Prezado, espero colaborar,Favor add no seu '.emacs' ;;----------------------------------------------------------------------------- ;; Define C-y para fazer linha com 3 sinais de # (global-set-key [?\C-y] (kbd "C-u 0 3 #")) ;;-----------------------------------------------------------------------------
Vc pode trocar o y pelo que for mais conveniente para vc. obs: adaptado do Walmes Saudações Rafael Tieppo State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering site: http://www2.unemat.br/rafaeltieppo blog: https://sistemasagricolas.wordpress.com "Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente". On Thursday, November 5, 2015 11:00 AM, "[email protected]" <[email protected]> wrote: Enviar submissões para a lista de discussão R-br para [email protected] Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para [email protected] Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço [email protected] Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Re: Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? (André Figueiras Rutz) 2. Re: Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? (Felipe) 3. Re: quem é o autor de tanks.R ??? (Marcos Vital) 4. Re: Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística (Marcos Vital) 5. OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por ### (Augusto Ribas) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Wed, 4 Nov 2015 16:31:08 -0200 From: André Figueiras Rutz <[email protected]> To: [email protected] Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? Message-ID: <CAE7MPajKj=PL_67o9n-m7bh=8njxenkerqhups-h7my1hwy...@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caro Leonardo, Acompanhando as perguntas e respostas aprendi coisas interessantes como referência de início de estudo. Sua vontade em ajudar foi sim bastante útil. Obrigado pela sua contribuição. André Rutz Psicólogo Em 04/11/2015 11:53, "Leonardo Ferreira Fontenelle" < [email protected]> escreveu: > Em Ter 3 nov. 2015, às 22:33, andremoreirazoo escreveu: > > [...] > > Felipe, acho que o caminho é esse mesmo, mas você poderia me ajudar com > comentários nas linhas dos comandos? > > Apesar de gostar de estudar estatística a matemática da coisa não é o > meu forte. Então, uma ajuda para sabe do que se tratacada > comando/resultado me faria entender melhor. > > > André, > > Partindo do princípio de que você saiba os fundamentos de como usar o R, > você pode completar seu conhecimento lendo a ajuda para cada comando que > Felipe usou. Mesmo assim, eu não recomendo que você escreva código assim. > Como você disse, a parte matemática não é seu forte; se você tiver > conhecimento suficiente para escrever alguma coisa, ela provavelmente já > foi escrita. Pior ainda, você pode acabar deixando de usar uma alternativa > melhor, pois existe mais de uma forma de calcular intervalos de confiança. > > Por exemplo, o código que Felipe propões calcula o intervalo de confiança > da diferença de proporções usando o que se costuma chamar método de Wald. > Só que o R já dispõe de uma função para calcular o intervalo de confiança > para a diferença de proporções, que é o prop.test(). Essa função utiliza o > método dos escores de Wilson, que é uma alternativa superior ao método de > Wald > <http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.408.7107&rep=rep1&type=pdf>, > especialmente quando a amostra é pequena o suficiente para que isso faça > alguma diferença. > > Repito que existem pacotes como o "PropCIs" e o "binom" com funções que > provavelmente vão atender às suas necessidades, além dos pacotes de > epidemiologia. > > Se você precisa de ajuda para interpretar as estimativas fornecidas pelo > R, você precisa de um livro de estatística (ou epidemiologia). Se você > precisa ajuda para chegar a essas estimativas com o R, a gente pode lhe > ajudar. Mas, agora me ocorreu, talvez você nem precise do R. Dependendo da > complexidade das análises que você pretende realizar, você pode usar o > www.openepi.com. > > Espero ter ajudado mais do que confundido :) > > Leonardo Ferreira Fontenelle <http://lattes.cnpq.br/9234772336296638> > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/439fc86a/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 2 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:33:28 -0200 From: Felipe <[email protected]> To: [email protected] Subject: Re: [R-br] Chi-quadrado demonstra associação, mas e daí? Message-ID: <[email protected]> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed" André, Como o Leonardo disse no e-mail anterior, há pacotes que já calculam medidas como diferença de proporção OR, seus respectivos IC e outras medidas que podem atender suas necessidades no seu estudo. Além dos pacotes que ele já sugeriu, outro que pode consultar é o epiR: https://cran.r-project.org/web/packages/epiR/epiR.pdf Outra sugestão de leitura que gostaria de é o material da professora Silvia Shimakura: http://leg.ufpr.br/~silvia/CE008/ http://leg.ufpr.br/~silvia/CE001/node68.html Veja qual forma se apresenta mais interessante para seu aprendizado, mas quando escrevo as funções no R como calculadora, acredito que os exemplos se tornam mais didáticos mesmo que já implementados em alguns pacotes do R. E como solicitou segue alguns comentários acerca dos comandos que enviei anteriormente: ## Carregando os dados da tabela que enviou no e-mail dados<-matrix(c(250,15,34,14),ncol=2,byrow=T) ## Verificando a existência de associação entre os parasitas através da Estatística Qui-quadrado ## Quando utilizamos o teste o argumento sim=500, há um alerta pois há casela com frequência logo um pressuposto de validade do teste não foi atendido. ## Uma alternativa então é calcular