I am trying to perform hierarchical clustering and evaluating it using
"ClusterCrit" Package, specially interested in precision and recall
for multi class problem, my code is attached.my problem is that in each
iteration even if my data is different in extCriteria() (used to evaluate
clustering based on various external criteria's) function but it is giving
same result every time.kindly helpthe program relies on data from
ClassCouplingData.txt file and it is read first as .csv file containing 32 by
32 data and it contains only numeric data & not stringA Great thanks in
advance......AMIT RATHEE
1 0.004 0 0.308 0.058 0.016 0.178 0.146 0.19 0.254
0.339 0.388 0.224 0.137 0.358 0.404 0.355 0.396 0.297 0.301
0.065 0.171 0.667 0.718 0.576 0.265 0.421 0.487 0.43 0.605
0.224 1.151
0.004 1 0.363 0.072 0.485 0.8 0.022 0.084 0.001 0.006
0.003 0.004 0.015 0.004 0.003 0.071 0.031 0.034 0.021 0.013
0.027 0.007 0.004 0.501 0.206 0.137 0.058 0.041 0.036 0.057
0.004 0.128
0 0.363 1 0.074 0 0.388 0.002 0.068 0 0
0.027 0 0.269 0 0 0.102 0.114 0.058 0.022 0.016
0 0.126 0 0.018 0 0.326 0.246 0.269 0.065 0.012
0 0.011
0.308 0.072 0.074 1 0.11 0.148 0.261 0.386 0.213 0.276
0.281 0.283 0.205 0.079 0.214 0.24 0.457 0.267 0.194 0.237
0.049 0.14 0.276 0.62 0.341 0.422 0.404 0.343 0.304 0.941
0.136 0.773
0.058 0.485 0 0.11 1 0.806 0.035 0.099 0 0.144
0.024 0.109 0 0.006 0.108 0.045 0.047 0.005 0.041 0.001
0.013 0 0.022 0.076 0.118 0.112 0.02 0.096 0.022 0.04
0.011 0.046
0.016 0.8 0.388 0.148 0.806 1 0.063 0.27 0.01 0.122
0.063 0.139 0.052 0.016 0.066 0.11 0.129 0.055 0.04 0.048
0.015 0.029 0.004 0.075 0.07 0.23 0.042 0.08 0.031 0.037
0 0.096
0.178 0.022 0.002 0.261 0.035 0.063 1 0.429 0.322 0.887
1.114 0.463 0.112 0.051 0.123 0.282 0.176 0.416 0.426 0.36
0.729 0.2 0.202 0.361 0.221 0.176 0.182 0.215 0.169 0.3
0.073 0.403
0.146 0.084 0.068 0.386 0.099 0.27 0.429 1 0.228 0.422
0.581 0.469 0.253 0.053 0.157 0.366 0.425 0.384 0.262 0.496
0.162 0.274 0.159 0.293 0.233 0.801 0.173 0.221 0.151 0.249
0.09 0.343
0.19 0.001 0 0.213 0 0.01 0.322 0.228 1 0.553
0.294 0.244 0.441 0.085 0.129 0.256 0.148 0.37 0.257 0.476
0.225 0.247 0.239 0.265 0.229 0.13 0.168 0.202 0.213 0.292
0.105 0.194
0.254 0.006 0 0.276 0.144 0.122 0.887 0.422 0.553 1
1.003 0.645 0.284 0.058 0.22 0.197 0.276 0.444 0.623 0.387
0.342 0.092 0.463 0.313 0.341 0.236 0.21 0.288 0.191 0.317
0.11 0.336
0.339 0.003 0.027 0.281 0.024 0.063 1.114 0.581 0.294 1.003
1 0.877 0.209 0.059 0.2 0.261 0.264 0.717 0.395 0.549
0.184 0.115 0.524 0.411 0.381 0.248 0.349 0.637 0.301 0.417
0.128 0.733
0.388 0.004 0 0.283 0.109 0.139 0.463 0.469 0.244 0.645
0.877 1 0.211 0.098 0.371 0.356 0.368 0.514 0.356 0.351
0.154 0.162 0.601 0.481 0.541 0.369 0.348 0.418 0.327 0.469
0.19 0.45
0.224 0.015 0.269 0.205 0 0.052 0.112 0.253 0.441 0.284
0.209 0.211 1 0.041 0.143 0.223 0.166 0.268 0.181 0.253
0.057 0.346 0.252 0.307 0.274 0.366 0.265 0.265 0.231 0.345
0.135 0.284
0.137 0.004 0 0.079 0.006 0.016 0.051 0.053 0.085 0.058
0.059 0.098 0.041 1 0.108 0.186 0.115 0.129 0.11 0.128
0.012 0.093 0.399 0.228 0.182 0.075 0.105 0.486 0.13 0.176
0.434 0.123
0.358 0.003 0 0.214 0.108 0.066 0.123 0.157 0.129 0.22
0.2 0.371 0.143 0.108 1 0.302 0.342 0.255 0.2 0.194
0.046 0.156 0.471 0.393 1.005 0.235 0.275 0.45 0.296 0.389
0.205 0.331
