In questo caso io ti consiglio VisualStudio Code, perchè è meno complicato di PyCharm, ma è meno da smanettoni di Atom.
Come materiale c'è anche Dive into Python <http://www.diveintopython3.net/> che copre le basi ed è il più famoso tra quelli disponibili gratuitamente (e forse lo trovi anche in italiano). Ci sono anche Learn Python the Hard Way <https://learnpythonthehardway.org/book/> e Hitchiker guide's to Python <http://docs.python-guide.org/en/latest/>, che parla più di come strutturare un progetto e regole pratiche da seguire. Infine awesome python <https://github.com/vinta/awesome-python>, cioè una lista dei più importanti e utili framework, librerie e strumenti di ogni sorta.
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