[R-es] Análisis discriminante lineal, interpretación

2023-10-12 Por tema Fernando Archuby
Buenos días/tardes. He realizado el análisis discriminante exitosamente con la función lda, puedo clasificar nuevos individuos con la función predict, pero no logro darme cuenta cómo los resultados de lda se traducen en la decisión de la clasificación. Es decir, no me doy cuenta cómo es que del

[R-es] Convex hulls para NMDS o PCoA

2020-05-03 Por tema Fernando Archuby
Buenos días/tardes. Me encuentro analizando datos de abundancias de especies por muestras en un estudio paleontológico. He realizdo un análisis de agrupamiento con hclust() con distancia de Bray-Curtis, previo transformación de los datos. He realizado también un PCoA con la misma matriz de

[R-es] NMDS varios

2019-10-24 Por tema Fernando Archuby
Buenos días. Realizo el NMDS para ordenar muestras compuestas por especies biológicas a partir de abundancias, a partir de una matriz de distancias de diferencia porcentual (aka Bray Curtis). Hasta ahí, no encuentro problemas. Por otro lado, las muestras se clasifican de los siguientes modos: -

[R-es] Significancia de clusters

2019-06-08 Por tema Fernando Archuby
Buenos días/tardes/noches. Estoy analizando datos de conteos de especies por muestra (paleontología, pero es similar a un estudio de comunidades actules). Mi matriz consiste en 112 muestras y 113 especies. Probé diferentes estrategias para armar clusters con significado (paleo) biológico. Las dos