Re: [R-es] Hacer un Split plot

2023-10-11 Por tema Javier Marcuzzi 
Estimado Juan Bautista

¿A que se refiere con dos editores diferentes? ¿Editor de texto, de código R, o 
en código R escribir dos funciones diferentes?

Observando usted escribe model y luego model2.aov, antes de continuar, ¿que 
posibilidad hay que el algoritmo de cálculo sea diferente? Porque si 
internamente hay referencia a dos algoritmos diferentes, librerías o paquetes, 
el resultado puede variar. 

En lo personal me pasó recrear el ejemplo de un libro, y los resultados no me 
daban, consulté al autor, y la respuesta fue que en el libro había unos 5 
datos, este tenía impreso todos los pasos con las matrices, numerito por 
numerito, en cambio el algoritmo estaba preparado para una gran cantidad de 
números, en otras palabras, al aumentar los cálculos los valores se aproximaban 
unos a otros, pero en una gran cantidad de cálculos la memoria o poder de 
procesamiento del procesador informático quedaría bloqueado, de ahí la 
diferencia entre el algoritmo del libro y el optimizado. ¿Que posibilidades hay 
que usted tenga alguna semejanza a esto?

Javier Rubén Marcuzzi

> El 11 oct 2023, a las 08:36, Manuel Mendoza  
> escribió:
> 
> Por si te fuera de utilidad, esta es la respuesta de chat GPT 4.0
> 
> Parece que tienes un par de problemas y preguntas aquí. Intentaré ayudarte 
> paso a paso.
> 
> ### Problema 1: Error en la Separación de Medias HSD por Tratamiento
> 
> Sobre el código que estás utilizando para la separación de medias, el error 
> específico que estás recibiendo `argument "trt" is missing, with no default` 
> posiblemente se relaciona con la función `HSD.test`. Vamos a revisar el 
> bloque de código que has compartido:
> 
> ```r
> by(, $TRAT, function(x) {
>   anova_result <- aov(RTOSE ~ CORTE, data = x)
>   HSD_result <- HSD.test(anova_result)
>   Tratamiento <- unique(x$TRAT)
>   return(list(Tratamiento = TRAT, HSD_result = HSD_result))
> })
> ```
> 
> Si estás utilizando la función `HSD.test` del paquete `agricolae`, asegúrate 
> de proporcionar todos los argumentos necesarios para esta función, que serían 
> el objeto de anova, el nombre del tratamiento y el nivel de significancia. 
> Por ejemplo:
> 
> ```r
> HSD_result <- HSD.test(anova_result, "CORTE", group=TRUE, console=TRUE)
> ```
> 
> Además, asegúrate de que la variable `TRAT` está disponible en el scope de tu 
> función; en tu código, pareces utilizar `Tratamiento` para almacenar el valor 
> único de `x$TRAT`, pero intentas devolver una variable llamada `TRAT` que no 
> está definida. Tal vez quisiste hacer esto:
> 
> ```r
> return(list(Tratamiento = Tratamiento, HSD_result = HSD_result))
> ```
> 
> ### Problema 2: Comparación de Dos Métodos para ANOVA de Split Plot
> 
> Tienes dos bloques de código para ANOVA:
> 
> 1. `model <- with(CEPAS, sp.plot(REP, CEPA, VARIEDAD, trAUDPC))`
> 2. `model2.aov <- aov(trAUDPC ~ CEPA*VARIEDAD + REP + Error(REP/CEPA))`
> 
> Dado que no tengo toda la información sobre las funciones y los datos, es un 
> poco difícil decir con certeza si ambos realizan un ANOVA de split plot de la 
> misma manera. 
> 
> - La función `sp.plot` no es estándar en R y puede ser parte de un paquete 
> específico o un script personalizado que no estoy familiarizado con. Si 
> proporcionas más información sobre esta función, podría ayudarte mejor.
> - La segunda línea de código parece utilizar la función `aov` de una manera 
> que podría ser coherente con un diseño de split plot, especificando un 
> término de error estratificado `Error(REP/CEPA)`, pero sin tener acceso a los 
> datos y más contexto, es un poco difícil de verificar.
> 
> Si los resultados que obtienes son diferentes, aquí hay algunas cosas que 
> querrás revisar:
> 
> - **Datos**: Asegúrate de que los datos que se están utilizando son 
> exactamente los mismos en ambos análisis.
> - **Modelo**: Verifica que los modelos que estás ajustando sean equivalentes 
> y apropiados para tu diseño experimental.
> - **Hipótesis**: Confirma que las hipótesis que se están probando sean las 
> mismas.
> 
> Recuerda que proporcionar un ejemplo reproducible (datos de ejemplo y código) 
> es la mejor manera de obtener ayuda específica y precisa. Si puedes compartir 
> más detalles, estaré encantado de ayudarte más!
> 
> El mié, 11 oct 2023 a las 10:32, Relloso Barrio, Juan Bautista 
> () escribió:
>> Buenos días.
>> 
>> Perdón por insistir. Quiero hacer un ANOVA para unos datos que tienen un 
>> diseño Split plot.
>> 
>> Y estoy utilizando dos editores diferentes, que, si todo fuera correcto y ya 
>> que toman los mismos datos, me debería dar el mismo resultado, … pero no es 
>> así.
>> 
>> Querría saber si básicamente los dos hacen un análisis de varianza SPLIT 
>> PLOT ?. Y el mismo análisis?
>> 
>> Los comandos que doy son estos:
>> 
>> CEPAS, es el nombre del archivo de datos.
>> 
>> model<-with(CEPAS, sp.plot(REP, CEPA, VARIEDAD, trAUDPC))
>> 
>> Y el otro es este
>> 
>> model2.aov<- aov(trAUDPC~CEPA*VARIEDAD+REP+Error(REP/CEPA))
>> 
>>  
>> 
>>  Un saludo.

