Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
Hi. Em 24 de novembro de 2012 22:03, Blabos de Blebe escreveu: > "Três coisas são infinitas: o universo, a paciência do Breno e a Mas se o universo está em constante expansão, ele não é infinito, certo? Teoricamente o espaço é infinito, mas o universo não. Logo, a paciência do breno está acima do universo. LOL []'s ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
se vc considerar o universo como o espaço também... 2012/11/26 Junior Moraes > Hi. > > Em 24 de novembro de 2012 22:03, Blabos de Blebe escreveu: > > "Três coisas são infinitas: o universo, a paciência do Breno e a > > > Mas se o universo está em constante expansão, ele não é infinito, certo? > Teoricamente o espaço é infinito, mas o universo não. Logo, a paciência do > breno está acima do universo. LOL > > []'s > > ___ > Rio-pm mailing list > Rio-pm@pm.org > http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm > -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://pacman.blog.br ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
Oi a todos,
aproveitando a paciência infinita do Breno...
Poderias esclarecer como funciona isto:
(?...)
e o que acontece então aqui:
"valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};"
Criaste um hash de nome %+
É uma variável reservada?
Qual o valor que assume $mirna aqui?
Na primeira vez que entra no if, $mirna está vazio, não? Como pode ser key do
hash %dados assim?
[]'s
Nicole Scherer
De: breno
Para: Perl Mongers Rio de Janeiro
Enviadas: Sábado, 24 de Novembro de 2012 9:45
Assunto: Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
2012/11/24 Aureliano Guedes :
>
> Se não for ser muito chato, como faço para seguir a forma abaixo:
>
>
>> 2) trocar de abordagem, fazendo seu parser ler linha a linha (sem
>> modificar $/) e ir acumulando as linhas até encontrar um símbolo que
>> indique nova entrada.
>
> seria algo do tipo:
>
> while (<$fh>){
> if(/primeira linha/){
> print $_;
> }
> elsif (/ultima linha/){
> #sair do loop
> }
> else {
> print $_
> }
> }
>
Algo como (atenção, código não testado):
---8<---
my %dados = ();
my $mirna;
my $acumulador;
while (my $linha = <$fh>) {
if ( $linha =~ m{tag magica (?\S+)} ) {
$dados{$mirna} = $acumulador if $mirna;
$mirna = $+{mirna};
$acumulador = q();
}
else {
$acumulador .= $linha;
}
}
use DDP; p %dados;
--->8---
O que isso faz (ou deveria fazer: já mencionei que não testei?
Programar a essa hora da manhã não é meu forte, então favor
desconsiderar qualquer besteira):
1) le o arquivo linha por linha, atribuindo o valor de cada linha a
$linha (sem usar $_)
2) sempre que encontrar a tag mágica que separa entradas (estou
assumindo que a tag indica um novo registro que pode ser chave do seu
hash de dados:
2.1) se já estiver com um registro em memória ($mirna), bota os dados
acumulados ($acumulador) dentro do hash;
2.2) atribui à $mirna o novo registro encontrado. Note que estou
usando grupos nomeados na regex, fazendo (?...) em vez de apenas
(...). Isso funciona a partir do 5.10.0 e me permite acessar os
valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};
2.2) zera o acumulador.
3) se não encontrar a tag mágica, vai acumulando os dados. Dentro
desse 'else' vc pode fazer coisas como "next if $linha =~ /.../" caso
não queira guardar alguma linha, por exemplo.
4) Depois do while vc pode inspecionar %dados para saber se está tudo ok.
Entendeu?
[]s
-b
___
Rio-pm mailing list
Rio-pm@pm.org
http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm___
Rio-pm mailing list
Rio-pm@pm.org
http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
a partir de alguma versão recente (5.12 ?) introduziu os named groups. Vc
acessa atraves do hash %+ que é uma variavel especial "amarrada" a ultima
expressão regular daquele bloco de codigo.
criar variaveis é perigoso. se vc tem algo como
$password
não vai querer isso sobreescrito por
/(?.+)/
por isso vc acessa $+{password} o quanto antes, pois a proxima operação de
match vai resetar a variavel
2012/11/26 Nicole
> Oi a todos,
>
> aproveitando a paciência infinita do Breno...
>
> Poderias esclarecer como funciona isto:
> (?...)
>
> e o que acontece então aqui:
> "valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
> acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};"
>
> Criaste um hash de nome %+
> É uma variável reservada?
> Qual o valor que assume $mirna aqui?
> Na primeira vez que entra no if, $mirna está vazio, não? Como pode ser key
> do hash %dados assim?
