Ferraudo, tudo bem?
Cara, quando li a mensagem, pensei a mesma coisa! Cada dia aprendo mais
com o Walmes.
Parabéns, Walmes. Poucas vezes li uma explicação tão simples e didática
de uma análise de covariâncias.
Abs
Olympio
Em 09/05/2012 18:29, Guilherme Moraes Ferraudo escreveu:
Walmes, o mestre da didática. Parabéns!!
Walmes não deu para assistir a sua comunicação. Esepro que tenha
transcorrido tudo bem.
Abs
Em 9 de maio de 2012 16:05, Walmes Zeviani <[email protected]
<mailto:[email protected]>> escreveu:
Ivan,
Vamos primeiro primeiro apodar as arestas a fim de fazer a coisa
rolar. Você tem um experimento com um fator de 5 níveis nominais,
denominado de F. Cada animal é uma unidade experimental do qual se
observa uma resposta y e uma covariável x. Acredita-se que x afeta
y e portanto quer-se remover esse efeito para poder estudar a
variação explicada por F. Pode-se supor que F e x tenham efeitos
aditivos (sem interação) ou pode-se assumir que existe interação.
Na ausência de interação as diferenças entre níveis de F são as
mesmas sem importar o nível de x, mas o mesmo não vale para
presença de interação, de forma que, você deve definir
antecipadamente em que nível(is) de x quer comparar níveis de F.
Não sei o CMR é exatamente o que você tem, pois o CMR não parece
ser um caso de modelo misto porque animal é a unidade experimental
e não um fator de agrupamento (embora para Poisson este seja um
modelo estimável), enfim... vou considerar um glm fixo, daí é só
fazer as devidas extensões para o glmm.
da <- data.frame(F=gl(5,20), x=runif(5*20))
da$Ey <- with(da, exp(1+as.numeric(F)/2+(as.numeric(F)-2)/3*x))
da$y <- with(da, rpois(F,
lambda=exp(1+as.numeric(F)/2+(as.numeric(F)-2)/3*x)))
with(da, tapply(y, F, mean))
require(lattice)
xyplot(y~x, groups=F, data=da, type="a")
ac0 <- glm(y~F*x, data=da, family=poisson)
anova(ac0, test="Chisq")
betas <- coef(ac0)
require(doBy)
# médias populacionais marginais em x=0.5
mpm <- popMatrix(ac0, effect="F", at=list(x=0.5))
mpm%*%betas
exp(mpm%*%betas)
# diferença nas médias populacionais marginais duas à duas
nlevels(da$F)
comp <- t(combn(1:nlevels(da$F), 2))
rownames(comp) <- apply(comp, 1, paste, collapse="-")
dmpm <- t(apply(comp, 1, function(vs) mpm[vs[1],]-mpm[vs[2],]))
rownames(dmpm) <- rownames(comp)
apply(dmpm, 1, function(x) x%*%betas)
require(multcomp)
summary(glht(ac0, linfct=mpm)) # médias populacionais marginais
summary(glht(ac0, linfct=dmpm)) # contraste entre as médias
populacionais marginais
# na verdade isso não é a média, mas sim o exp() disso
E é isso aí Ivan. Esse procedimento aí que fiz foi o que deixou um
determinado software famoso por dar esses resultados aos usuários.
Trata-se de algo que, depois de fazer pela primeira vez e
entender, passa a ser trivial.
À disposição.
Walmes.
==========================================================================
Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S,
49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
fone: (+55) 41 3361 3573 <tel:%28%2B55%29%2041%203361%203573>
VoIP: (3361 3600) 1053 1173
e-mail: [email protected] <mailto:[email protected]>
twitter: @walmeszeviani
homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
<http://www.leg.ufpr.br/%7Ewalmes>
linux user number: 531218
==========================================================================
_______________________________________________
R-br mailing list
[email protected] <mailto:[email protected]>
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
forneça código mínimo reproduzível.
--
Guilherme Moraes Ferraudo
Jaboticabal/Campinas - SP
http://lattes.cnpq.br/2096118558794430
_______________________________________________
R-br mailing list
[email protected]
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
mínimo reproduzível.
_______________________________________________
R-br mailing list
[email protected]
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
mínimo reproduzível.
