Нашлось объяснение проблемы: https://bugs.eclipse.org/bugs/show_bug.cgi?id=162886
Для того, чтобы процесс завершался нужно снять галочку Assistive Technology: Enabled -> Disabled -- ubuntu-ru mailing list ubuntu-ru@lists.ubuntu.com https://lists.ubuntu.com/mailman/listinfo/ubuntu-ru