Isso é decorrente do que mencionei na mensagem anterior. Você só tem
plantio direto em um lugar. O efeito está confundido. Por isso o rank da
matriz é deficiente. Isso ocorre com toda classe de modelo pois de fato não
existe informação nos dados que permita identificar os parâmetros em
questão. Na lm() um NA aparece nas estimativas dos coeficientes.

> da <- data.frame(local=gl(4,5), sistema="PC", stringsAsFactors=FALSE)
> da$sistema[da$local=="4"] <- "PD"
> da <- as.data.frame(da, stringsAsFactors=TRUE)
> da$y <- rnorm(nrow(da))
> str(da)
'data.frame':    20 obs. of  3 variables:
 $ local  : Factor w/ 4 levels "1","2","3","4": 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 ...
 $ sistema: chr  "PC" "PC" "PC" "PC" ...
 $ y      : num  0.375 -0.646 -1.727 -1.764 -0.285 ...
> xtabs(~local+sistema, da)
     sistema
local PC PD
    1  5  0
    2  5  0
    3  5  0
    4  0  *5*
> m0 <- lm(y~local+sistema, data=da)
> coef(m0)
(Intercept)      local2      local3      local4   *sistemaPD*
 -0.8091214   0.6408831   0.5092444   0.2868672          *NA *
>

À disposição.
Walmes.
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