0.404 0.071 0.102 0.24 0.045 0.11 0.282 0.366 0.256 0.197
0.261 0.356 0.223 0.186 0.302 1 0.317 0.612 0.384 0.344
0.185 0.256 0.542 0.48 0.472 0.269 0.365 0.469 0.422 0.468
0.202 0.372
0.355 0.031 0.114 0.457 0.047 0.129 0.176 0.425 0.148 0.276
0.264 0.368 0.166 0.115 0.342 0.317 1 0.328 0.246 0.264
0.056 0.164 0.445 0.413 0.446 0.715 0.52 1.226 0.344 0.76
0.16 0.417
0.396 0.034 0.058 0.267 0.005 0.055 0.416 0.384 0.37 0.444
0.717 0.514 0.268 0.129 0.255 0.612 0.328 1 0.619 1.277
0.214 0.243 0.454 0.521 0.452 0.376 0.492 0.552 0.488 0.504
0.201 0.426
0.297 0.021 0.022 0.194 0.041 0.04 0.426 0.262 0.257 0.623
0.395 0.356 0.181 0.11 0.2 0.384 0.246 0.619 1 0.414
0.129 0.317 0.31 0.328 0.311 0.224 0.401 0.581 0.479 0.326
0.141 0.24
0.301 0.013 0.016 0.237 0.001 0.048 0.36 0.496 0.476 0.387
0.549 0.351 0.253 0.128 0.194 0.344 0.264 1.277 0.414 1
0.237 0.451 0.385 0.386 0.34 0.189 0.255 0.294 0.319 0.455
0.158 0.324
0.065 0.027 0 0.049 0.013 0.015 0.729 0.162 0.225 0.342
0.184 0.154 0.057 0.012 0.046 0.185 0.056 0.214 0.129 0.237
1 0.155 0.076 0.124 0.092 0.08 0.077 0.089 0.099 0.114
0.027 0.096
0.171 0.007 0.126 0.14 0 0.029 0.2 0.274 0.247 0.092
0.115 0.162 0.346 0.093 0.156 0.256 0.164 0.243 0.317 0.451
0.155 1 0.208 0.234 0.186 0.266 0.124 0.218 0.229 0.248
0.111 0.172
0.667 0.004 0 0.276 0.022 0.004 0.202 0.159 0.239 0.463
0.524 0.601 0.252 0.399 0.471 0.542 0.445 0.454 0.31 0.385
0.076 0.208 1 0.76 0.904 0.296 0.485 0.653 0.508 0.932
0.286 1.273
0.718 0.501 0.018 0.62 0.076 0.075 0.361 0.293 0.265 0.313
0.411 0.481 0.307 0.228 0.393 0.48 0.413 0.521 0.328 0.386
0.124 0.234 0.76 1 0.676 0.378 0.524 0.743 0.507 0.911
0.448 1.748
0.576 0.206 0 0.341 0.118 0.07 0.221 0.233 0.229 0.341
0.381 0.541 0.274 0.182 1.005 0.472 0.446 0.452 0.311 0.34
0.092 0.186 0.904 0.676 1 0.375 0.536 0.593 0.526 0.667
0.622 0.581
0.265 0.137 0.326 0.422 0.112 0.23 0.176 0.801 0.13 0.236
0.248 0.369 0.366 0.075 0.235 0.269 0.715 0.376 0.224 0.189
0.08 0.266 0.296 0.378 0.375 1 0.369 1.109 0.291 0.359
0.145 0.425
0.421 0.058 0.246 0.404 0.02 0.042 0.182 0.173 0.168 0.21
0.349 0.348 0.265 0.105 0.275 0.365 0.52 0.492 0.401 0.255
0.077 0.124 0.485 0.524 0.536 0.369 1 1.678 0.623 0.556
0.182 0.528
0.487 0.041 0.269 0.343 0.096 0.08 0.215 0.221 0.202 0.288
0.637 0.418 0.265 0.486 0.45 0.469 1.226 0.552 0.581 0.294
0.089 0.218 0.653 0.743 0.593 1.109 1.678 1 0.635 0.926
0.349 0.629
0.43 0.036 0.065 0.304 0.022 0.031 0.169 0.151 0.213 0.191
0.301 0.327 0.231 0.13 0.296 0.422 0.344 0.488 0.479 0.319
0.099 0.229 0.508 0.507 0.526 0.291 0.623 0.635 1 0.563
0.2 0.457
0.605 0.057 0.012 0.941 0.04 0.037 0.3 0.249 0.292 0.317
0.417 0.469 0.345 0.176 0.389 0.468 0.76 0.504 0.326 0.455
0.114 0.248 0.932 0.911 0.667 0.359 0.556 0.926 0.563 1
0.258 1.024
0.224 0.004 0 0.136 0.011 0 0.073 0.09 0.105 0.11
0.128 0.19 0.135 0.434 0.205 0.202 0.16 0.201 0.141 0.158
0.027 0.111 0.286 0.448 0.622 0.145 0.182 0.349 0.2 0.258
1 0.214
1.151 0.128 0.011 0.773 0.046 0.096 0.403 0.343 0.194 0.336
0.733 0.45 0.284 0.123 0.331 0.372 0.417 0.426 0.24 0.324
0.096 0.172 1.273 1.748 0.581 0.425 0.528 0.629 0.457 1.024
0.214 1
______________________________________________
R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html
and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
