Estimado Carlos:
Hago lo que me dices y creo que poniéndote el
resultado seré más expresivo y claro, que tratando de explicarlo.
(r-reticulate) MacBook-Pro-de-Diego:~ Diego$ python
Could not find platform independent libraries <prefix>
Could not find platform dependent libraries <exec_prefix>
Consider setting $PYTHONHOME to <prefix>[:<exec_prefix>]
Python path configuration:
PYTHONHOME = (not set)
PYTHONPATH = (not set)
program name = '/anaconda3/bin/python'
isolated = 0
environment = 1
user site = 1
import site = 1
sys._base_executable = '/anaconda3/bin/python'
sys.base_prefix =
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol'
sys.base_exec_prefix =
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol'
sys.executable = '/anaconda3/bin/python'
sys.prefix =
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol'
sys.exec_prefix =
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol'
sys.path = [
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol/lib/
*python38.zip*',
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol/lib/
*python3.8*',
'/opt/concourse/worker/volumes/live/47090e1c-dc82-4ab8-7ab0-318c9b6b0520/volume/python_1593706456233/_h_env_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehold_placehol/lib/lib-dynload',
]
Fatal Python error: init_fs_encoding: failed to get the Python codec of the
filesystem encoding
Python runtime state: core initialized
ModuleNotFoundError: No module named 'encodings'
Current thread 0x00007fff72602000 (most recent call first):
<no Python frame>
(r-reticulate) MacBook-Pro-de-Diego:~ Diego$
Obviamente no está bien creado el entorno. Además he destacado del
resultado las referencias python3.8 que he visto, y que no pueden hallarse
porque yo tengo instalado python3.6.5, aunque sabía que estábamos ya en la
versión 3.8, pero no me había animado a instalarla porque no sé cómo
hacerla y tenía muchos otros asuntos entre manos, entre ellos un estudio de
NLP.
Ahora, visto esto, no sé qué hacer. Creo que voy a actualizar la versión de
python y también la de anaconda-navigator, que acabo de ver que está
desactualizada y, luego, voy a empezar de nuevo. Permitidme que os cuente
luego.
Muchísimas gracias. Atentamente.
Diego Martín Oliva.
El lun., 3 ago. 2020 a las 16:08, Carlos Ortega (<c...@qualityexcellence.es>)
escribió:
> Hola Diego,
>
> Prueba a hacer otra cosa.
>
> - Abre una consola y activa ese environment que has creado
> (r-reticulate)
> - Y una vez activado escribe "python". Entrarás a la consola de
> "python".
> - Ahí, escribe "import transformers"
> - Si no te devuelve error, es que en el entorno está bien instalado
> esa librería y por tanto el problema es de acceso desde "R".
>
> Gracias,
> Carlos Ortega
> www.qualityexcellence.es
>
> El lun., 3 ago. 2020 a las 13:53, Diego Martín (<ako.siste...@gmail.com>)
> escribió:
>
>> Estimados compañeros:
>>
>> Muchísimas gracias a todos por
>> responderme. Especialmente a Carlos Ortega que, como siempre, me ha vuelto
>> a enseñar el camino.
>>
>> El asunto era exactamente como
>> decía Carlos; habiendo yo aplicado la siguiente solución:
>>
>> library(reticulate)
>>
>> conda_create(envname = "r-reticulate",
>> packages = "python",
>> forge = TRUE,
>> channel = character(),
>> conda = "auto") # Create a new environment. No
>> muestro el resultado porque ha sido muy largo.
>> # Pero puedo resumirlo con la
>> siguiente función.
