Re: [R] about fitting a regression line
Did you perhaps accidentally include your response as a predictor? > On Jun 15, 2017, at 12:48 PM, lily li wrote: > > Thanks for your replies. I tried the regression, but then got a NA value > for the slope. And here is the error message: > Coefficients: (1 not defined because of singularities) > > > On Thu, Jun 15, 2017 at 12:20 AM, PIKAL Petr wrote: > >> Hi >> >> But X can be some function like - sin, cos, log, exp... >> >> Cheers >> Petr >> >>> -Original Message- >>> From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li >>> Sent: Thursday, June 15, 2017 1:28 AM >>> To: MacQueen, Don >>> Cc: R mailing list >>> Subject: Re: [R] about fitting a regression line >>> >>> Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the >> correlation >>> below: >>> Y= aX + b >>> >>> On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don >>> wrote: >>> >>>> Start with the lm() function; i.e., see >>>> >>>> ?lm >>>> >>>> -Don >>>> >>>> -- >>>> Don MacQueen >>>> >>>> Lawrence Livermore National Laboratory >>>> 7000 East Ave., L-627 >>>> Livermore, CA 94550 >>>> 925-423-1062 >>>> >>>> >>>> On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < >>>> r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> wrote: >>>> >>>>Hi R users, >>>> >>>>I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a >>>> pattern Yi = >>>>cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to use? >>>> Also, >>>>how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for any >>>> kind of >>>>help. >>>> >>>>[[alternative HTML version deleted]] >>>> >>>>__ >>>>R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see >>>>https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help >>>>PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ >>>> posting-guide.html >>>>and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. >>>> >>>> >>>> >>> >>> [[alternative HTML version deleted]] >>> >>> __ >>> R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see >>> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help >>> PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ >> posting-guide.html >>> and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. >> >> >> Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou >> určeny pouze jeho adresátům. >> Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě >> neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie >> vymažte ze svého systému. >> Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email >> jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. >> Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi >> či zpožděním přenosu e-mailu. >> >> V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: >> - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření >> smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. >> - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; >> Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany >> příjemce s dodatkem či odchylkou. >> - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve >> výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. >> - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za >> společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn >> nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto >> emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich >> existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. >> >> This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are >> intended only for its intended recipients. >> If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its >> sender. Delete the
Re: [R] about fitting a regression line
You really have to show what you did to get the result you showed. E.g., something like the following: > d <- data.frame(x=1:7, y=c(7,4,2,3,6,8,7)) > fit <- lm( y~cos(x), data=d) > coef(fit) (Intercept) cos(x) 5.0791903.022805 > sfit <- summary(fit) > sfit$r.squared [1] 0.9915548 > with(sfit, pf(fstatistic[1], fstatistic[2], fstatistic[3], lower=FALSE)) value 2.232099e-06 Bill Dunlap TIBCO Software wdunlap tibco.com On Thu, Jun 15, 2017 at 12:48 PM, lily li wrote: > Thanks for your replies. I tried the regression, but then got a NA value > for the slope. And here is the error message: > Coefficients: (1 not defined because of singularities) > > > On Thu, Jun 15, 2017 at 12:20 AM, PIKAL Petr > wrote: > > > Hi > > > > But X can be some function like - sin, cos, log, exp... > > > > Cheers > > Petr > > > > > -Original Message- > > > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily > li > > > Sent: Thursday, June 15, 2017 1:28 AM > > > To: MacQueen, Don > > > Cc: R mailing list > > > Subject: Re: [R] about fitting a regression line > > > > > > Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the > > correlation > > > below: > > > Y= aX + b > > > > > > On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don > > > wrote: > > > > > > > Start with the lm() function; i.e., see > > > > > > > > ?lm > > > > > > > > -Don > > > > > > > > -- > > > > Don MacQueen > > > > > > > > Lawrence Livermore National Laboratory > > > > 7000 East Ave., L-627 > > > > Livermore, CA 94550 > > > > 925-423-1062 > > > > > > > > > > > > On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < > > > > r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> > wrote: > > > > > > > > Hi R users, > > > > > > > > I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a > > > > pattern Yi = > > > > cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to > use? > > > > Also, > > > > how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for > any > > > > kind of > > > > help. > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > > > __ > > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, > see > > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > > > posting-guide.html > > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible > code. > > > > > > > > > > > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > __ > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > posting-guide.html > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > > > > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > > určeny pouze jeho adresátům. > > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě > > neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho > kopie > > vymažte ze svého systému. > > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento > email > > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi > > či zpožděním přenosu e-mailu. > > > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření > > smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně > přijmout; > > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > > příjemce s dodatkem či odchylkou. > > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve > > výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. > > - odesílatel
