGGETTO/mri/orig/001.mgz

5)      recon-all -s NOMESOGGETTO -autorecon-all

 

Questo dovrebbe funzionare. In bocca al lupo!

 

 

Marco

 

_____________________ 

 

Marco L. Loggia, PhD 

Postdoctoral Fellow, Mass General Hospital & Brigham and Women's Hospital 

Harvard Medical School 

 

CNY Building 120, suite 101E 

Charlestown, Massachusetts 02129 

Phone: (617) 643-7267 

Fax: (617) 643-7340 ma...@nmr.mgh.harvard.edu 

 

 

 

 

_______________________________________________
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