Luego de leer algunas sujerencias que me han hecho y haciendome un tiempito 
para parar la maquina, que por cierto es uno de los servidores de la empresa 
donde trabajo pude solucionar el problema. 
La resolucion del caso es la siguiente:

Hardware utilizado: 
        2 discos Seagate ST340810A de 40Gb 
        1 CD-Rom Mitsumi FX120T 12X 
        2 cables ide de 40 hilos 
        1 mother Amptron PM7400

Como aclare en el mail anterior al principio tenia uno de los discos jumeado 
como master en la primer ide y el CD-Rom jumpeado como slave y esto funcionaba 
bien de bien. 
Luego al agregar el segundo disco como master en la segunda ide y cambiar el 
CD-Rom como slave en esta fue que empezaron los problemas, a pesar que el 
jumpeo era exactamente el mismo lo unico que cambio de ide. 
La solucion fue basatante simple a pesar de que estuve bastante tiempo para 
encontrarla, estos discos tienen una opcion de jumpeo que dice "master with 
non-ATA compatible slave" que luego de seleccionarla todo quedo funcionando de 
maravilla. 
Pero esta solucion me trajo algunas interrogantes, hastá donde yo se el CD-Rom 
es ATA compatible y por que si en la primer ide funcionaba bien en la segunda 
no lo hacia a pesar de que tuviera discos exactamente iguales?? 
Bueno desde ya agradesco la ayuda que me brindaron y espero la solucion les 
sirva de algo.

Saludos: 
Maximiliano Alonzo 
Administrador de red y sistemas 
Asociación Médica de San José 
Registered User #159472 
[EMAIL PROTECTED] San José - Uruguay 
Linux version 2.2.18pre21 ([EMAIL PROTECTED]) (gcc version 2.7.2.3) #1 Sat Nov 
18 18:47:15 EST 2000
Detected 198950 kHz processor.
Console: colour VGA+ 80x25
Calibrating delay loop... 396.49 BogoMIPS
Memory: 29820k/32768k available (1728k kernel code, 408k reserved, 664k data, 
148k init)
Dentry hash table entries: 4096 (order 3, 32k)
Buffer cache hash table entries: 32768 (order 5, 128k)
Page cache hash table entries: 8192 (order 3, 32k)
VFS: Diskquotas version dquot_6.4.0 initialized
CPU: Intel Pentium 75 - 200 stepping 0c
Checking 386/387 coupling... OK, FPU using exception 16 error reporting.
Checking 'hlt' instruction... OK.
Checking for popad bug... OK.
Intel Pentium with F0 0F bug - workaround enabled.
POSIX conformance testing by UNIFIX
PCI: PCI BIOS revision 2.10 entry at 0xfb0f0
PCI: Using configuration type 1
PCI: Probing PCI hardware
Linux NET4.0 for Linux 2.2
Based upon Swansea University Computer Society NET3.039
NET4: Linux TCP/IP 1.0 for NET4.0
IP Protocols: ICMP, UDP, TCP, IGMP
TCP: Hash tables configured (ehash 32768 bhash 32768)
Starting kswapd v 1.5 
pty: 256 Unix98 ptys configured
Real Time Clock Driver v1.09
RAM disk driver initialized:  16 RAM disks of 4096K size
loop: registered device at major 7
OPTI621: IDE controller on PCI bus 00 dev a0
OPTI621: not 100% native mode: will probe irqs later
    ide0: BM-DMA at 0x3000-0x3007, BIOS settings: hda:pio, hdb:pio
    ide1: BM-DMA at 0x3008-0x300f, BIOS settings: hdc:pio, hdd:pio
hda: ST340810A, ATA DISK drive
hdc: ST340810A, ATA DISK drive
hdd: Fý1·0õ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ ¥ , ATAPI CDROM drive
ide0 at 0x1f0-0x1f7,0x3f6 on irq 14
ide1 at 0x170-0x177,0x376 on irq 15
hda: ST340810A, 38166MB w/2048kB Cache, CHS=4865/255/63
hdc: ST340810A, 38166MB w/2048kB Cache, CHS=4865/255/63
hdd: ATAPI 252X DVD-ROM drive, 42240kB Cache
Uniform CD-ROM driver Revision: 3.11
Floppy drive(s): fd0 is 1.44M
FDC 0 is an 8272A
md driver 0.36.6 MAX_MD_DEV=4, MAX_REAL=8
scsi: <fdomain> Detection failed (no card)
NCR53c406a: no available ports found
sym53c416.c: Version 1.0.0
Failed initialization of WD-7000 SCSI card!
IBM MCA SCSI: Version 3.2
IBM MCA SCSI: No Microchannel-bus present --> Aborting.
              This machine does not have any IBM MCA-bus
              or the MCA-Kernel-support is not enabled!
megaraid: v1.11 (Aug 23, 2000)
aec671x_detect: 
3w-xxxx: tw_findcards(): No cards found.
scsi : 0 hosts.
scsi : detected total.
Partition check:
 hda: hda1 hda2 hda3 < hda5 hda6 hda7 hda8 hda9 >
ATAPI device hdd:
  Unknown Error Type: Data protect -- (Sense key=0x07)
  (vendor-specific error) -- (asc=0xbf, ascq=0x00)
  The failed "Read Cd/Dvd Capacity" packet command was: 
  "25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 "
 hdc: hdc1 hdc2 hdc3 < hdc5 hdc6 hdc7 hdc8 hdc9 >
apm: BIOS version 1.1 Flags 0x07 (Driver version 1.13)
apm: disabled on user request.
VFS: Mounted root (ext2 filesystem) readonly.
Freeing unused kernel memory: 148k freed
NET4: Unix domain sockets 1.0 for Linux NET4.0.
Adding Swap: 128516k swap-space (priority -1)
3c59x.c 16Aug00 Donald Becker and others 
http://www.scyld.com/network/vortex.html
eth0: 3Com 3c905B Cyclone 100baseTx at 0x6000,  00:04:76:b7:d1:45, IRQ 10
  8K byte-wide RAM 5:3 Rx:Tx split, autoselect/Autonegotiate interface.
  MII transceiver found at address 24, status 786d.
  MII transceiver found at address 0, status 786d.
  Enabling bus-master transmits and whole-frame receives.
Serial driver version 4.27 with no serial options enabled
ttyS00 at 0x03f8 (irq = 4) is a 16550A
ttyS01 at 0x02f8 (irq = 3) is a 16550A

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