Re: [R-es] Problema con shiny en Fedora

2017-07-25 Por tema Guillermo.Vinue 
Hola Freddy,

Muchas gracias por la respuesta. Lo he probado y no ha funcionado. Una vez 
ejecutado update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)​, cuando entro en R 
desde la terminal con: 
$ sudo R 

y ejecuto la app:

> library(shiny)
> runExample("01_hello")

me aparece el mensaje de error que adjunto en un txt.

En cambio, cuando entro en R desde la terminal simplemente con:
$ R 
sí que me aparece la aplicación de 01_hello y funciona bien.

Viendo el mensaje de error, he probado a poner google-chrome como servidor por 
defecto (en lugar de firefox), pero entrando con $ sudo R la app sigue sin 
abrirse y entrando con $ R sí que se sigue abriendo, es decir, la app se abre 
en el servidor que esté definido por defecto, que es como debería ser, tanto 
entrando con $ sudo R como desde RStudio, donde tampoco se abre.

He mirado si es un problema de las librerías y RStudio y R sin ser root tienen 
las mismas:

$ sudo R
> libPaths()
[1] "/usr/lib64/R/library" 
[2] "/usr/share/R/library"

$ R
> libPaths()
[1] "/home/guillevinue/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4"
[2] "/usr/lib64/R/library"   
[3] "/usr/share/R/library" 

En RStudio:
> .libPaths()
[1] "/home/guillevinue/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.4"
[2] "/usr/lib64/R/library"   
[3] "/usr/share/R/library" 

¿Alguna posible sugerencia?

Saludos,

Guillermo

> ​Hola Guillermo.
> ​
> 
> "Reinstalling packages with the new version of R" dice "The following code
> > should be run as root after upgrading R on Linux". Esto podría ser una
> > solución pero ciertamente no sé cómo hacerlo porque en la terminal:
> > $ sudo update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)
> > no se puede ejecutar.
> >
> 
> ​¿Servirá escribir desde la terminal
> 
> sudo R​
> >
> 
> ​ingresar la contraseña y luego actualizar con
> 
> update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)​
> 
> 
> ?
> 
> ​Haznos saber.
> 
> ¡Salud!​
> 
> -- 
> «Pídeles sus títulos a los que te persiguen, pregúntales
> cuándo nacieron, diles que te demuestren su existencia.»
> 
> Rafael Cadenas
> 

> library(shiny)
> runExample("01_hello")

Listening on http://127.0.0.1:6671
No protocol specified
Unable to init server: Could not connect: Connection refused
Error: cannot open display: :0
/usr/bin/xdg-open: line 832: x-www-browser: command not found
No protocol specified
Unable to init server: Could not connect: Connection refused
Error: cannot open display: :0
/usr/bin/xdg-open: line 832: iceweasel: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: seamonkey: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: mozilla: command not found
No protocol specified
Unable to init server: Could not connect: Connection refused
Failed to parse arguments: Cannot open display: 
/usr/bin/xdg-open: line 832: konqueror: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: chromium-browser: command not found
No protocol specified

(google-chrome:3239): Gtk-WARNING **: cannot open display: :0
/usr/bin/xdg-open: line 832: www-browser: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: links2: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: elinks: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: links: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: lynx: command not found
/usr/bin/xdg-open: line 832: w3m: command not found
xdg-open: no method available for opening 'http://127.0.0.1:6671'


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R-help-es@r-project.org
https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help-es

Re: [R-es] Problema con shiny en Fedora

2017-07-25 Por tema Freddy Omar López Quintero 
​Hola Guillermo.
​

"Reinstalling packages with the new version of R" dice "The following code
> should be run as root after upgrading R on Linux". Esto podría ser una
> solución pero ciertamente no sé cómo hacerlo porque en la terminal:
> $ sudo update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)
> no se puede ejecutar.
>

​¿Servirá escribir desde la terminal

sudo R​
>

​ingresar la contraseña y luego actualizar con

update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)​


?

​Haznos saber.

¡Salud!​

-- 
«Pídeles sus títulos a los que te persiguen, pregúntales
cuándo nacieron, diles que te demuestren su existencia.»

Rafael Cadenas

[[alternative HTML version deleted]]

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[R-es] Problema con shiny en Fedora

2017-07-25 Por tema Guillermo.Vinue 
Hola,

He actualizado las versiones con las que trabajo de Fedora, R y RStudio y shiny 
me ha dejado de funcionar. Cuando ejecuto simplemente:

library(shiny)
runExample("01_hello")

RStudio se cierra. He buscado en google con cosas similares a "Rstudio crashes 
shiny linux" y no me ha funcionado ninguna de las sugerencias que he 
encontrado. Tengo actualizados todos los paquetes. En este link:

https://shiny.rstudio.com/articles/upgrade-R.html

en el apartado "Reinstalling packages with the new version of R" dice "The 
following code should be run as root after upgrading R on Linux". Esto podría 
ser una solución pero ciertamente no sé cómo hacerlo porque en la terminal:
$ sudo update.packages(ask = FALSE, checkBuilt = TRUE)
no se puede ejecutar. 

Estos son los datos de las versiones con las que trabajo: ¿Alguien ha tenido un 
problema similar y sabe cómo resolverlo? Muchas gracias.

> RStudio.Version()
$mode
[1] "desktop"

$version
[1] ‘1.0.153’

> sessionInfo()
R version 3.4.1 (2017-06-30)
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
Running under: Fedora 26 (Workstation Edition)

Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /usr/lib64/R/lib/libRblas.so

locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8LC_NUMERIC=C   LC_TIME=en_US.UTF-8   
[4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8  LC_MONETARY=en_US.UTF-8   LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8LC_NAME=C   LC_ADDRESS=C  
[10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C  
 

attached base packages:
[1] stats graphics  grDevices utils datasets  methods   base 

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.1 tools_3.4.1 

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