Re: [R] about fitting a regression line
Rather than just posting your error message, it helps immensely to post the code that produced the error--indeed with some small sample data that reproduces the problem. x <- rnorm(40) y <- 0.6 * x + rnorm(40, sd = 0.3) plot(y ~ x) model <- lm(y ~ cos(x)) summary(model) plot(y ~ cos(x)) abline(model, col = "red") ## obviously I am not claiming that this is a meaningful or sensible model ## It's just for illustrative purposes --Chris Ryan On Thu, Jun 15, 2017 at 3:48 PM, lily li wrote: > Thanks for your replies. I tried the regression, but then got a NA value > for the slope. And here is the error message: > Coefficients: (1 not defined because of singularities) > > > On Thu, Jun 15, 2017 at 12:20 AM, PIKAL Petr > wrote: > > > Hi > > > > But X can be some function like - sin, cos, log, exp... > > > > Cheers > > Petr > > > > > -Original Message- > > > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily > li > > > Sent: Thursday, June 15, 2017 1:28 AM > > > To: MacQueen, Don > > > Cc: R mailing list > > > Subject: Re: [R] about fitting a regression line > > > > > > Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the > > correlation > > > below: > > > Y= aX + b > > > > > > On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don > > > wrote: > > > > > > > Start with the lm() function; i.e., see > > > > > > > > ?lm > > > > > > > > -Don > > > > > > > > -- > > > > Don MacQueen > > > > > > > > Lawrence Livermore National Laboratory > > > > 7000 East Ave., L-627 > > > > Livermore, CA 94550 > > > > 925-423-1062 > > > > > > > > > > > > On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < > > > > r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> > wrote: > > > > > > > > Hi R users, > > > > > > > > I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a > > > > pattern Yi = > > > > cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to > use? > > > > Also, > > > > how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for > any > > > > kind of > > > > help. > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > > > __ > > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, > see > > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > > > posting-guide.html > > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible > code. > > > > > > > > > > > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > __ > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > posting-guide.html > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > > > > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > > určeny pouze jeho adresátům. > > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě > > neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho > kopie > > vymažte ze svého systému. > > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento > email > > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi > > či zpožděním přenosu e-mailu. > > > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření > > smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně > přijmout; > > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > > příjemce s dodatkem či odchylkou. > > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve > > výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. > > - odesílatel to
Re: [R] about fitting a regression line
Thanks for your replies. I tried the regression, but then got a NA value for the slope. And here is the error message: Coefficients: (1 not defined because of singularities) On Thu, Jun 15, 2017 at 12:20 AM, PIKAL Petr wrote: > Hi > > But X can be some function like - sin, cos, log, exp... > > Cheers > Petr > > > -Original Message- > > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li > > Sent: Thursday, June 15, 2017 1:28 AM > > To: MacQueen, Don > > Cc: R mailing list > > Subject: Re: [R] about fitting a regression line > > > > Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the > correlation > > below: > > Y= aX + b > > > > On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don > > wrote: > > > > > Start with the lm() function; i.e., see > > > > > > ?lm > > > > > > -Don > > > > > > -- > > > Don MacQueen > > > > > > Lawrence Livermore National Laboratory > > > 7000 East Ave., L-627 > > > Livermore, CA 94550 > > > 925-423-1062 > > > > > > > > > On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < > > > r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> wrote: > > > > > > Hi R users, > > > > > > I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a > > > pattern Yi = > > > cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to use? > > > Also, > > > how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for any > > > kind of > > > help. > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > > > __ > > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > > posting-guide.html > > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > > > > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > __ > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > posting-guide.html > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou > určeny pouze jeho adresátům. > Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě > neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie > vymažte ze svého systému. > Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email > jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. > Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi > či zpožděním přenosu e-mailu. > > V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: > - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření > smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. > - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; > Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany > příjemce s dodatkem či odchylkou. > - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve > výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. > - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za > společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn > nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto > emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich > existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. > > This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are > intended only for its intended recipients. > If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its > sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its > copies from your system. > If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not > authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. > The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage > caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the > email. > > In case that this e-mail forms part of business dealings: > - the
