cual es el nuevo linux que te aparece en el menu de grub?, si ya no te inicia la X prueba reconfigurandola, que tarjeta tienes?.
de todos modos para reconfigurar la X prueba con: $su $Xorg -configure :1 luego de esto mueve el archivo nuevo al directorio de X11 $ mv /root/xorg.conf.new/ /etc/X11/xorg.conf con esos pasos el entorno grafico debería resucitar *OJO que si tienes drivers privativos (ati, o nvidia) el procedimiento sería otro. por ultimo reinstala GRUB a ver si se borra el "nuevo linux"