Re: [R] how to plot annual values directly
Hi
By coincidence I will very soon have to do something similar. So I thought
this would be a practice run
Data is 10 years of daily rainfall data
str(arm)
'data.frame': 3640 obs. of 7 variables:
$ date : Date, format: "1990-01-01" "1990-01-02" "1990-01-03" "1990-01-04"
...
$ year : int 1990 1990 1990 1990 1990 1990 1990 1990 1990 1990 ...
$ month: int 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ day : int 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ rain : num 0 19 0 0 0 0 0 8.2 5.6 1 ...
$ doy : num 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ ym : Date, format: "1990-01-01" "1990-01-01" "1990-01-01" "1990-01-01"
...
head(arm)
date year month day rain doy ym
48578 1990-01-01 1990 1 10 1 1990-01-01
48579 1990-01-02 1990 1 2 19 2 1990-01-01
48580 1990-01-03 1990 1 30 3 1990-01-01
48581 1990-01-04 1990 1 40 4 1990-01-01
48582 1990-01-05 1990 1 50 5 1990-01-01
48583 1990-01-06 1990 1 60 6 1990-01-01
The ym is calculated using ?as.yearmon from the zoo package.
The zoo package may be useful because of its aggregating functions
Need mean daily rain - use whatever aggregation factor/function that you
need
arm.A <- aggregate(rain ~ year, arm, function(x) mean(x[x>0]) )
library(lattice)
xyplot(rain ~ date, arm,
groups = factor(arm$year),
ylim = c(0,60),
avg = arm.A$rain, #
panel = panel.superpose,
panel.groups = function(x, y, type, col,group.number,avg, ...) {
# plot daily values
panel.xyplot(x, y, col = "grey80", type = "h") # delete if
necessary
# plot average
panel.xyplot(x, avg[group.number], type = "l", col =
"black")
}
)
Regards
Duncan
Duncan Mackay
Department of Agronomy and Soil Science
University of New England
Armidale NSW 2351
Email: home: mac...@northnet.com.au
-Original Message-
From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li
Sent: Wednesday, 3 August 2016 04:10
To: R mailing list
Subject: [R] how to plot annual values directly
Hi R users,
I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to plot
annual mean or annual sum values directly? Thanks for your help.
df
year month day precip time
2010 1 10.5 2010-01-01
2010 1 20.8 2010-01-02
2010 1 31.0 2010-01-03
2010 1 40.9 2010-01-04
...
fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip)
show(fig1)
[[alternative HTML version deleted]]
__
R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html
and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
__
R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html
and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
Re: [R] how to plot annual values directly
Hi Other option is aggregate or ave, depending on how do you want to plot mean/sum values. You should think about posting an example of what do you have and what do you want to achieve (at least partly). Without that we are just guessing your real intention. Cheers Petr From: Ulrik Stervbo [mailto:ulrik.ster...@gmail.com] Sent: Wednesday, August 3, 2016 9:03 PM To: lily li <chocol...@gmail.com>; PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> Cc: R mailing list <r-help@r-project.org> Subject: Re: [R] how to plot annual values directly You could use dplyr: library(plyr) ddply(df, .variables = "year", summarise, mean.precip = mean(precip)) Hope this helps Ulrik On Wed, 3 Aug 2016 at 17:29 lily li <chocol...@gmail.com<mailto:chocol...@gmail.com>> wrote: I meant that my dataframe has daily data, but how to plot annual mean/sum directly? Thanks. On Wed, Aug 3, 2016 at 4:16 AM, PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz<mailto:petr.pi...@precheza.cz>> wrote: > Hi > > What do you mean to plot annual mean/sum directly? You can compute it by > aggregate function and add it to your plot, but I am not sure if it is > enough direct. > > Cheers > Petr > > > -Original Message- > > From: R-help > > [mailto:r-help-boun...@r-project.org<mailto:r-help-boun...@r-project.org>] > > On Behalf Of lily li > > Sent: Tuesday, August 2, 2016 8:10 PM > > To: R mailing list <r-help@r-project.org<mailto:r-help@r-project.org>> > > Subject: [R] how to plot annual values directly > > > > Hi R users, > > > > I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to > plot annual > > mean or annual sum values directly? Thanks for your help. > > > > df > > year month day precip time > > 2010 1 10.5 2010-01-01 > > 2010 1 20.8 2010-01-02 > > 2010 1 31.0 2010-01-03 > > 2010 1 40.9 2010-01-04 > > ... > > > > fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip) > > show(fig1) > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > __ > > R-help@r-project.org<mailto:R-help@r-project.org> mailing list -- To > > UNSUBSCRIBE and more, see > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- > > guide.html > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny pouze jeho adresátům. Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze svého systému. Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu. V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce s dodatkem či odchylkou. - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are intended only for its intended recipients. If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from your system. If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. In case that this e-mail forms part of business dealings: - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately accept such offer; The s
Re: [R] how to plot annual values directly
You could use dplyr: library(plyr) ddply(df, .variables = "year", summarise, mean.precip = mean(precip)) Hope this helps Ulrik On Wed, 3 Aug 2016 at 17:29 lily li <chocol...@gmail.com> wrote: > I meant that my dataframe has daily data, but how to plot annual mean/sum > directly? Thanks. > > On Wed, Aug 3, 2016 at 4:16 AM, PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> wrote: > > > Hi > > > > What do you mean to plot annual mean/sum directly? You can compute it by > > aggregate function and add it to your plot, but I am not sure if it is > > enough direct. > > > > Cheers > > Petr > > > > > -Original Message- > > > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily > li > > > Sent: Tuesday, August 2, 2016 8:10 PM > > > To: R mailing list <r-help@r-project.org> > > > Subject: [R] how to plot annual values directly > > > > > > Hi R users, > > > > > > I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to > > plot annual > > > mean or annual sum values directly? Thanks for your help. > > > > > > df > > > year month day precip time > > > 2010 1 10.5 2010-01-01 > > > 2010 1 20.8 2010-01-02 > > > 2010 1 31.0 2010-01-03 > > > 2010 1 40.9 2010-01-04 > > > ... > > > > > > fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip) > > > show(fig1) > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > __ > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- > > > guide.html > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > > > > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > > určeny pouze jeho adresátům. > > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě > > neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho > kopie > > vymažte ze svého systému. > > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento > email > > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi > > či zpožděním přenosu e-mailu. > > > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření > > smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně > přijmout; > > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > > příjemce