Eu conheço o BioPerl. Mas eu preciso fazer essas pequenas rotinas eu mesmo.
Porque alem de serem pequenas pra necessitar de módulos externos, fica mais
portável para sistemas que nao possuem o BioPerl instalado. E também são
exercícios.
Mesmo assim obrigado.
Andre Carneiro <andregarciacarne...@gmail.com> escreveu:
Aureliano,
Você considerou usar Bioperl, para auxiliá-lo na 'lida' com bioinformática?
É uma biblioteca bastante madura e amplamente usada. Seria bom dar uma
olhada - http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page
https://metacpan.org/pod/distribution/BioPerl/BioPerl.pm
Atenciosamente
2014-11-07 20:35 GMT-02:00 Ronaldo Ferreira de Lima <jimmy....@gmail.com>:
> Saudações Aureliano,
>
> On Fri, Nov 07, 2014 at 02:03:08PM +0000, Aureliano Guedes wrote:
> [...]
> > o fato é que ainda não aprendi bem regex então não conhecia \w.
> [...]
> Sendo regexp uma limitação, você poderia fazer a manipulação de strings
> sem o uso de regexp neste caso. Dois exemplos (de provavelmente
> dezenas):
>
> 1. # Obs.: Destrói o conteúdo de $rna
> my @condom;
> push @condom, substr $rna, 0, 3, q() while length $rna > 2;
>
> 2. # Trata o conteúdo da scalar $rna como um filehandle
> local $/ = \3;
> open my $fh, q(<), \$rna;
> my @condom = <$fh>;
>
> []'s
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> "Não manejo bem as palavras
> Mas manipulo bem as strings."
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André Garcia Carneiro
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