>
> []'s
> Nicole Scherer
>
>
> --
> *De:* breno
> *Para:* Perl Mongers Rio de Janeiro
> *Enviadas:* Sábado, 24 de Novembro de 2012 9:45
> *Assunto:* Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
>
> 2012/11/24 Aureliano Guedes :
> >
> > Se não for ser muito chato, como faço para seguir a forma abaixo:
> >
> >
> >> 2) trocar de abordagem, fazendo seu parser ler linha a linha (sem
> >> modificar $/) e ir acumulando as linhas até encontrar um símbolo que
> >> indique nova entrada.
> >
> > seria algo do tipo:
> >
> > while (<$fh>){
> > if(/primeira linha/){
> > print $_;
> > }
> > elsif (/ultima linha/){
> > #sair do loop
> > }
> > else {
> > print $_
> > }
> > }
> >
>
> Algo como (atenção, código não testado):
>
> ---8<---
> my %dados = ();
> my $mirna;
> my $acumulador;
>
> while (my $linha = <$fh>) {
> if ( $linha =~ m{tag magica (?\S+)} ) {
> $dados{$mirna} = $acumulador if $mirna;
> $mirna = $+{mirna};
> $acumulador = q();
> }
> else {
> $acumulador .= $linha;
> }
> }
>
> use DDP; p %dados;
>
> --->8---
>
> O que isso faz (ou deveria fazer: já mencionei que não testei?
> Programar a essa hora da manhã não é meu forte, então favor
> desconsiderar qualquer besteira):
>
> 1) le o arquivo linha por linha, atribuindo o valor de cada linha a
> $linha (sem usar $_)
> 2) sempre que encontrar a tag mágica que separa entradas (estou
> assumindo que a tag indica um novo registro que pode ser chave do seu
> hash de dados:
> 2.1) se já estiver com um registro em memória ($mirna), bota os dados
> acumulados ($acumulador) dentro do hash;
> 2.2) atribui à $mirna o novo registro encontrado. Note que estou
> usando grupos nomeados na regex, fazendo (?...) em vez de apenas
> (...). Isso funciona a partir do 5.10.0 e me permite acessar os
> valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
> acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};
> 2.2) zera o acumulador.
> 3) se não encontrar a tag mágica, vai acumulando os dados. Dentro
> desse 'else' vc pode fazer coisas como "next if $linha =~ /.../" caso
> não queira guardar alguma linha, por exemplo.
> 4) Depois do while vc pode inspecionar %dados para saber se está tudo ok.
>
>
> Entendeu?
>
> []s
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Tiago B. Peczenyj
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Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
Esta sintaxe de expressão regular é chamada de "named capture". Surgiu no
Perl v5.10. Ao invés de $1, $2, $3, ..., você dá um nome legível à captura.
Por si só, já é bastante útil, mas a utilidade maior aparece na
possibilidade da construção de "grammars", similares a BNF (
https://pt.wikipedia.org/wiki/Formalismo_de_Backus-Naur#Exemplo).
Recomendo esse artigo para aprender a usar estes recursos:
http://www.effectiveperlprogramming.com/blog/1479
ABS()
2012/11/26 Nicole
> Oi a todos,
>
> aproveitando a paciência infinita do Breno...
>
> Poderias esclarecer como funciona isto:
> (?...)
>
> e o que acontece então aqui:
> "valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
> acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};"
>
> Criaste um hash de nome %+
> É uma variável reservada?
> Qual o valor que assume $mirna aqui?
> Na primeira vez que entra no if, $mirna está vazio, não? Como pode ser key
> do hash %dados assim?
>
> []'s
> Nicole Scherer
>
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> *De:* breno
> *Para:* Perl Mongers Rio de Janeiro
> *Enviadas:* Sábado, 24 de Novembro de 2012 9:45
> *Assunto:* Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
>
> 2012/11/24 Aureliano Guedes :
> >
> > Se não for ser muito chato, como faço para seguir a forma abaixo:
> >
> >
> >> 2) trocar de abordagem, fazendo seu parser ler linha a linha (sem
> >> modificar $/) e ir acumulando as linhas até encontrar um símbolo que
> >> indique nova entrada.
> >
> > seria algo do tipo:
> >
> > while (<$fh>){
> > if(/primeira linha/){
> > print $_;
> > }
> > elsif (/ultima linha/){
> > #sair do loop
> > }
> > else {
> > print $_
> > }
> > }
> >
>
> Algo como (atenção, código não testado):
>
> ---8<---
> my %dados = ();
> my $mirna;
> my $acumulador;
>
> while (my $linha = <$fh>) {
> if ( $linha =~ m{tag magica (?\S+)} ) {
> $dados{$mirna} = $acumulador if $mirna;
> $mirna = $+{mirna};
> $acumulador = q();
> }
> else {
> $acumulador .= $linha;
> }
> }
>
> use DDP; p %dados;
>
> --->8---
>
> O que isso faz (ou deveria fazer: já mencionei que não testei?
