Quem forca o "desenho" dos rotulos das colunas (automaticamente) eh o
JScrollPane, e nao a propria tabela.
A maneira mais facil de fazer isso eh criando cada tabela dentro de um
JScrollPane. Usando o seu exemplo:

public class GUITest100 extends javax.swing.JFrame
{
    private final JTable[] tabela;

    public GUITest100(int parcelas)
    {
        tabela = new JTable[ parcelas ];
        JScrollPane spanes[] = new JScrollPane[parcelas];
        JTabbedPane jTabbedPane1 = new javax.swing.JTabbedPane();

        for(int i = 0; i < parcelas; i++)
        {
            tabela[ i ] = new JTable(600, 6);
            spanes[i] = new JScrollPane(tabela[i]);
            jTabbedPane1.addTab("tab" + i, spanes[i]);
        }

        getContentPane().add(jTabbedPane1, java.awt.BorderLayout.CENTER);

        pack();
    }

    public static void main(String args[])
    {
        new GUITest100(2).show();
    }
}

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