Re: [R-es] Hacer un Split plot

2023-10-11 Por tema Manuel Mendoza 
Por si te fuera de utilidad, esta es la respuesta de chat GPT 4.0

Parece que tienes un par de problemas y preguntas aquí. Intentaré ayudarte
paso a paso.

### Problema 1: Error en la Separación de Medias HSD por Tratamiento

Sobre el código que estás utilizando para la separación de medias, el error
específico que estás recibiendo `argument "trt" is missing, with no
default` posiblemente se relaciona con la función `HSD.test`. Vamos a
revisar el bloque de código que has compartido:

```r
by(, $TRAT, function(x) {
  anova_result <- aov(RTOSE ~ CORTE, data = x)
  HSD_result <- HSD.test(anova_result)
  Tratamiento <- unique(x$TRAT)
  return(list(Tratamiento = TRAT, HSD_result = HSD_result))
})
```

Si estás utilizando la función `HSD.test` del paquete `agricolae`,
asegúrate de proporcionar todos los argumentos necesarios para esta
función, que serían el objeto de anova, el nombre del tratamiento y el
nivel de significancia. Por ejemplo:

```r
HSD_result <- HSD.test(anova_result, "CORTE", group=TRUE, console=TRUE)
```

Además, asegúrate de que la variable `TRAT` está disponible en el scope de
tu función; en tu código, pareces utilizar `Tratamiento` para almacenar el
valor único de `x$TRAT`, pero intentas devolver una variable llamada `TRAT`
que no está definida. Tal vez quisiste hacer esto:

```r
return(list(Tratamiento = Tratamiento, HSD_result = HSD_result))
```

### Problema 2: Comparación de Dos Métodos para ANOVA de Split Plot

Tienes dos bloques de código para ANOVA:

1. `model <- with(CEPAS, sp.plot(REP, CEPA, VARIEDAD, trAUDPC))`
2. `model2.aov <- aov(trAUDPC ~ CEPA*VARIEDAD + REP + Error(REP/CEPA))`

Dado que no tengo toda la información sobre las funciones y los datos, es
un poco difícil decir con certeza si ambos realizan un ANOVA de split plot
de la misma manera.

- La función `sp.plot` no es estándar en R y puede ser parte de un paquete
específico o un script personalizado que no estoy familiarizado con. Si
proporcionas más información sobre esta función, podría ayudarte mejor.
- La segunda línea de código parece utilizar la función `aov` de una manera
que podría ser coherente con un diseño de split plot, especificando un
término de error estratificado `Error(REP/CEPA)`, pero sin tener acceso a
los datos y más contexto, es un poco difícil de verificar.

