Re: [R] Pairwise table from cloumns
Hi
Keep your replies on the list, you can get more and better replies.
Do not post in HTML
combination of values is easily achieved e.g. by expand grid
expand.grid(mat[,1], mat[,2])
Regards
Petr
From: ameneh deljoo [mailto:amene.del...@gmail.com]
Sent: Tuesday, May 31, 2016 3:45 PM
To: PIKAL Petr
Subject: Re: [R] Pairwise table from cloumns
thanks for your reply.
I wanna a matrix with all possible combination of data. For example, a
combination of column 1 and 2.
{(1,2)(1,3)(1,4)(2,1)(2,3)(2,4)...}
On Tue, May 31, 2016 at 3:19 PM, PIKAL Petr
mailto:petr.pi...@precheza.cz>> wrote:
Hi
your message is rather scrambled and to be honest not well understandable (by
me).
having two column matrix
> mat<-matrix(1:8, 4,2)
> mat
[,1] [,2]
[1,]15
[2,]26
[3,]37
[4,]48
You can calculate eg. distance
> dist(mat, diag=T, upper=T)
1234
1 0.00 1.414214 2.828427 4.242641
2 1.414214 0.00 1.414214 2.828427
3 2.828427 1.414214 0.00 1.414214
4 4.242641 2.828427 1.414214 0.00
But from your description I do not understand how you want to reshape your data.
Example, please.
Regards
Petr
> -Original Message-
> From: R-help
> [mailto:r-help-boun...@r-project.org<mailto:r-help-boun...@r-project.org>] On
> Behalf Of ameneh
> deljoo
> Sent: Tuesday, May 31, 2016 12:13 PM
> To: r-help@r-project.org<mailto:r-help@r-project.org>
> Subject: [R] Pairwise table from cloumns
>
> *Hi Group
> **I have a large data set of individual pairwise values (100 rows) **that I**
> need to reshape into a pairwise matrix for mantel tests of similarity these
> values** .
> **I need this matrix for a Pathfinder network analysis. *
>
> *I have a different data(word) such as :*
>
>
>
>
>
> living thing
> 0
>
>
> animal
> 1
>
>
> blood
> 2
>
>
> bird
> 3
>
>
> feathers
> 4
>
>
> robin
> 5
>
>
> chicken
>
> 6
>
>
>
> *I need the final matrix to be formatted as based on the similarity
> ** A1A2A3A4
> ** A1 0 32 40 32
> * *A2 32049 38
> ** A3 4049 0 53
> ** A4 3238 53 0*
>
> **
>
>
> Are there any functions/packages that will make this easier? Thanks Ameneh
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
> __
> R-help@r-project.org<mailto:R-help@r-project.org> mailing list -- To
> UNSUBSCRIBE and more, see
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
> PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-
> guide.html
> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny
pouze jeho adresátům.
Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně
jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze
svého systému.
Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email
jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat.
Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či
zpožděním přenosu e-mailu.
V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání:
- vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a
to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu.
- a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout;
Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce
s dodatkem či odchylkou.
- trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným
dosažením shody na všech jejích náležitostech.
- odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost
žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně
pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně
osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi
či osobě jím zastoupené známá.
This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are
intended only for its intended recipients.
If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender.
Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from
your system.
If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to
use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner.
The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by
modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email.
In case that this e-mail forms part of business dealings:
- the sender reserves the right to end negotiations about entering into a
Re: [R] Pairwise table from cloumns
Hi your message is rather scrambled and to be honest not well understandable (by me). having two column matrix > mat<-matrix(1:8, 4,2) > mat [,1] [,2] [1,]15 [2,]26 [3,]37 [4,]48 You can calculate eg. distance > dist(mat, diag=T, upper=T) 1234 1 0.00 1.414214 2.828427 4.242641 2 1.414214 0.00 1.414214 2.828427 3 2.828427 1.414214 0.00 1.414214 4 4.242641 2.828427 1.414214 0.00 But from your description I do not understand how you want to reshape your data. Example, please. Regards Petr > -Original Message- > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of ameneh > deljoo > Sent: Tuesday, May 31, 2016 12:13 PM > To: r-help@r-project.org > Subject: [R] Pairwise table from cloumns > > *Hi Group > **I have a large data set of individual pairwise values (100 rows) **that I** > need to reshape into a pairwise matrix for mantel tests of similarity these > values** . > **I need this matrix for a Pathfinder network analysis. * > > *I have a different data(word) such as :* > > > > > > living thing > 0 > > > animal > 1 > > > blood > 2 > > > bird > 3 > > > feathers > 4 > > > robin > 5 > > > chicken > > 6 > > > > *I need the final matrix to be formatted as based on the similarity > ** A1A2A3A4 > ** A1 0 32 40 32 > * *A2 32049 38 > ** A3 4049 0 53 > ** A4 3238 53 0* > > ** > > > Are there any functions/packages that will make this easier? Thanks Ameneh > > [[alternative HTML version deleted]] > > __ > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- > guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny pouze jeho adresátům. Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze svého systému. Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu. V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce s dodatkem či odchylkou. - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are intended only for its intended recipients. If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from your system. If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. In case that this e-mail forms part of business dealings: - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any amendment or variation. - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon an express mutual agreement on all its aspects. - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of attorney is submitted to the recipient or the person represen
[R] Pairwise table from cloumns
*Hi Group **I have a large data set of individual pairwise values (100 rows) **that I** need to reshape into a pairwise matrix for mantel tests of similarity these values** . **I need this matrix for a Pathfinder network analysis. * *I have a different data(word) such as :* living thing 0 animal 1 blood 2 bird 3 feathers 4 robin 5 chicken 6 *I need the final matrix to be formatted as based on the similarity ** A1A2A3A4 ** A1 0 32 40 32 * *A2 32049 38 ** A3 4049 0 53 ** A4 3238 53 0* ** Are there any functions/packages that will make this easier? Thanks Ameneh [[alternative HTML version deleted]] __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