> Programar a essa hora da manhã não é meu forte, então favor
> desconsiderar qualquer besteira):
>
> 1) le o arquivo linha por linha, atribuindo o valor de cada linha a
> $linha (sem usar $_)
> 2) sempre que encontrar a tag mágica que separa entradas (estou
> assumindo que a tag indica um novo registro que pode ser chave do seu
> hash de dados:
> 2.1) se já estiver com um registro em memória ($mirna), bota os dados
> acumulados ($acumulador) dentro do hash;
> 2.2) atribui à $mirna o novo registro encontrado. Note que estou
> usando grupos nomeados na regex, fazendo (?...) em vez de apenas
> (...). Isso funciona a partir do 5.10.0 e me permite acessar os
> valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
> acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};
> 2.2) zera o acumulador.
> 3) se não encontrar a tag mágica, vai acumulando os dados. Dentro
> desse 'else' vc pode fazer coisas como "next if $linha =~ /.../" caso
> não queira guardar alguma linha, por exemplo.
> 4) Depois do while vc pode inspecionar %dados para saber se está tudo ok.
>
>
> Entendeu?
>
> []s
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Re: [Rio-pm] Usar API Google Maps.
Oi pessoal, Estou fazendo alguns testes com o módulo Geo::Code::GoogleMaps e outros módulos que por sua vez não são módulos para SIG (GIS) quando executo meu script ele retorna um erro afinando que não foi possível localizar o módulo no sistema. O problema de fato é que eu já instalei os módulos e na instalação não ocorreu erros. Isso acontece com outros módulos também. Estou usando ubuntu 12.04 e Debian 6, como posso resolver este problema? Erro: Can't locate Geo/Coder/GoogleMaps.pm in @INC (@INC contains: /etc/perl /usr/local/lib/perl/5.10.1 /usr/local/share/perl/5.10.1 /usr/lib/perl5 /usr/share/perl5 /usr/lib/perl/5.10 /usr/share/perl/5.10 /usr/local/lib/site_perl .) at GM_extractor.pl line 4. BEGIN failed--compilation aborted at GM_extractor.pl line 4. Em 21 de novembro de 2012 14:18, Gabriel Andrade escreveu: > > On Nov 19, 2012, at 2:02 PM, Cleysinho wrote: > > > Olá Pessoal, > > > > Estou em um trabalho que será parte da minha dissertação que envolve > Sistema de Informação Geográfica. Estou procurando uma forma de usar a API > do Google Maps dentro dos códigos em Perl para gerar mapas dinâmicos > conforme a consulta do usuário. Implementei uma Data Warehouse que possui > mais de 30.000 coordenadas geográficas de virus do mundo todo. Um sistema > semelhante que possui que estou usando como modelo é o GOLD - > http://www.genomesonline.org/cgi-bin/GOLD/index.cgi?page_requested=GenomeMap, > alguém poderia me dar uma sugestão do que usar para implementar esse mapa? > > > > Você pode popular esses dados num banco que possua suporte a indexação > geoespacial (GIS) e implementar uma API simples para consultar esses > dados. > > Construa uma página que carrega um mapa do Google Maps e utilize API > Javascript oferecida[1] para realizar consultas em sua API e carregar > os dados retornados no mapa. > > Um exemplo de uso seria realizar uma consulta à sua API passando o > atual viewport no mapa e retornando a lista de vírus contida naquela > área do mapa. O viewport pode ser obtido, por exemplo, através de um > evento de zoom disparado após a interação do usuário com o mapa. > > > [1] https://developers.google.com/maps/documentation/javascript/reference > ___ > Rio-pm mailing list > Rio-pm@pm.org > http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm > -- ** .: Inteligência Coletiva :. Uma inteligência distribuída por toda parte: tal é o nosso axioma inicial. Ninguém sabe tudo, todos sabem alguma coisa, todo o saber está na humanidade’. (Pierre Lévy) José Cleydson F. da Silva *O**pen Source Bioinformatics Community* http://opensourcebioinformatics.com ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
Obrigada, Stanislaw e Tiago,
lembro de ter visto isso na palestra do brian d foy no YAPC do ano passado, mas
nunca tinha usado.
Vou estudar esses artigos.
Obrigada!