Si los resultados que obtienes son diferentes, aquí hay algunas cosas que
querrás revisar:

- **Datos**: Asegúrate de que los datos que se están utilizando son
exactamente los mismos en ambos análisis.
- **Modelo**: Verifica que los modelos que estás ajustando sean
equivalentes y apropiados para tu diseño experimental.
- **Hipótesis**: Confirma que las hipótesis que se están probando sean las
mismas.

Recuerda que proporcionar un ejemplo reproducible (datos de ejemplo y
código) es la mejor manera de obtener ayuda específica y precisa. Si puedes
compartir más detalles, estaré encantado de ayudarte más!

El mié, 11 oct 2023 a las 10:32, Relloso Barrio, Juan Bautista
() escribió:

> Buenos días.
>
> Perdón por insistir. Quiero hacer un ANOVA para unos datos que tienen un
> diseño Split plot.
>
> Y estoy utilizando dos editores diferentes, que, si todo fuera correcto y
> ya que toman los mismos datos, me debería dar el mismo resultado, … pero no
> es así.
>
> Querría saber si básicamente los dos hacen un análisis de varianza SPLIT
> PLOT ?. Y el mismo análisis?
>
> Los comandos que doy son estos:
>
> CEPAS, es el nombre del archivo de datos.
>
> model<-with(CEPAS, sp.plot(REP, CEPA, VARIEDAD, trAUDPC))
>
> Y el otro es este
>
> model2.aov<- aov(trAUDPC~CEPA*VARIEDAD+REP+Error(REP/CEPA))
>
>
>
>  Un saludo.
>
> *Juan Bautista Relloso Barrio*
>
> Coordinador de Equipos e Infraestructuras | Técnico de Cultivos del
> Departamento de Producción Vegetal
>
> Talde eta Azpiegitura Koordinatzailea | Laborantza teknikaria Landare
> Ekoizpen Departamentua
>
> jbauti...@neiker.eus | M. 688 62 98 14
>
> *www.neiker.eus* 
> 
>  
> 
>
> *[image: ej_ekonomia_garapen_lateral]*  [image:
> https://www.emakunde.euskadi.eus/contenidos/informacion/violencia_puntolila/eu_def/adjuntos/punto.lila.jpg]
>
>
>
> PRIBATUTASUN POLITIKA  | 
> POLÍTICA
> DE PRIVACIDAD  | LEGAL NOTICE
> 
>
>
>
>
>
>
>
> *De:* R-help-es  *En nombre de *Relloso
> Barrio, Juan Bautista
> *Enviado el:* viernes, 22 de septiembre de 2023 16:18
> *Para:* r-help-es@r-project.org
> *Asunto:* [R-es] no encuentro el error
>
>
>
> Buenas tardes.
>
> Intento hacer la separación de medias “por tratamientos”
>
> Pero me da un error que no consigo corregir. No sé que hago mal. Os paso
> los comandos y el error
>
>
>
> # Separación de medias HSD por Tratamiento No funciona
>
> by(, $TRA

Re: [R-es] Hacer un Split plot

2023-10-11 Por tema Relloso Barrio, Juan Bautista 
Buenos días.
Perdón por insistir. Quiero hacer un ANOVA para unos datos que tienen un diseño 
Split plot.
Y estoy utilizando dos editores diferentes, que, si todo fuera correcto y ya 
que toman los mismos datos, me debería dar el mismo resultado, … pero no es así.
Querría saber si básicamente los dos hacen un análisis de varianza SPLIT PLOT 
?. Y el mismo análisis?
Los comandos que doy son estos:
CEPAS, es el nombre del archivo de datos.
model<-with(CEPAS, sp.plot(REP, CEPA, VARIEDAD, trAUDPC))
Y el otro es este
model2.aov<- aov(trAUDPC~CEPA*VARIEDAD+REP+Error(REP/CEPA))

 Un saludo.
Juan Bautista Relloso Barrio
Coordinador de Equipos e Infraestructuras | Técnico de Cultivos del 
Departamento de Producción Vegetal
Talde eta Azpiegitura Koordinatzailea | Laborantza teknikaria Landare Ekoizpen 
Departamentua
jbauti...@neiker.eus  | M. 688 62 98 14
www.neiker.eus
[cid:image001.png@01D9FC2D.E9B85580]  
 [cid:image002.png@01D9FC2D.E9B85580]  
[cid:image003.png@01D9FC2D.E9B85580]   
[cid:image004.png@01D9FC2D.E9B85580] 
[cid:image005.png@01D9FC2D.E9B85580][ej_ekonomia_garapen_lateral]   

