Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
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Phone: (612) 323 9898
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Sent: Saturday, April 6, 2013 10:26 PM
Subject: Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por
krigagem
Thiago,
Já pensei isto, mas para SpatialPoints(vp), preciso fazer um list() das
coordenadas dos pixels (vp$x e vp$y) e isto não tenho e
nem sei como recuperar o valor de um pixel à partir de uma coordenada conhecida.
Abraço,
Alexandre
Em 06/04/2013 21:32, Thiago V. dos Santos escreveu:
Nao conheco bem todas as funcoes do sp, mas para pela mensagem de erro eu
transformaria a tabela vp em SpatialPoints, que
eh o argumento esperado pela funcao over.
Saudações,
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Thiago V. dos Santos
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Sent: Saturday, April 6, 2013 8:12 PM
Subject: Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por
krigagem
Boa noite pessoal,
Acho evoluí um pouco na questão, mas agora a dificuldade esta em contar
os pixels contidos no interior das malhas, quando
tento um over(), ocorre o seguinte erro:
Erro em function (classes, fdef, mtable) :
unable to find an inherited method for function "over", for signature "table",
"SpatialPolygons"
segue CRM:
#
require(geoR)
plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord X", ylab="Coord Y")
loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1), ncol=2)
text(loci, as.character(1:4), col="red")
polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)
# Fitting models with nugget fixed to zero
ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)
# defining the grid
pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51))
# kriging calculations
kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige = krige.control(obj.m = ml))
# displaying predicted values
image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)), xlab="Coord X", ylab="Coord
Y")
#
#Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2
p0<-c(0.1,0.1)
#
c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)
d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)
d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)
points(d1[,1],d1[,2],col="red")
ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)
hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)
abline(v=ver, col="red")
abline(h=hor, col="red")
#
require(sp)
grid=GridTopology(c(0.1,0.1), c(0.2,0.2), c(5,5))### Cria as área
grid=SpatialGrid(grid=grid)
class(grid) ## SpatialPixels
gridPol <- as(grid, "SpatialPolygons") ## Transfoma as areas em polígonos
espaciais
options(digits=5)
pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é dado por seq Xmaior -
Xmenor/l * Ymaior-Ymenor/l
vp <- table(area <- kc$predict)## Valor dos pixels
count.pix<-table(over(vp, gridPol)) #contar quantos pontos tem em cada area
Obrigado,
Alexandre
Em 06/04/2013 17:11, ASANTOS escreveu:
> Boa noite membros da lista,
>
> Gostaria de receber ideias para calcular o valor médio dos pixel em
uma imagem gerada por krigagem em sub-regiões de
interesse na imagem, por exemplo usando um exemplo do Prof. Paulo, onde
ajusta-se um semivariograma e faz a krigagem ordinária
dos dados:
>
> #
> require(geoR)
> plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord X", ylab="Coord
Y")
> loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1), ncol=2)
> text(loci, as.character(1:4), col="red")
> polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)
>
> # Fitting models with nugget fixed to zero
> ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)
>
> # defining the grid
> pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51))
> # kriging calculations
> kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige = krige.control(obj.m = ml))
> # displaying predicted values
> image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)), xlab="Coord X", ylab="Coord
Y")
> #
>
> #Agora vou dividir esta área em 25 partes e lançar os centroides destas
subáreas:
>
> #Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2
> p0<-c(0.1,0.1)
> #
> c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2)
> d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2)
> d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0)
> points(d1[,1],d1[,2],col="red")
> ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)
> hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0)
> abline(v=ver, col="red")
> abline(h=hor, col="red")
> #
>
> E aqui vem minha pergunta, como calcular o valor médio dos pixels contidos
em cada subárea de 0.2 x 0.2?
>
> Obrigado,
>
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Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
Coordenador do curso Técnico em Florestas
Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso
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Cáceres - MT CEP: 78.200-000
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO)
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https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
mínimo reproduzível.
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