Si quieres hacer un ANOVA 2F+Interacción, no puedes hacerlo con una tabla de doble entrada. No quedan grados para la interacción. El error experimental y la interacción están confundidos. Necesitas una tabla de triple entrada. Una entrada para el primer factor, otra para el segundo factor y una tercera entrada para las replicas de los tratamientos.

Si ordenas las observaciones en columnas, necesitarás cuatro: Variable respuesta, Primer factor, Segundo factor y las réplicas o individuos, para un ANOVA con Interacción.

Cada combinación de niveles de los dos factores son un tratamiento. Si no tienes réplicas en los tratamientos (casillas en otras terminologías) es imposible estimar la interacción. En realidad se toma como error experimental la interacción porque se asume que no existe y por tanto la medida de la variabilidad entre casillas está exclusivamente debida al error experimental.

No obstante puedes tratar de detectar la interacción. Existe un contraste de Aditividad de Tukey que permite, bajo algunos supuestos, detectar que la suposición de falta de interacción es falsa. No se puede estimar la interacción, porque está confundida con el error experimental, repito; pero al menos a veces se puede saber que no se puede aplicar el ANOVA sin interacción porque hay que tener en cuenta la interacción y se necesitan las réplicas de los tratamientos.

Actualmente existe un paquete dedicado a este problema que recoge el test de Tukey y otros posteriores que tratan el mismo problema:

https://cran.r-project.org/web/packages/additivityTests/

Saludos.
El 16/7/20 a las 17:48, David Aguinaga escribió:
Buenas tardes,

Tengo una tabla de doble entrada sobre la que deseo efectuar una análisis
anova de dos factores con interacción a través de Rcomander. La tabla tiene
esta forma:

ritmo
X Y Z
Altura A 10,15 10,22 15,24
B 11,22 14,3 65,31


Mi pregunta es:

¿Debo dar otra forma a la tabla para que Rcomander la reconozca? Por
ejemplo, así

cardio ritmo altura
10 X A
15 X A
11 X B
22 X B
(…) (…) (…)

¿O hay alguna forma para que Rcomander reconozca la tabla de doble entrada
a partir de Excel?

Gracias
David Aguinaga Abad

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