Re: [Rio-pm] Dúvida regex
De exemplos Em 12/03/2013 20:03, André Torres andretorre...@gmail.com escreveu: Oi pessoa, estou precisando da ajuda de vcs em um problema idiota. eu jogo as imformações contidas na primeira coluna de um arquivo txt em um array, mas o problema é que nao consigo uma maneira de uniformizar o regex para fazer o match e subsequente extração dos elementos para o array pois existem caracteres especiais como pontos, pipes, barras, hifens entre outros nos meios dos elementos. eu tentei isso: next unless m/^.+\s+\w+=\d+/; existe outra forma a nao ser usar o ponto para encontrar qualquer caracter? Muito obrigado. -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Dúvida regex
Então eu acho que não entendi a sua duvida. Tipo isso são colunas? vc quer extrair o que de cada uma delas? por exemplo AAEL00987-PA quero extrair: 00987 BA89.ES-PB quero extrair: PB gi|llum0001334.1-PA não quero isso. 2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com: ai vao alguns que posso encontrar na minha coluna: AAEL00987-PA BA89.ES-PB gi|llum0001334.1-PA Obrigado. Em 12 de março de 2013 20:05, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.com escreveu: De exemplos Em 12/03/2013 20:03, André Torres andretorre...@gmail.com escreveu: Oi pessoa, estou precisando da ajuda de vcs em um problema idiota. eu jogo as imformações contidas na primeira coluna de um arquivo txt em um array, mas o problema é que nao consigo uma maneira de uniformizar o regex para fazer o match e subsequente extração dos elementos para o array pois existem caracteres especiais como pontos, pipes, barras, hifens entre outros nos meios dos elementos. eu tentei isso: next unless m/^.+\s+\w+=\d+/; existe outra forma a nao ser usar o ponto para encontrar qualquer caracter? Muito obrigado. -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://about.me/peczenyj ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Dúvida regex
Desculpa, isso realmente deve ser simples e nao estou sabendo expressar a minha duvida. ai vai um pedaço completo do arquivo. O que eu queria era um regex capaz de identificar as linhas que contem os resultados (ex: F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1) e dai começar a extração dos itens da coluna. Obrigado. ### targetp v1.1 prediction results ## Number of query sequences: 516 Cleavage site predictions not included. Using NON-PLANT networks. Name LenmTP SP other Loc RC -- F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1 DSIM0209463 685 0.193 0.839 0.025 S2 PB13537-PA272 0.081 0.063 0.906 _1 CPIJ016026-PA 575 0.109 0.844 0.093 S2 RPTMP00928-PA 595 0.028 0.909 0.148 S2 DSEC0203033 685 0.171 0.860 0.024 S2 Em 12 de março de 2013 20:32, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.comescreveu: Então eu acho que não entendi a sua duvida. Tipo isso são colunas? vc quer extrair o que de cada uma delas? por exemplo AAEL00987-PA quero extrair: 00987 BA89.ES-PB quero extrair: PB gi|llum0001334.1-PA não quero isso. 2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com: ai vao alguns que posso encontrar na minha coluna: AAEL00987-PA BA89.ES-PB gi|llum0001334.1-PA Obrigado. Em 12 de março de 2013 20:05, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.com escreveu: De exemplos Em 12/03/2013 20:03, André Torres andretorre...@gmail.com escreveu: Oi pessoa, estou precisando da ajuda de vcs em um problema idiota. eu jogo as imformações contidas na primeira coluna de um arquivo txt em um array, mas o problema é que nao consigo uma maneira de uniformizar o regex para fazer o match e subsequente extração dos elementos para o array pois existem caracteres especiais como pontos, pipes, barras, hifens entre outros nos meios dos elementos. eu tentei isso: next unless m/^.+\s+\w+=\d+/; existe outra forma a nao ser usar o ponto para encontrar qualquer caracter? Muito obrigado. -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://about.me/peczenyj ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Dúvida regex
