Re: [R-es] Significancia de clusters

2019-06-12 Por tema Francisco Maturana
Estimado Fernando, un paquete que me ha dado muy buenos resultados es
FactoMinerR
http://factominer.free.fr/
Además, tiene un amplio soporte
Aca la web del desarrollador que te deja unos videos
https://francoishusson.wordpress.com/2017/08/04/clustering-with-factominer/

tanto conceptuales como del uso de las funciones

Saludos
Fco





>
> Asuntos del día:
>
>1. Significancia de clusters (Fernando Archuby)
>
> --
>
> Message: 1
> Date: Sat, 8 Jun 2019 12:21:16 -0300
> From: Fernando Archuby 
> To: r-help-es@r-project.org
> Subject: [R-es] Significancia de clusters
> Message-ID:
>  as51mc...@mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Buenos días/tardes/noches.
>
> Estoy analizando datos de conteos de especies por muestra (paleontología,
> pero es similar a un estudio de comunidades actules). Mi matriz consiste en
> 112 muestras y 113 especies. Probé diferentes estrategias para armar
> clusters con significado (paleo) biológico. Las dos opciones que me quedé
> son la distancia Chord y Bray-Curtis (sobre el log x+1 de las
> proporciones), en los dos casos con UPGMA. Bien, me encontré con un
> problema al querer evaluar la relevancia (significación) de los clusters
> con el paquete pvclust(), que hace un remuestreo con diferentes tamaños
> muestrales y calcula una especie de probabilidad de significación de cada
> cluster (nodo). Bien, pude hacerlo, siguiendo instrucciones de Borcard et
> al (2018) para el caso de Chord pero no Bray-Curtis. No me doy cuenta de
> cómo especificar el método de cálculo de la matriz de distancia
> (disimilitud)En pvclust() se debe especificar el método de cálculo de
> las distancias (dist.method) pero entre las opciones no encuentro cómo
> calcular la distancia de Bray-Curtis. Díganme qué otra info puedo darles
> para ampliar. Y muchas gracias!
>
> http://127.0.0.1:30722/library/pvclust/html/pvclust.html
>
> Borcard, D., Gillet, F., & Legendre, P. (2018). Numerical Ecology with R.
> https://doi.org/10.1007/978-3-319-71404-2
>
> Saludos,
>
> Fernando.
>
>
> --
>
> *Dr. Fernando M. Archuby*
> CONICET-UNLP
> Teléfono Personal: +54-221-15-6129667.
> farch...@gmail.com
>
>



-- 
Francisco Maturana Miranda
Dr. Planificación territorial, urbanismo y dinámicas del espacio
Profesor Asociado, Departamento de Geografía Universidad Alberto Hurtado
www.fmaturana.cl

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R-help-es mailing list
R-help-es@r-project.org
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es


Re: [R-es] Muchas gracias

2019-05-15 Por tema Francisco Maturana
Estimados Andrés González y José Antonio, muchas gracias por las sugerencias
con eso seguiré avanzando
Saludos
Francisco


El mié., 15 de may. de 2019 a la(s) 16:58, 
escribió:

