Hi, I want to include a vector representing the sites - environmental data correlation in a PCA. I currently use prcomp (no scaling) to perform the PCA, and envfit to retrieve the coordinates of the environmental data vector. However, the vector length is different from the one obtained in CAnoco when performing a species - environmental biplot (scaling -2). How can I scale the vector in order to be in accordance with Canoco, or which other scaling options are there?
Thanks for help, Heike ____________________________________________________________________________ "Dit bericht en eventuele aangehechte bestanden zijn vertrouwelijk en uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Ongeautoriseerde verstrekking of bekendmaking aan en gebruik door anderen zijn niet toegestaan. Als u dit bericht per vergissing hebt ontvangen wordt u verzocht dit onmiddellijk aan de afzender te melden en het bericht van uw systemen te verwijderen. De werkgever van de afzender kan niet garanderen dat de verzonden en/of ontvangen informatie juist is en aanvaardt geen aansprakelijkheid voor schade die eruit kan voortvloeien." "This message and any files transmitted with it may contain confidential information and is solely intended for the addressee(s). Any unauthorized disclosure or actions taken in reliance on it are forbidden. If you have received this message in error, please delete it and notify the sender. The employer of the sender does not guarantee that the information sent and/or received is correct and does not accept any liability for damages related thereto." ______________________________________________ [EMAIL PROTECTED] mailing list https://www.stat.math.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help PLEASE do read the posting guide! http://www.R-project.org/posting-guide.html