Oie David e todos do grupo
Esses são os dados que eu tenho, com as espécies e a abundância de cada uma de
acordo com o registro.
> dat.alim[c(1:10),c(1:5)]
Reg PEI CAM BRA CRUS GAS
26 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados
27 1 6 0 0 0
28 1 0 5 0 0
29 3 0 0 0 0
30 0 0 1 0 0
31 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados
32 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados
33 2 3 1 0 0
34 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados
35 0 0 0 1 0
Também estou mandando os comandos que eu tenho para fazer o agrupamento, onde
tenho que retirar as linhas que contenham os zeros.
# Dissimilaridade e medidas de distancia para dados (semi) quantitativos
dat.alim2<- dat.alim [c(2:5,8,10:14,16,17,19:31,33,34,36,37,40:42,44:49),] #
nesse comando eu tive que eliminar as linhas com zeros para poder continuar
fazendo a dissimilaridade. É nesse ponto que eu preciso de ajuda. Sem eliminar
essas linhas com os zeros não funciona,mas eu preciso manter esses dados!
dis.bra <- vegdist(log1p(dat.alim2))# Bray-Curtis sobre dados transformados
por log
head(dis.bra)
Obrigada. Aguardo.
Att.,
Nathalia de Sousa Motta
Oceanógrafa/Oceanographer
Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca
________________________________
De: David Feitosa <[email protected]>
Para: [email protected]; Nathalia Sousa <[email protected]>
Enviadas: Sexta-feira, 3 de Janeiro de 2014 16:22
Assunto: Re: [R-br] Dúvida Análise de agrupamento
Nathalia,
Vc teria como dar um head/tail pra gente ter noção de uma amostra desses dados?
Creio que facilitaria para alguém responder e te ajudar.
Atenciosamente,
David Feitosa
(\_(\
(=°;°)
(("")("")
Em 3 de janeiro de 2014 14:25, Nathalia Sousa <[email protected]>
escreveu:
Boa tarde,
>
>
>Sou iniciante no R e queria uma ajuda com meus dados do mestrado.
>Estou tentando fazer uma análise de agrupamento (cluster) com dados de
>abundância de 5 espécies, porém tenho algumas datas que não tenho nenhum
>exemplar coletado. Na hora que vou tentar fazer o cluster, tenho que eliminar
>essas linhas vazias, mas eu preciso delas pois essas ausências das espécies
>são dados importantes, que quero analisar.
>Com os comandos que tenho, preciso tirar essas linhas, mas não posso e preciso
>fazer o cluster com todos esses dados.
> Alguém pode me ajudar com esses comandos???
>
>
>Desde já, agradeço.
>Aguardo.
>Att.,
>
>Nathalia de Sousa Motta
>Oceanógrafa/Oceanographer
>Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca
>_______________________________________________
>R-br mailing list
>[email protected]
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código
>mínimo reproduzível.
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