Nicole
De: Stanislaw Pusep
Para: Nicole ; Perl Mongers Rio de Janeiro
Enviadas: Segunda-feira, 26 de Novembro de 2012 11:01
Assunto: Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
Esta sintaxe de expressão regular é chamada de "named capture". Surgiu no Perl
v5.10. Ao invés de $1, $2, $3, ..., você dá um nome legível à captura.
Por si só, já é bastante útil, mas a utilidade maior aparece na possibilidade
da construção de "grammars", similares a BNF
(https://pt.wikipedia.org/wiki/Formalismo_de_Backus-Naur#Exemplo).
Recomendo esse artigo para aprender a usar estes
recursos: http://www.effectiveperlprogramming.com/blog/1479
ABS()
2012/11/26 Nicole
Oi a todos,
>
>aproveitando a paciência infinita do Breno...
>
>
>Poderias esclarecer como funciona isto:
>(?...)
>
>
>e o que acontece então aqui:
>
>"valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
>acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};"
>
>
>Criaste um hash de nome %+
>
>É uma variável reservada?
>Qual o valor que assume $mirna aqui?
>Na primeira vez que entra no if, $mirna está vazio, não? Como pode ser key do
>hash %dados assim?
>
>
>[]'s
>Nicole Scherer
>
>
>
>
>
>
>
> De: breno
>Para: Perl Mongers Rio de Janeiro
>Enviadas: Sábado, 24 de Novembro de 2012 9:45
>Assunto: Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos
>
>
>2012/11/24 Aureliano Guedes :
>>
>> Se não for ser muito chato, como faço para seguir a forma abaixo:
>>
>>
>>> 2) trocar de abordagem, fazendo seu parser ler linha a linha (sem
>>> modificar $/) e ir acumulando as linhas até encontrar um símbolo que
>>> indique nova entrada.
>>
>> seria algo do tipo:
>>
>> while (<$fh>){
>> if(/primeira linha/){
>> print $_;
>> }
>> elsif (/ultima linha/){
>> #sair do loop
>> }
>> else {
>> print $_
>> }
>> }
>>
>
>Algo como (atenção, código não testado):
>
>---8<---
>my %dados = ();
>my $mirna;
>my $acumulador;
>
>while (my $linha = <$fh>) {
> if ( $linha =~ m{tag
magica (?\S+)} ) {
> $dados{$mirna} = $acumulador if $mirna;
> $mirna = $+{mirna};
> $acumulador = q();
> }
> else {
> $acumulador .= $linha;
> }
>}
>
>use DDP; p %dados;
>
>--->8---
>
>O que isso faz (ou deveria fazer: já mencionei que não testei?
>Programar a essa hora da manhã não é meu forte, então favor
>desconsiderar qualquer besteira):
>
>1) le o arquivo linha por linha, atribuindo o valor de cada linha a
>$linha (sem usar $_)
>2) sempre que encontrar a tag mágica que separa entradas (estou
>assumindo que a tag indica um novo registro que pode ser chave do seu
>hash de dados:
>2.1) se já estiver com um registro em memória ($mirna), bota os dados
>acumulados ($acumulador) dentro do hash;
>2.2) atribui à $mirna o novo registro encontrado. Note que
estou
>usando grupos nomeados na regex, fazendo (?...) em vez de apenas
>(...). Isso funciona a partir do 5.10.0 e me permite acessar os
>valores agrupados na regex por nome dentro do hash %+. No caso,
>acessei o grupo (?) fazendo $+{mirna};
>2.2) zera o acumulador.
>3) se não encontrar a tag mágica, vai acumulando os dados. Dentro
>desse 'else' vc pode fazer coisas como "next if $linha =~ /.../" caso
>não queira guardar alguma linha, por exemplo.
>4) Depois do while vc pode inspecionar %dados para saber se está tudo ok.
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>
>Entendeu?
>
>[]s
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>http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
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Re: [Rio-pm] Usar API Google Maps.