s dodatkem či odchylkou. > > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve > > výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. > > - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za > > společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně > zmocněn > > nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi > tohoto > > emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich > > existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. > > > > This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are > > intended only for its intended recipients. > > If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its > > sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its > > copies from your system. > > If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not > > authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any > manner. > > The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage > > caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the > > email. > > > > In case that this e-mail forms part of business dealings: > > - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a > > contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. > > - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to > > immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes > > any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any &g
Re: [R] how to plot annual values directly
I meant that my dataframe has daily data, but how to plot annual mean/sum directly? Thanks. On Wed, Aug 3, 2016 at 4:16 AM, PIKAL Petr <petr.pi...@precheza.cz> wrote: > Hi > > What do you mean to plot annual mean/sum directly? You can compute it by > aggregate function and add it to your plot, but I am not sure if it is > enough direct. > > Cheers > Petr > > > -Original Message- > > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li > > Sent: Tuesday, August 2, 2016 8:10 PM > > To: R mailing list <r-help@r-project.org> > > Subject: [R] how to plot annual values directly > > > > Hi R users, > > > > I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to > plot annual > > mean or annual sum values directly? Thanks for your help. > > > > df > > year month day precip time > > 2010 1 10.5 2010-01-01 > > 2010 1 20.8 2010-01-02 > > 2010 1 31.0 2010-01-03 > > 2010 1 40.9 2010-01-04 > > ... > > > > fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip) > > show(fig1) > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > __ > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- > > guide.html > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > určeny pouze jeho adresátům. > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě > neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie > vymažte ze svého systému. > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi > či zpožděním přenosu e-mailu. > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření > smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > příjemce s dodatkem či odchylkou. > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve > výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. > - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za > společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn > nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto > emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich > existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. > > This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are > intended only for its intended recipients. > If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its > sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its > copies from your system. > If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not > authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. > The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage > caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the > email. > > In case that this e-mail forms part of business dealings: > - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a > contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. > - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to > immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes > any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any > amendment or variation. > - the sender insists on that the respective contract is concluded only > upon an express mutual agreement on all its aspects. > - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter > into any contracts on behalf of the company except for cases in which > he/she is expressly authorized to do so in writing, and such authorization > or power of attorney is submitted to the recipient or the person > represented by the recipient, or the existence of such authorization is > known to the recipient of the person represented by the recipient. > [[alternative HTML version deleted]] __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
Re: [R] how to plot annual values directly
Hi What do you mean to plot annual mean/sum directly? You can compute it by aggregate function and add it to your plot, but I am not sure if it is enough direct. Cheers Petr > -Original Message- > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li > Sent: Tuesday, August 2, 2016 8:10 PM > To: R mailing list <r-help@r-project.org> > Subject: [R] how to plot annual values directly > > Hi R users, > > I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to plot > annual > mean or annual sum values directly? Thanks for your help. > > df > year month day precip time > 2010 1 10.5 2010-01-01 > 2010 1 20.8 2010-01-02 > 2010 1 31.0 2010-01-03 > 2010 1 40.9 2010-01-04 > ... > > fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip) > show(fig1) > > [[alternative HTML version deleted]] > > __ > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting- > guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny pouze jeho adresátům. Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze svého systému. Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu. V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce s dodatkem či odchylkou. - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are intended only for its intended recipients. If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from your system. If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. In case that this e-mail forms part of business dealings: - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any amendment or variation. - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon an express mutual agreement on all its aspects. - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of attorney is submitted to the recipient or the person represented by the recipient, or the existence of such authorization is known to the recipient of the person represented by the recipient. __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
[R] how to plot annual values directly
Hi R users, I have a dataframe, with daily precipitation data, is it possible to plot annual mean or annual sum values directly? Thanks for your help. df year month day precip time 2010 1 10.5 2010-01-01 2010 1 20.8 2010-01-02 2010 1 31.0 2010-01-03 2010 1 40.9 2010-01-04 ... fig1 = ggplot()+ geom_path(data=df, aes(x=time, y= precip) show(fig1) [[alternative HTML version deleted]] __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