Re: [R] about fitting a regression line
Hi But X can be some function like - sin, cos, log, exp... Cheers Petr > -Original Message- > From: R-help [mailto:r-help-boun...@r-project.org] On Behalf Of lily li > Sent: Thursday, June 15, 2017 1:28 AM > To: MacQueen, Don > Cc: R mailing list > Subject: Re: [R] about fitting a regression line > > Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the correlation > below: > Y= aX + b > > On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don > wrote: > > > Start with the lm() function; i.e., see > > > > ?lm > > > > -Don > > > > -- > > Don MacQueen > > > > Lawrence Livermore National Laboratory > > 7000 East Ave., L-627 > > Livermore, CA 94550 > > 925-423-1062 > > > > > > On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < > > r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> wrote: > > > > Hi R users, > > > > I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a > > pattern Yi = > > cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to use? > > Also, > > how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for any > > kind of > > help. > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > > > __ > > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > > posting-guide.html > > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > > > > > > [[alternative HTML version deleted]] > > __ > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. Tento e-mail a jakékoliv k němu připojené dokumenty jsou důvěrné a jsou určeny pouze jeho adresátům. Jestliže jste obdržel(a) tento e-mail omylem, informujte laskavě neprodleně jeho odesílatele. Obsah tohoto emailu i s přílohami a jeho kopie vymažte ze svého systému. Nejste-li zamýšleným adresátem tohoto emailu, nejste oprávněni tento email jakkoliv užívat, rozšiřovat, kopírovat či zveřejňovat. Odesílatel e-mailu neodpovídá za eventuální škodu způsobenou modifikacemi či zpožděním přenosu e-mailu. V případě, že je tento e-mail součástí obchodního jednání: - vyhrazuje si odesílatel právo ukončit kdykoliv jednání o uzavření smlouvy, a to z jakéhokoliv důvodu i bez uvedení důvodu. - a obsahuje-li nabídku, je adresát oprávněn nabídku bezodkladně přijmout; Odesílatel tohoto e-mailu (nabídky) vylučuje přijetí nabídky ze strany příjemce s dodatkem či odchylkou. - trvá odesílatel na tom, že příslušná smlouva je uzavřena teprve výslovným dosažením shody na všech jejích náležitostech. - odesílatel tohoto emailu informuje, že není oprávněn uzavírat za společnost žádné smlouvy s výjimkou případů, kdy k tomu byl písemně zmocněn nebo písemně pověřen a takové pověření nebo plná moc byly adresátovi tohoto emailu případně osobě, kterou adresát zastupuje, předloženy nebo jejich existence je adresátovi či osobě jím zastoupené známá. This e-mail and any documents attached to it may be confidential and are intended only for its intended recipients. If you received this e-mail by mistake, please immediately inform its sender. Delete the contents of this e-mail with all attachments and its copies from your system. If you are not the intended recipient of this e-mail, you are not authorized to use, disseminate, copy or disclose this e-mail in any manner. The sender of this e-mail shall not be liable for any possible damage caused by modifications of the e-mail or by delay with transfer of the email. In case that this e-mail forms part of business dealings: - the sender reserves the right to end negotiations about entering into a contract in any time, for any reason, and without stating any reasoning. - if the e-mail contains an offer, the recipient is entitled to immediately accept such offer; The sender of this e-mail (offer) excludes any acceptance of the offer on the part of the recipient containing any amendment or variation. - the sender insists on that the respective contract is concluded only upon an express mutual agreement on all its aspects. - the sender of this e-mail informs that he/she is not authorized to enter into any contracts on behalf of the company except for cases in which he/she is expressly authorized to do so in writing, and such authorization or power of attorney is
Re: [R] about fitting a regression line
Thanks. I thought lm() function is for linear model, such as the correlation below: Y= aX + b On Wed, Jun 14, 2017 at 5:25 PM, MacQueen, Don wrote: > Start with the lm() function; i.e., see > > ?lm > > -Don > > -- > Don MacQueen > > Lawrence Livermore National Laboratory > 7000 East Ave., L-627 > Livermore, CA 94550 > 925-423-1062 > > > On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" < > r-help-boun...@r-project.org on behalf of chocol...@gmail.com> wrote: > > Hi R users, > > I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a pattern > Yi = > cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to use? > Also, > how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for any > kind of > help. > > [[alternative HTML version deleted]] > > __ > R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see > https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help > PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/ > posting-guide.html > and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. > > > [[alternative HTML version deleted]] __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
Re: [R] about fitting a regression line
Start with the lm() function; i.e., see ?lm -Don -- Don MacQueen Lawrence Livermore National Laboratory 7000 East Ave., L-627 Livermore, CA 94550 925-423-1062 On 6/14/17, 3:40 PM, "R-help on behalf of lily li" wrote: Hi R users, I have some data points (Xi, Yi), and they may follow such a pattern Yi = cCOS(Xi) + d, how to find the c and d in R? which function to use? Also, how to get the R2 and p value for this correlation? Thanks for any kind of help. [[alternative HTML version deleted]] __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code. __ R-help@r-project.org mailing list -- To UNSUBSCRIBE and more, see https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide http://www.R-project.org/posting-guide.html and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
