Bueno, esta solución la probé yo mismo después de instalar lamp-server^ y, hasta ahora, todo funciona bien. Pude restablecer la contraseña del usuario root de MySQL. La solución está basada en otra que encontré en stackoverflow.

Ejecutar lo siguiente para eliminar todos los paquetes relacionados con mysql:


$ sudo apt-get remove --purge mysql\*


Luego se limpia la información de paquetes descargados:


$ sudo apt-get clean


Se actualizan los índices de paquetes:


$ sudo apt-get update


Y se vuelve a instalar lamp-server^:


$ sudo apt-get install lamp-server^


Después de esto, se pide otra vez una contraseña nueva para el usuario root durante la instalación de MySQL.

El manual de referencia de MySQL 5.0 describe otra forma de restablecer la contraseña, pero no la probé.

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