Ho provato con il tuo progetto ed effettivamente riscontro lo stesso problema. 
Nel mio test avevo sovrapposto un vettoriale ad un raster è il problema non si 
era presentato settando l’opacità direttamente al layer.

Da: Totò Fiandaca <pigrecoinfin...@gmail.com>
Inviato: sabato 30 marzo 2024 19:08
A: Ludovico Frate <ludovicofr...@hotmail.it>
Cc: Utenti QGIS it <qgis-it-user@lists.osgeo.org>
Oggetto: Re: [QGIS-it-user] Opacità simbolo e layer

Ciao Ludovico e grazie per il test.

Purtroppo da me succede, allego dati, progetto e stampe.
Per chi volesse testare il progetto:
ho realizzato due atlanti, uno con opacità simbolo 80% e l'altro con opacità 
layer 80%,
nel layout è sempre visibile il layer sotto, ma appena esporto l'atlante si 
verifica il problema

saluti

https://mega.nz/file/JNpXUR7A#nN3KVyRI3vFfQJvH4j9KHb-cOlgqbdiUQgxKaRYQHm4

Il giorno sab 30 mar 2024 alle ore 16:17 Ludovico Frate 
<ludovicofr...@hotmail.it<mailto:ludovicofr...@hotmail.it>> ha scritto:
Ciao, ho fatto un teste con la tua stessa configurazione (3.34.5 su W11) e non 
noto differenze nell’output di stampa.

Da: QGIS-it-user 
<qgis-it-user-boun...@lists.osgeo.org<mailto:qgis-it-user-boun...@lists.osgeo.org>>
 Per conto di Totò Fiandaca via QGIS-it-user
Inviato: venerdì 29 marzo 2024 19:33
A: Utenti QGIS it 
<qgis-it-user@lists.osgeo.org<mailto:qgis-it-user@lists.osgeo.org>>
Oggetto: [QGIS-it-user] Opacità simbolo e layer

In QGIS c'è la possibilità di utilizzare l'opacità sia per singolo simbolo che 
per intero layer.

Secondo voi è normale che nel compositore di stampe l'esito delle due opacità 
sia molto diverso?

Mi spiego con un esempio:
ho due layer sovrapposti, quello in cima:
1. applico opacità di layer 80% ai simboli;
2. applico opacità 80% al layer;

nella mapcanvas non noto grandi differenze vedo il layer sottostante,
ma quando stampo un layout, nel primo caso vedo il layer sottostante grazie 
all'opacità applicata; nel secondo caso non vedo il layer sottostante 
nonostante abbia applicato 80% di opacità al layer.

grazie

QGIS 3.34.5 - OSgeo4W

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