>> > conda_list()
>>
>> name
>> 1 anaconda3
>> 2 r-reticulate
>> 3 r-tensorflow
>> python
>> 1 /anaconda3/bin/python
>> 2 /anaconda3/envs/r-reticulate/bin/python
>> 3 /anaconda3/envs/r-tensorflow/bin/python
>>
>> py_install(
>> packages = c("transformers"),
>> envname = "r-reticulate",
>> method = c("conda"),
>> conda = "auto",
>> python_version = NULL,
>> pip = TRUE
>> ) # Tampoco saco el resultado porque es
>> igualmente largo, solo dejo la prueba
>> # de que fue bien.
>>
>> Solving environment: ...working... done
>>
>> Por tanto, parecería que todo está resuelto,
>> sobre todo tras cargar las librerías de keras, tensorflow, dplyr y
>> tfdatasets, como indica el post citado. Sin embargo, algo no debo estar
>> haciendo bien, porque el siguiente paso imprescindible para seguir
>> entendiendo el post, el que muestro ahora, da un error.
>>
>> > transformer <- reticulate::import(module = "transformers",
>> + as = NULL,
>> + convert = TRUE,
>> + delay_load = FALSE)
>> Error in py_module_import(module, convert = convert) :
>> ModuleNotFoundError: No module named 'transformers'
>>
>> Había yo creído que, habiendo ido bien
>> py_install, con el *package* transformers, no podría decirme ahora
>> import, que no hay un módulo llamado 'transformers'. De hecho vi como tras
>> acabar py_install, decía:
>>
>> Successfully built regex sacremoses
>>
>> Installing collected packages: urllib3, idna, chardet, requests,
>> pyparsing, six, packaging, regex, click, joblib, tqdm, sacremoses,
>> sentencepiece, numpy, tokenizers, filelock, *transformers*
>>
>> Successfully installed chardet-3.0.4 click-7.1.2 filelock-3.0.12
>> idna-2.10 joblib-0.16.0 numpy-1.19.1 packaging-20.4 pyparsing-2.4.7
>> regex-2020.7.14 requests-2.24.0 sacremoses-0.0.43 sentencepiece-0.1.91
>> six-1.15.0 tokenizers-0.8.1rc1 tqdm-4.48.1 *transformers-3.0.2*
>> urllib3-1.25.10
>>
>> Con lo cual, me pareció haber logrado el paso de
>> instalación pero, está claro que no es así, porque no daría sino, el error
>> en import de *ModuleNotFoundError*.
>>
>> Me resulta embarazoso, pero es que no lo veo.
>> No sé si alguno de ustedes ve lo que no hago bien.
>>
>> Muchas gracias una vez más. Atentamente.
>>
>> Diego Martín Oliva.
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> El dom., 2 ago. 2020 a las 23:00, Javier Marcuzzi (<
>> javier.ruben.marcu...@gmail.com>) escribió:
>>
>>> Estimados
>>>
>>> Una pregunta, ¿Que posibilidad hay que esté instalado todo
>>> correctamente, pero algo cambie en entorno de python, el cual al ser
>>> buscado por R esté dando problemas?
>>>
>>> Hace años que no utilizo macOS, pero se me ocurre que un programa
>>> coloque en entorno adecuado para él, pero al mismo tiempo este toque al
>>> entorno requerido por R.
>>>
>>> Javier Rubén Marcuzzi
>>>
>>> El dom., 2 ago. 2020 a las 15:59, Carlos Ortega (<
>>> c...@qualityexcellence.es>) escribió:
>>>
>>>> Hola Diego,
>>>>
>>>> El error que obtienes no es de usar una versión específica de Python,
>>>> si no
>>>> de encontrar un "environment" específico donde hacer la instalación con
>>>> "pip".
>>>> Mira aquí en la ayuda:
>>>>
>>>> https://rstudio.github.io/reticulate/articles/python_packages.html
>>>>
>>>> En la sección de "Conda" donde aparece cómo crear un entorno e
>>>> indicárselo
>>>> a R para que instale ahí tus nuevas librerías.