[https://www.emakunde.euskadi.eus/contenidos/informacion/violencia_puntolila/eu_def/adjuntos/punto.lila.jpg]

PRIBATUTASUN POLITIKA | POLÍTICA 
DE PRIVACIDAD | LEGAL 
NOTICE



De: R-help-es 
mailto:r-help-es-boun...@r-project.org>> En 
nombre de Relloso Barrio, Juan Bautista
Enviado el: viernes, 22 de septiembre de 2023 16:18
Para: r-help-es@r-project.org
Asunto: [R-es] no encuentro el error

Buenas tardes.
Intento hacer la separación de medias “por tratamientos”
Pero me da un error que no consigo corregir. No sé que hago mal. Os paso los 
comandos y el error

# Separación de medias HSD por Tratamiento No funciona
by(, $TRAT, function(x) {
  anova_result <- aov(RTOSE ~ CORTE, data = x)
  HSD_result <- HSD.test(anova_result)
  Tratamiento <- unique(x$TRAT)
  return(list(Tratamiento = TRAT, HSD_result = HSD_result))
})
Y el error es este:
Error in pmatch(trt, names(A)) :
argument "trt" is missing, with no default

 Un saludo.
Juan Bautista Relloso Barrio
Coordinador de Equipos e Infraestructuras | Técnico de Cultivos del 
Departamento de Producción Vegetal
Talde eta Azpiegitura Koordinatzailea | Laborantza teknikaria Landare Ekoizpen 
Departamentua
jbauti...@neiker.eus  | M. 688 62 98 14
www.neiker.eus
[cid:image001.png@01D9FC2D.E9B85580]  
 [cid:image002.png@01D9FC2D.E9B85580]  
[cid:image003.png@01D9FC2D.E9B85580]   
[cid:image004.png@01D9FC2D.E9B85580] 
[cid:image005.png@01D9FC2D.E9B85580][ej_ekonomia_garapen_lateral]   

[https://www.emakunde.euskadi.eus/contenidos/informacion/violencia_puntolila/eu_def/adjuntos/punto.lila.jpg]

PRIBATUTASUN POLITIKA | POLÍTICA 
DE PRIVACIDAD | LEGAL 
NOTICE



De: Carlos Ortega mailto:c...@qualityexcellence.es>>
Enviado el: lunes, 18 de septiembre de 2023 23:04
Para: Relloso Barrio, Juan Bautista 
mailto:jbauti...@neiker.eus>>
CC: r-help-es@r-project.org
Asunto: Re: [R-es] Boxplot ordenados...

Hola Juan,

Sí, te recomiendo que uses la librería "ggeasy" que simplifica mucho estas 
modificaciones, mejor que trabajar directamente con "ggplot".
Sería así:

#-
library(ggeasy)

ggplot(data = AÑOS, aes(x = VARIEDAD, y = rAUDPCor, colour = ANO,
 group = ANO)) +
  stat_summary(fun = mean, geom = "point") +
  stat_summary(fun = mean, geom = "line") +
  labs(y  =  'mean rAUDPCor') +
  labs(x  =  'Variety') +
  theme_bw() +
easy_rotate_x_labels( angle = 90)

#


Gracias,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es

El lun, 18 sept 2023 a las 22:47, Relloso Barrio, Juan Bautista 
(mailto:jbauti...@neiker.eus>>) escribió:
Buenas noches.
Quisiera saber si alguien me puede decir como en estos comandos para un gráfico 
…


ggplot(data = AÑOS, aes(x = VARIEDAD, y = rAUDPCor, colour = ANO,
 group = ANO)) +
  stat_summary(fun = mean, geom = "point") +
  stat_summary(fun = mean, geom = "line") +
  labs(y  =  'mean rAUDPCor') +
  labs(x  =  'Variety') +
  theme_bw()

Qué debo de añadir para que la orientación de las los nombres de las variedades 
del eje “X” me aparezcan en vertical en vez de en horizontal.
Muchas gracias.
U