Tente com a regex: /^([\w\d|.-]+)/ Ela deveria pegar qualquer coisa que contenha letras, números, e outros caracteres que você falou, tipo pipe, ponto, traço. Cada vez que o loop rodar, o valor da chave vai ficar disponível em $1 para você colocar no array. Outra forma, se nenhuma dessas chaves contém espaço, é usar: /^[^\s]+/ Renan Rangel 2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com Desculpa, isso realmente deve ser simples e nao estou sabendo expressar a minha duvida. ai vai um pedaço completo do arquivo. O que eu queria era um regex capaz de identificar as linhas que contem os resultados (ex: F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1) e dai começar a extração dos itens da coluna. Obrigado. ### targetp v1.1 prediction results ## Number of query sequences: 516 Cleavage site predictions not included. Using NON-PLANT networks. Name LenmTP SP other Loc RC -- F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1 DSIM0209463 685 0.193 0.839 0.025 S2 PB13537-PA272 0.081 0.063 0.906 _1 CPIJ016026-PA 575 0.109 0.844 0.093 S2 RPTMP00928-PA 595 0.028 0.909 0.148 S2 DSEC0203033 685 0.171 0.860 0.024 S2 Em 12 de março de 2013 20:32, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.comescreveu: Então eu acho que não entendi a sua duvida. Tipo isso são colunas? vc quer extrair o que de cada uma delas? por exemplo AAEL00987-PA quero extrair: 00987 BA89.ES-PB quero extrair: PB gi|llum0001334.1-PA não quero isso. 2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com: ai vao alguns que posso encontrar na minha coluna: AAEL00987-PA BA89.ES-PB gi|llum0001334.1-PA Obrigado. Em 12 de março de 2013 20:05, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.com escreveu: De exemplos Em 12/03/2013 20:03, André Torres andretorre...@gmail.com escreveu: Oi pessoa, estou precisando da ajuda de vcs em um problema idiota. eu jogo as imformações contidas na primeira coluna de um arquivo txt em um array, mas o problema é que nao consigo uma maneira de uniformizar o regex para fazer o match e subsequente extração dos elementos para o array pois existem caracteres especiais como pontos, pipes, barras, hifens entre outros nos meios dos elementos. eu tentei isso: next unless m/^.+\s+\w+=\d+/; existe outra forma a nao ser usar o ponto para encontrar qualquer caracter? Muito obrigado. -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://about.me/peczenyj ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
Re: [Rio-pm] Dúvida regex
2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com: Desculpa, isso realmente deve ser simples e nao estou sabendo expressar a minha duvida. Isso se ganha com o tempo. Veja se isso resolve: https://gist.github.com/anonymous/aa5d7d06ed311a2200c3 ai vai um pedaço completo do arquivo. O que eu queria era um regex capaz de identificar as linhas que contem os resultados (ex: F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1) e dai começar a extração dos itens da coluna. Obrigado. ### targetp v1.1 prediction results ## Number of query sequences: 516 Cleavage site predictions not included. Using NON-PLANT networks. Name LenmTP SP other Loc RC -- F55F3.2b 548 0.025 0.970 0.051 S1 DSIM0209463 685 0.193 0.839 0.025 S2 PB13537-PA272 0.081 0.063 0.906 _1 CPIJ016026-PA 575 0.109 0.844 0.093 S2 RPTMP00928-PA 595 0.028 0.909 0.148 S2 DSEC0203033 685 0.171 0.860 0.024 S2 Em 12 de março de 2013 20:32, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.com escreveu: Então eu acho que não entendi a sua duvida. Tipo isso são colunas? vc quer extrair o que de cada uma delas? por exemplo AAEL00987-PA quero extrair: 00987 BA89.ES-PB quero extrair: PB gi|llum0001334.1-PA não quero isso. 2013/3/12 André Torres andretorre...@gmail.com: ai vao alguns que posso encontrar na minha coluna: AAEL00987-PA BA89.ES-PB gi|llum0001334.1-PA Obrigado. Em 12 de março de 2013 20:05, Tiago Peczenyj tiago.pecze...@gmail.com escreveu: De exemplos Em 12/03/2013 20:03, André Torres andretorre...@gmail.com escreveu: Oi pessoa, estou precisando da ajuda de vcs em um problema idiota. eu jogo as imformações contidas na primeira coluna de um arquivo txt em um array, mas o problema é que nao consigo uma maneira de uniformizar o regex para fazer o match e subsequente extração dos elementos para o array pois existem caracteres especiais como pontos, pipes, barras, hifens entre outros nos meios dos elementos. eu tentei isso: next unless m/^.+\s+\w+=\d+/; existe outra forma a nao ser usar o ponto para encontrar qualquer caracter? Muito obrigado. -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://about.me/peczenyj ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- André Torres Quando o homem aprender a respeitar até o menor ser da criação, seja animal ou vegetal, ninguém precisará ensiná-lo a amar seu semelhante. (Albert Schweitzer - Nobel da Paz de 1952) ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm -- Tiago B. Peczenyj Linux User #405772 http://about.me/peczenyj ___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm
