全国非编码RNA与外泌体研究实战研讨班
调控性非编码RNA(regulatory
non-coding
RNA)和外泌体(exosome)是当今生命科学领域发展最迅速的前沿领域。ncRNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果经常入选CNS年度十大科学突破。目前在高等生物中,存在着一个巨大的、尚未被完全发现的RNA世界。人类基因组转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他都是非编码RNA,其中miRNA、lncRNA、circRNA等调控性ncRNA因其重要的调控功能,受到科学家们广泛关注,circRNA更是连续两年位居生命科学领域10大研究热点之首。ncRNA研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术。外泌体可以由多种细胞类型释放,外泌体中含有丰富的miRNA、lncRNA和circRNA等ncRNA,在细胞间信息交流中发挥重要调控功能。ncRNA和外泌体研究不仅受到主流学术期刊的青睐,还是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。只要您是从事医学、动物、植物等生命科学领域,研究与蛋白质参与的生物学过程有关,就可以和miRNA、lncRNA、circRNA等ncRNA进行关联设计。通过参加此次学习班,有助于缩短发表SCI论文、获得研究基金的周期。
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时 间:2019年12月7日-8日(12月6日报到)
地 点:北京冠京饭店(北京市丰台区丰台北路79号)
课程安排:
日期
时间
授课方式
授课内容
12月7日
9:00-12:00
调控性ncRNA简介
调控性非编码RNA概念及重要分类
调控性非编码RNA的来源与生成机制
10:40-12:00
调控模式及研究意义
调控性非编码RNA的调控模式
调控性非编码RNA研究意义
12:00-14:00
午餐与午休
14:00-15:40
常用研究技术
表达谱芯片与RNA-seq数据分析
实时定量PCR
Northern Blot
15:40-17:30
常用研究技术
RNA-RNA、RNA-DNA、RNA-蛋白质等相互作用研究技术: 报告基因分析、ChIRP、RIP、RNA
pull-down、FISH、ChIP、EMSA、Run on、MARGI、PLA
12月8日
8:30-10:40
数据库使用操作
microRNA数据库: miRbase、targetscan、mirDB、RNAhybrid等
10:40-12:00
数据库使用操作
lncRNA数据库:catrapid、lncbase等
circRNA数据库:circBase、CircInteractome等
12:00-14:00
午餐与午休
14:00-15:20
外泌体
外泌体概述
外泌体分离方法
外泌体检测方法
外泌体常用数据库
15:20-17:00
研究案例分析
标书解读
研究案例分析
解读非编码RNA与外泌体相关国自然标书
现场答疑
往期会议现场图片
主讲专家:
本次研习班邀请经验丰富的孙教授主讲,孙教授专注于调控性ncRNA研究十余年,熟悉调控性ncRNA的研究现状和研究策略,具有扎实的理论基础和丰富的实验技能。发表学术论文30多篇,主持承担10余项miRNA、lncRNA和circRNA等ncRNA相关科研项目(主持多项国家自然科学基金)。
会议费用:
会议费:3000元/人,11月20号之前报名可以优惠至:2800元/人(5人团体报名另优惠300元/人),(费用含午餐费和资料费);住宿统一安排,费用自理。
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会议咨询:
章老师 13121195178(微信同号)
E-mail:[email protected]
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开课时间
课程名称
详情介绍
2020年1月10-12日
生物数据分析技能2.0实训会(总第22期)
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生物数据分析技能2.0实训会(总第22期)
生物医学已进入大数据时代,借助生物医学多组学、多层次的海量数据,可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制。由于生物医学数据多呈分散复杂特征,以海量数据挖掘与分析为主体内容的生物信息学技能就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、治疗或作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。本课程曾先后用名《基因序列分析技术》和《功能基因组信息分析技术》,后将上述两门课程整合更名为《生物数据分析技能》,此前共计举办了21期。自本期会议起,会议升级为《生物数据分析技能2.0》,对课程内容与培训日程进行了大幅度调整,递进式专注讲解高通量数据解析:表达数据挖掘→共表达(聚类、富集、相互作用)分析→构建调控网络,以顺应学科发展和满足学员实际需要。授课继续沿用主讲教师独创的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教学模式,着力于以真实问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍涉及的各项技能,指导学员将其融会贯通并应用到课题研究中。TPS教学模式多年来在本科、研究生教学及20余期各类培训会议中取得了极佳的教学效果,受到广大学员的一致好评和推崇。
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时 间:2020年1月10-12日(授课两天一夜)
地 点:合肥伯爵世家酒店
培训日程:(所有课程均含上机实践)
日期
时间
授课题目
授课内容
1月10日
15:00-21:00
签到-领取资料
1月11日
08:00-08:30
软件安装,调试运行
08:30-10:30
表达谱差异数据挖掘
差异表达基因集(DEGs)分析策略。
GEO数据库检索及数据集在线分析。
利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。
10:30-12:00
表达谱数据聚类分析
利用ArrayTools软件(设置各项参数)处理GEO数据库下载的表达谱数据。
表达谱数据聚类分析。
聚类图形优化工具。
14:00-17:30
基因集功能富集分析
利用DAVID、Metascape在线工具进行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO
CC;KEGG Pathway)。
绘制或下载基因集功能富集图。
基因集韦恩图分析。
基因集ID多元转换。
19:00-22:00
基因集相互作用分析
利用String在线工具(设置各项参数)获得基因集相互作用结果。
mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
1月12日
08:30-12:00
交互作用数据可视化
利用Cytoscape软件进行基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达的可视化分析。
批量修改交互网络的节点、边、背景属性。
利用Cytoscape App进行基因集交互网络的GO富集分析、文本挖掘、关键/瓶颈基因及核心基因筛选。
高分辨率可视化结果的保存与输出。
13:30-16:00
共表达调控网络构建
构建基因集差异共表达Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA调控网络。
靶点基因分析策略。
注:上机实践需自带笔记本电脑,会场将布置充足的电源插座。请确保电脑配置无线网卡,操作系统为Win XP/7/8/10,而非Mac系统或上网本(个别软件不能运行)
会议费用:
3400元/人,12月20号之前汇款+报名可以优惠至:3200元/人(5人团体报名另优惠300元/人)。(费用含午餐费和资料费);住宿统一安排,费用自理。
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会务咨询:
联系人:章老师
手 机:13121195178 (微信同号)
E-mail:[email protected]
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2019年12月7-8日
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