Buen día a todos. Antes, quiero agradecer a todos lo que me han contestado.
La solución fue agregar las librerías que no encontraba en el archivo profile, de la siguiente forma. export PATH=$PATH:/usr/lib64/openmpi/bin LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/lib64:/usr/lib64/openmpi/lib:/usr/lib64/compat-openmpi/lib export LD_LIBRARY_PATH -------------------------------------- Librerias que no encontraba ---------------------------------- [root@elrond ~]# g_mdrun_openmpi g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libgmxpreprocess_openmpi.so.6: cannot open shared object file: No such file or directory -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Agradezco nuevamente por sus respuesta y dejo la solución para todas las personas que necesiten solucionar este tipo de problema de librerías con el Gromacs. Saludos y un gran abrazo para todos El 23 de mayo de 2012 10:12, Luciano Andrés Chiarotto <lachiaro...@gmail.com > escribió: > Otra cosa que hice fue configurar la rutas de la bibliotecas, me comento > un amigo que podía ser el problema. > > Crear un archivo openmpi.conf en el siguiente directorio. > > vi /etc/ld.so.conf.d/openmpi.conf > > y agregar en ese archivo la siguiente línea. > > /usr/lib64/openmpi/lib > Guardar y cerrar el archivo y luego ejecutar el siguiente comando. > > #ldconfig > > Después de todo esto volví a probar y no funcionó. (La reinicie completa > pero sigue todo igual). > > Saludos y desde ya muchas gracias por su aporte. Espero que esto también > les pueda servir a otra persona a resolver otros problemas. > > Luciano > > El 22 de mayo de 2012 16:01, Luciano Andrés Chiarotto < > lachiaro...@gmail.com> escribió: > > Hola Eduardo y a toda la comunidad. >> >> Gracias por tu respuesta pero sigue el mismo mensaje. >> >> [root@elrond ~]# g_mdrun_openmpi >> g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libmpi.so.0: >> cannot open shared object file: No such file or directory >> [root@elrond ~]# >> >> Busqué esa librería y se encuentra en la siguiente dirección. >> >> [root@elrond ~]# find / -iname libmpi.so.0 >> /usr/lib64/compat-openmpi/lib/libmpi.so.0 >> [root@elrond ~]# >> >> Si alguien tiene otra sugerencia se los voy agradecer. >> >> Desde ya muchas gracias. >> >> >> El 19 de mayo de 2012 20:56, Eduardo Grosclaude < >> eduardo.groscla...@gmail.com> escribió: >> >> 2012/5/16 Luciano Andrés Chiarotto <lachiaro...@gmail.com>: >>> > Hola a todos. >>> > >>> > La solución a medias que encontre en las páginas que me pasaron fue la >>> > siguiente. >>> > >>> > 1) -Agregar en el " /etc/profile " la siguientes líneas >>> > >>> > LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/lib64/openmpi/lib >>> > >>> > export $LD_LIBRARY_PATH >>> >>> Debería ser export LD_LIBRARY_PATH >>> >>> -- >>> Eduardo Grosclaude >>> Universidad Nacional del Comahue >>> Neuquen, Argentina >>> _______________________________________________ >>> CentOS-es mailing list >>> CentOS-es@centos.org >>> http://lists.centos.org/mailman/listinfo/centos-es >>> >> _______________________________________________ CentOS-es mailing list CentOS-es@centos.org http://lists.centos.org/mailman/listinfo/centos-es