>>>>
>>>> Gracias,
>>>> Carlos Ortega
>>>> www.qualityexcellence.es
>>>>
>>>> El dom., 2 ago. 2020 a las 19:27, Diego Martín (<ako.siste...@gmail.com
>>>> >)
>>>> escribió:
>>>>
>>>> > Estimados compañeros:
>>>> >
>>>> > Estoy interesado en el NLP, así
>>>> que,
>>>> > al hallar el post State-of-the-art NLP models from R
>>>> > <
>>>> >
>>>> https://blogs.rstudio.com/ai/posts/2020-07-30-state-of-the-art-nlp-models-from-r/
>>>> > >,
>>>> > gracias a Carlos Ortega, me puse con ilusión a leerlo. Sin embargo,
>>>> tengo
>>>> > problemas con lo más básico, la instalación del paquete
>>>> *transformers*. No
>>>> > puedo continuar sin ello.
>>>> >
>>>> > El hecho es que me pasa lo
>>>> siguiente:
>>>> >
>>>> > > library(reticulate)
>>>> > > use_python("/usr/local/bin/python3.7")
>>>> > > Sys.which(c("python3.7"))
>>>> > python3.7
>>>> > "/usr/local/bin/python3.7"
>>>> > > py_install(packages = c("transformers"),
>>>> > + python_version = 'python3.7',
>>>> > + pip = TRUE)
>>>> > Error: could not find a Python environment for /usr/bin/python
>>>> >
>>>> > Vamos, que no puede encontrar donde
>>>> está
>>>> > Python en mi máquina. Pero yo creía haberlo dicho con:
>>>> > *use_python("/usr/local/bin/python3.7")*, lo cual había comprobado
>>>> > accediendo a consultar en el directorio de mi máquina oportunamente.
>>>> Lo
>>>> > muestro a continuación.
>>>> >
>>>> > MacBook-Pro-de-Diego:bin Diego$ pwd
>>>> >
>>>> > /usr/local/bin
>>>> >
>>>> > MacBook-Pro-de-Diego:bin Diego$ ls python*
>>>> >
>>>> > python python2.7-config python3.7m
>>>> >
>>>> > python-config python3 python3.7m-config
>>>> >
>>>> > python2 python3-config pythonw
>>>> >
>>>> > python2-config python3.7 pythonw2
>>>> >
>>>> > python2.7 python3.7-config pythonw2.7
>>>> >
>>>> > MacBook-Pro-de-Diego:bin Diego$
>>>> >
>>>> > Si pusiera python, sin
>>>> especificar 3.7,
>>>> > tampoco conseguiría más. Mirad.
>>>> >
>>>> > > use_python("/usr/local/bin/python")
>>>> > > Sys.which(c("python"))
>>>> > python
>>>> > "/usr/bin/python"
>>>> > > py_install(packages = c("transformers"),
>>>> > + python_version = 'python',
>>>> > + pip = TRUE)
>>>> > Error: could not find a Python environment for /usr/bin/python
>>>> >
>>>> > He mirado qué podría estar
>>>> pasando y
>>>> > como me dicen en R Interface to Python
>>>> > <https://rstudio.github.io/reticulate/>, tengo que especificar el
>>>> camino;
>>>> > pero eso he hecho, o al menos eso creo.
>>>> >
>>>> > Python en mi máquina está bien,
>>>> porque
>>>> > tengo Anaconda-Navigator y uso Spyder, y funciona muy bien. Es más
>>>> > recientemente he estado haciendo un curso usando este IDE, y no tuve
>>>> el más
>>>> > mínimo problema.
>>>> >
>>>> > Por favor, ¿alguno de ustedes
>>>> sabe qué
>>>> > podría estar pasándome?, ¿qué confundo o qué me falta?.
>>>> >
>>>> > Muchísimas gracias por adelantado
>>>> por
>>>> > la ayuda y paciencia que me presten.
>>>> >
>>>> > Diego Martín Oliva.
>>>> >
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>>>>
>>>> --
>>>> Saludos,
>>>> Carlos Ortega
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