Javier: Hummm a ver ... Asumiendo que estas haciendo pruebas en tu misma maquina ... y si cumpliste todos los pasos de la publicacion bien.
A veces lo que puede provocar esto - como error es: - que tengas sistema operativo 64 bits y hayas instalado la version 32 bits de aspnet_regiis. Si no es asi - conta mas sobre las vesiones de OS y NET FRAMEWORK con las que estas trabajando en el servidor que usas para publicar. Atte AP