Você instalou o Geo::Coder::GoogleMaps como root do sistema? Ou usando algo do tipo local::lib ou perlbrew? O que aparece se vc digita "set | grep PERL" numa shell? E se vc rodar "perl -MGeo::Coder::GoogleMaps -E1"? []s -b 2012/11/26 Cleysinho : > Oi pessoal, > > Estou fazendo alguns testes com o módulo Geo::Code::GoogleMaps e outros > módulos que por sua vez não são módulos para SIG (GIS) quando executo meu > script ele retorna um erro afinando que não foi possível localizar o módulo > no sistema. O problema de fato é que eu já instalei os módulos e na > instalação não ocorreu erros. Isso acontece com outros módulos também. > Estou usando ubuntu 12.04 e Debian 6, como posso resolver este problema? > > Erro: > Can't locate Geo/Coder/GoogleMaps.pm in @INC (@INC contains: /etc/perl > /usr/local/lib/perl/5.10.1 /usr/local/share/perl/5.10.1 /usr/lib/perl5 > /usr/share/perl5 /usr/lib/perl/5.10 /usr/share/perl/5.10 > /usr/local/lib/site_perl .) at GM_extractor.pl line 4. > BEGIN failed--compilation aborted at GM_extractor.pl line 4. > > > Em 21 de novembro de 2012 14:18, Gabriel Andrade > escreveu: > >> >> On Nov 19, 2012, at 2:02 PM, Cleysinho wrote: >> >> > Olá Pessoal, >> > >> > Estou em um trabalho que será parte da minha dissertação que envolve >> > Sistema de Informação Geográfica. Estou procurando uma forma de usar a API >> > do Google Maps dentro dos códigos em Perl para gerar mapas dinâmicos >> > conforme a consulta do usuário. Implementei uma Data Warehouse que possui >> > mais de 30.000 coordenadas geográficas de virus do mundo todo. Um sistema >> > semelhante que possui que estou usando como modelo é o GOLD - >> > http://www.genomesonline.org/cgi-bin/GOLD/index.cgi?page_requested=GenomeMap, >> > alguém poderia me dar uma sugestão do que usar para implementar esse mapa? >> > >> >> Você pode popular esses dados num banco que possua suporte a indexação >> geoespacial (GIS) e implementar uma API simples para consultar esses >> dados. >> >> Construa uma página que carrega um mapa do Google Maps e utilize API >> Javascript oferecida[1] para realizar consultas em sua API e carregar >> os dados retornados no mapa. >> >> Um exemplo de uso seria realizar uma consulta à sua API passando o >> atual viewport no mapa e retornando a lista de vírus contida naquela >> área do mapa. O viewport pode ser obtido, por exemplo, através de um >> evento de zoom disparado após a interação do usuário com o mapa. >> >> >> [1] https://developers.google.com/maps/documentation/javascript/reference >> ___ >> Rio-pm mailing list >> Rio-pm@pm.org >> http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm > > > > > -- > .: Inteligência Coletiva :. > Uma inteligência distribuída por toda parte: tal é o nosso axioma inicial. > Ninguém sabe tudo, todos sabem alguma coisa, todo o saber está na > humanidade’. (Pierre Lévy) > > José Cleydson F. da Silva > Open Source Bioinformatics Community > http://opensourcebioinformatics.com > > > ___ > Rio-pm mailing list > Rio-pm@pm.org > http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Usar API Google Maps.
Oi Breno, Os comandos set | grep PERL e perl -MGeo::Coder::GoogleMaps -E1 não retornam nenhum resultado na saída padrão. Para instalar sempre uso os comandos padrão: cpan -i install Geo::Coder::GoogleMaps ou dentro do cpan com install Geo::Coder::GoogleMaps. Abç. Em 26 de novembro de 2012 17:38, breno escreveu: > Geo::Coder::GoogleMaps -- ** .: Inteligência Coletiva :. Uma inteligência distribuída por toda parte: tal é o nosso axioma inicial. Ninguém sabe tudo, todos sabem alguma coisa, todo o saber está na humanidade’. (Pierre Lévy) José Cleydson F. da Silva *O**pen Source Bioinformatics Community* http://opensourcebioinformatics.com ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Usar API Google Maps.
Olha, se "perl -MGeo::Coder::GoogleMaps -E1" funciona, então o perl achou o módulo no seu sistema. Se, nessa mesma shell, vc faz "perl GM_extractor.pl" ele dá pau? Pode colar o seu código no "http://paste.scsys.co.uk";? []s -b 2012/11/26 Cleysinho : > Oi Breno, > > Os comandos set | grep PERL e perl -MGeo::Coder::GoogleMaps -E1 não retornam > nenhum resultado na saída padrão. Para instalar sempre uso os comandos > padrão: > cpan -i install Geo::Coder::GoogleMaps ou dentro do cpan com install > Geo::Coder::GoogleMaps. > > Abç. > Em 26 de novembro de 2012 17:38, breno escreveu: >> >> Geo::Coder::GoogleMaps > > > > > -- > .: Inteligência Coletiva :. > Uma inteligência distribuída por toda parte: tal é o nosso axioma inicial. > Ninguém sabe tudo, todos sabem alguma coisa, todo o saber está na > humanidade’. (Pierre Lévy) > > José Cleydson F. da Silva > Open Source Bioinformatics Community > http://opensourcebioinformatics.com > > > ___ > Rio-pm mailing list > Rio-pm@pm.org > http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