o p-valor através de simulação ou o teste exato de Fisher. Note que quando simulamos o p-valor não é necessário usar a correção de continuidade de Yates. Q<-chisq.test(dados,sim=500) Q Q$observed ### frequência observada Q$expected ### frequência esperada ##Há evidências de se rejeitar H0 # Comandos para obtenção da diferença entre proporções e seu IC(95%) ## Calculando as proporções entre Cryptosporidium negativo e Cryptosporidium positivo p11<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,]))) p22<-(dados[1,1]/(sum(dados[1,]))) d<-p11-p21 # diferença entre as proporções vd<-((p11*(1-p11))/(sum(dados[1,])-1)) + ((p21*(1-p21))/(sum(dados[2,])-1)) ## Estimativa para a variância dvd<-sqrt(vd) ## raíz quadrada da variância z<-qnorm(0.975) #percentil da Normal padrão li<- d - (z*dvd) # Limite inferior ls<- d + (z*dvd) # Limite superior cbind(d,li,ls) # Intervalo de Confiança de 95%. Como o valor zero não está contido no IC a diferença é significativa ao nível de 95% de confiança. ##Razão de Chances ou Odds Ratio (OR) e IC95%(OR) OR<-(dados[1,1]*dados[2,2])/(dados[1,2]*dados[2,1]) ## Calculando a /*odds ratio (n11*n22/n12*n21) */## Quando OR=1 indica chances iguais. Se for OR>1, o grupo 1 apresenta maior chance que o grupo 2. ## Para o cálculo do IC para a OR, usamos o logaritmo da OR na base /e./ vf<-(1/dados[1,1])+(1/dados[1,2])+(1/dados[2,1]+(1/dados[2,2])) ##Estimativa para variância dpf<-sqrt(vf) ## raíz quadrada da variância z<-qnorm(0.975) #Percentil da Normal padrão liOR<-exp(log(OR)-z*dpf) #Limite inferior lsOR<-exp(log(OR)+z*dpf) # Limite Superior cbind(OR,liOR,lsOR) ## A chance de não haver Cryptosporidium e Giardia é 6,8 vezes maior que a presença podendo variar entre 3 e 15,4 vezes ao nível de confiança de 95%. -- Atenciosamente Felipe E. Barletta Mendes Estatístico - Conre3 9766-A +55 (41)-92077191 +55 (41)-33287216 -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/ae036f7d/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 3 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:17:27 -0300 From: Marcos Vital <[email protected]> To: [email protected] Subject: Re: [R-br] quem é o autor de tanks.R ??? Message-ID: <CAKLUGQ_d+SyHWigkh=byZMer0+=jiddyyjt1wqb8aczc1dl...@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Olá, Rodrigo. Fiz uma postagem falando da sua função, e mencionando alguns outros joguinhos no R. Está aqui, caso queira dar uma olhada: https://cantinhodor.wordpress.com/2015/10/25/tiros-explosoes-e-destruicao-a-grandiosa-batalha-dos-tanques-de-guerra-no-r/ Abraços! -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/62339867/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 4 Date: Wed, 4 Nov 2015 18:20:38 -0300 From: Marcos Vital <[email protected]> To: [email protected] Subject: Re: [R-br] Campanha de crowdfunding envolvendo o R e Bioestatística Message-ID: <CAKLUGQ9W5A2kT0jqZexPAu4u=notpubghknavquhldjarnu...@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Oi, pessoal Estou passando só para divulgar nossa campanha de financiamento uma última vez, pois estamos a uma semana do final. Relembrando: estamos usando uma campanha de financiamento coletivo para equipar o nosso laboratório e produzir material didático sobre diversos assuntos, incluindo um bocado de Bioestatística e suas aplicações no R. A campanha está aqui, para quem se interessar: http://www.kickante.com.br/campanhas/ciencia-livre-ecologia-e-bioestatistica-para-todos-0 Abraços! -- Marcos Vinícius Carneiro Vital Universidade Federal de Alagoas Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde Setor de Biodiversidade e Ecologia -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151104/1d033226/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 5 Date: Thu, 5 Nov 2015 10:38:13 -0300 From: Augusto Ribas <[email protected]> To: R-br Lista <[email protected]> Subject: [R-br] OFF TOPIC - Criar função no emacs para trocar # por ### Message-ID: <cacmkfrwn6hdtp_912pkhplwyzjjlcal+zaxkffuu9y26vtw...@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Ola a todos. Bem eu tenho usado o emacs como ide para o R, mas sempre tive alguns problemas com identação. Pelo que entendo, no emacs, ele le comentário como três #, tipo ###. Mais ou menos esse problema, mas com hashtag http://stackoverflow.com/questions/26312317/wrong-indentation-of-comments-in-emacs Assim quando eu ponho o comentário como um #, se dou um enter logo a frente desse #, o emacs identa e joga la pra frente. Pesquisando no google, eu achei gente reclamando da mesma coisa, e a solução que vi foi desligar a identação automática, o que é ruim, porque é legal o código identado bonitinho. Dai eu pensei, se teria como fazer uma função e deixar no .emacs , para que o emacs pega-se toda hora que eu digita-se #, ele transformasse em ###, porque ### funciona perfeito, mas é chato digitar três ###. Ai estou lendo esse tutorial https://www.masteringemacs.org/article/mastering-key-bindings-emacs E vendo que da para alterar o key-map do teclado, se entendi bem, e trocar teclas para outras funções, mas não estou conseguindo implementar isso pra deixar no .emacs para quando iniciar o emacs, toda hora que eu digitar #, na tela vira três ### Será que alguém poderia dar uma luz aqui? -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056 -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20151105/2c14d559/attachment-0001.html> ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list [email protected] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 59, assunto 5 ****************************************
_______________________________________________ R-br mailing list [email protected] https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