> Envíe los mensajes para la lista R-help-es a
> r-help-es@r-project.org
>
> Para subscribirse o anular su subscripción a través de la WEB
> https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es
>
> O por correo electrónico, enviando un mensaje con el texto "help" en
> el asunto (subject) o en el cuerpo a:
> r-help-es-requ...@r-project.org
>
> Puede contactar con el responsable de la lista escribiendo a:
> r-help-es-ow...@r-project.org
>
> Si responde a algún contenido de este mensaje, por favor, edite la
> linea del asunto (subject) para que el texto sea mas especifico que:
> "Re: Contents of R-help-es digest...". Además, por favor, incluya en
> la respuesta sólo aquellas partes del mensaje a las que está
> respondiendo.
>
>
> Asuntos del día:
>
>1. Re: Unir coordenas en un plano mediante linea (andre...@ugr.es)
>2. Identificar por coordenadas geográficas una calle de una
>   ciudad (Diego Martín)
>3. Re: Unir coordenas en un plano mediante linea
>   (José Antonio Palazón Ferrando)
>4. Re:  Identificar por coordenadas geográficas una calle de una
>   ciudad (rubenfcasal)
>5. Re: Como reordenar datos para analisis multiples
>   correspondencias (MCA) (Juan Abasolo)
>
> --
>
> Message: 1
> Date: Wed, 15 May 2019 12:23:53 +0200
> From: "andre...@ugr.es" 
> To: r-help-es@r-project.org
> Subject: Re: [R-es] Unir coordenas en un plano mediante linea
> Message-ID: <2bacfc37-6ae7-d842-4afc-20c9b6792...@ugr.es>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> x=c(1,7,3)
>
> y=c(12,3,5)
>
> plot(x,y,type="n")
>
> polygon(x,y)
>
> Si no quieres que lo cierre
>
> polygon(x,y,fillOddEven = FALSE)
>
> El 14/05/2019 a las 17:15, Francisco Maturana escribió:
> > Buenos días, tengo 3 pares de coordenadas x,y para un conjunto de
> ciudades.
> > Estas son un punto cada una, pero quiero hacer un gráfico (en un plano x
> e
> > y) que una con una línea estos 3 puntos. He intentando pero no lo logro.
> > Alguien me podría orientar por favor.
> > Saludos y desde ya gracias
> > Francisco
> >
> > El juego de datos de ejemplo
> > Dim1(x) Dim2(y)
> > Constitucion -0.73 0.45
> > Constitucion -0.59 -0.76
> > Constitucion 0.23-0.34
> > Coronel -0.50 1.27
> > Coronel -0.24 -1.67
> > Coronel 1.70   -1.61
> > Penaflor   -0.09-0.46
> > Penaflor   -0.21-1.26
> > Penaflor 2.53   -0.90
> >
> >   [[alternative HTML version deleted]]
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> > R-help-es@r-project.org
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> *Andrés González Carmona *
>
> Catedrático
> Departamento de Estadística e Investigación Operativa
> Universidad de Granada
>
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>
>
>
>
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> Message: 2
> Date: Wed, 15 May 2019 13:16:26 +0200
> From: Diego Martín 
> To: "r-help-es@r-project.org" 
> Subject: [R-es] Identificar por coordenadas geográficas una calle de
> una ciudad
> Message-ID:
> <
> cakhhlbkh0bdwpqhlam0od0uuyixzkuxd+dx26vnbtjzej0g...@mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
>
> Saludos estimados compañeros:
>¿Alguno de ustedes sabe de alguna librería con la que geolocalizar
>  una calle de una ciudad española?, aunque no cuenten nada más que aquellas
> a partir de un umbral de población.
> Muchas gracias.
>
> [[alternative HTML version deleted]]
>
>
>
>
> --
>
> Message: 3
> Date: Wed, 15 May 2019 13:39:41 +0200
> From: José Antonio Palazón Ferrando 
> To: r-help-es@r-project.org
> Subject: Re: [R-es] Unir coordenas en un plano mediante linea
> Message-ID: <63cefd4a-d08c-d3d1-4486-6a359d93e...@um.es>
> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
>
> Hola:
>
> Entiendo que quieres un polígono por cada nivel de "dirección",
> si es así, con esto, o algo mejor, los resuelves:
>
> x <- read.table( text = "
>Constitucion -0.73  0.45
>Constitucion -0.59 -0.76
>Constitucion  0.23 -0.34
>Coronel 

Re: [R-es] Unir coordenas en un plano mediante linea

2019-05-14 Por tema Francisco Maturana
Buenos días, tengo 3 pares de coordenadas x,y para un conjunto de ciudades.
Estas son un punto cada una, pero quiero hacer un gráfico (en un plano x e
y) que una con una línea estos 3 puntos. He intentando pero no lo logro.
Alguien me podría orientar por favor.
Saludos y desde ya gracias
Francisco

El juego de datos de ejemplo
   Dim1(x) Dim2(y)
Constitucion -0.73 0.45
Constitucion -0.59 -0.76
Constitucion 0.23-0.34
Coronel -0.50 1.27
Coronel -0.24 -1.67
Coronel 1.70   -1.61
Penaflor   -0.09-0.46
Penaflor   -0.21-1.26
Penaflor 2.53   -0.90

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