Hola a todos: Gracias a todos por sus valiosos comentarios. Terminé haciendo un pequeño programa en python utilizando la sugerencia de Antonio ($ join -a1 -11 -21 archivo1.txt archivo2.txt), el cual se me hizo muy práctico y muy sencillo y nada rebuscado. Para el script de python solo tuve que utilizar el modulo os. De ahi en fuera todo lo demás es como si estuvieras en una shell. Saludos!
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