Hello Carsten,

First try was nok, I have to purge Thunderbird and the second try was ok.


The previous problematic file is now this way

root@debian:/etc/apparmor.d/local# cat usr.bin.thunderbird
# Site-specific additions and overrides for usr.bin.thunderbird.
# For more details, please see /etc/apparmor.d/local/README.

As far as I can guess this came from the way the update went:

1) gnome gpk-update-viewer was running with no ending so I interrupted it, it 
seems gnome is unable to display the question thunderbird update asked. I 
reported this behaviour
https://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=868122

2) So I finished the update manually
root@debian:/# dpkg --configure -a
Paramétrage de thunderbird (1:52.2.1-4) ...

Fichier de configuration « /etc/apparmor.d/usr.bin.thunderbird »
 ==> Supprimé (par vous ou par un script) depuis l'installation.
 ==> Le distributeur du paquet a fourni une version mise à jour.
   Que voulez-vous faire ? Vos options sont les suivantes :
    Y ou I  : installer la version du responsable du paquet
    N ou O  : garder votre version actuellement installée
      D     : afficher les différences entre les versions
      Z     : suspendre ce processus pour examiner la situation
 L'action par défaut garde votre version actuelle.
*** usr.bin.thunderbird (Y/I/N/O/D/Z) [défaut=N] ? Y
Installation de la nouvelle version du fichier de configuration 
/etc/apparmor.d/usr.bin.thunderbird ...
AppArmor parser error for /etc/apparmor.d/usr.bin.thunderbird in 
/etc/apparmor.d/local/usr.bin.thunderbird at line 1: Found unexpected 
character: ''


Below all the commands and report you asked.

*******************************************first try 
*******************************************

root@debian:/# find /etc/apparmor.d -type f -name "*thunderbird*" -exec sudo rm 
{} \;
root@debian:/# cd /etc/apparmor.d
root@debian:/etc/apparmor.d# ls *thunderbird*
ls: impossible d'accéder à '*thunderbird*': Aucun fichier ou dossier de ce type
root@debian:/etc/apparmor.d# cd local
root@debian:/etc/apparmor.d/local# ls *thunderbird*
ls: impossible d'accéder à '*thunderbird*': Aucun fichier ou dossier de ce type
root@debian:/etc/apparmor.d/local# cd ../disable
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# ls *thunderbird*
usr.bin.thunderbird
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# rm usr.bin.thunderbird
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# apt install --reinstall thunderbird
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances
Lecture des informations d'état... Fait
0 mis à jour, 0 nouvellement installés, 1 réinstallés, 0 à enlever et 0 non mis 
à jour.
Il est nécessaire de prendre 0 o/40,8 Mo dans les archives.
Après cette opération, 0 o d'espace disque supplémentaires seront utilisés.
(Lecture de la base de données... 208083 fichiers et répertoires déjà 
installés.)
Préparation du dépaquetage de .../thunderbird_1%3a52.2.1-4_amd64.deb ...
Dépaquetage de thunderbird (1:52.2.1-4) sur (1:52.2.1-4) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour mime-support (3.60) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour desktop-file-utils 
(0.23-1) ...
Paramétrage de thunderbird (1:52.2.1-4) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.7.6.1-2) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour gnome-menus (3.13.3-9) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour hicolor-icon-theme 
(0.15-1) ...

************************************************************bad 
********************************
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# aa-disable thunderbird
Profile for /usr/bin/thunderbird not found, skipping
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# cd ..
root@debian:/etc/apparmor.d# ls *thunderbird*
ls: impossible d'accéder à '*thunderbird*': Aucun fichier ou dossier de ce type
root@debian:/etc/apparmor.d# ls -alrt
total 232
drwxr-xr-x   2 root root  4096 mars  30  2016 force-complain
-rw-r--r--   1 root root   964 mars  30  2016 usr.sbin.mdnsd
-rw-r--r--   1 root root  1013 mars  30  2016 usr.sbin.identd
-rw-r--r--   1 root root   790 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.ssl-params
-rw-r--r--   1 root root   967 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.pop3-login
-rw-r--r--   1 root root   900 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.pop3
-rw-r--r--   1 root root  1109 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.managesieve-login
-rw-r--r--   1 root root   953 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.managesieve
-rw-r--r--   1 root root  1008 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.imap-login
-rw-r--r--   1 root root  1056 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.dovecot-auth
-rw-r--r--   1 root root   887 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.dict
-rw-r--r--   1 root root  1153 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.deliver
-rw-r--r--   1 root root   733 mars  30  2016 usr.lib.dovecot.anvil
-rw-r--r--   1 root root  8243 mars  30  2016 usr.bin.chromium-browser
-rw-r--r--   1 root root  1307 mars  30  2016 sbin.syslogd
-rw-r--r--   1 root root   999 mars  30  2016 sbin.klogd
-rw-r--r--   1 root root  5995 avril 26  2016 usr.bin.evince
-rw-r--r--   1 root root   920 juil.  1  2016 usr.sbin.smbldap-useradd
-rw-r--r--   1 root root   916 juil.  1  2016 usr.sbin.avahi-daemon
-rw-r--r--   1 root root  2619 juil.  1  2016 usr.lib.dovecot.dovecot-lda
-rw-r--r--   1 root root   540 déc.   9  2016 usr.sbin.cups-browsed
-rw-r--r--   1 root root  1469 janv.  6  2017 usr.sbin.tcpdump
-rw-r--r--   1 root root   783 janv.  6  2017 usr.sbin.apt-cacher-ng
-rw-r--r--   1 root root  2995 janv.  6  2017 usr.bin.pidgin
-rw-r--r--   1 root root  1329 janv.  6  2017 usr.bin.irssi
-rw-r--r--   1 root root   873 janv.  9  2017 usr.sbin.traceroute
-rw-r--r--   1 root root  1676 janv.  9  2017 usr.sbin.smbd
-rw-r--r--   1 root root  1333 janv.  9  2017 usr.sbin.nscd
-rw-r--r--   1 root root   817 janv.  9  2017 usr.sbin.nmbd
-rw-r--r--   1 root root  2039 janv.  9  2017 usr.sbin.dovecot
-rw-r--r--   1 root root  3300 janv.  9  2017 usr.sbin.dnsmasq
-rw-r--r--   1 root root   700 janv.  9  2017 usr.lib.dovecot.log
-rw-r--r--   1 root root  1035 janv.  9  2017 usr.lib.dovecot.lmtp
-rw-r--r--   1 root root  1144 janv.  9  2017 usr.lib.dovecot.imap
-rw-r--r--   1 root root   898 janv.  9  2017 usr.lib.dovecot.config
-rw-r--r--   1 root root  1324 janv.  9  2017 usr.lib.dovecot.auth
-rw-r--r--   1 root root  1973 janv.  9  2017 sbin.syslog-ng
-rw-r--r--   1 root root   836 janv.  9  2017 bin.ping
-rw-r--r--   1 root root  5488 juin  18 16:24 usr.sbin.cupsd
-rw-r--r--   1 root root  1065 juil.  3 09:13 usr.bin.totem-previewers
-rw-r--r--   1 root root  1116 juil.  3 09:13 usr.bin.totem
-rw-r--r--   1 root root   569 juil.  3 09:13 gst_plugin_scanner
drwxr-xr-x   5 root root  4096 juil.  6 08:43 tunables
drwxr-xr-x   2 root root  4096 juil.  6 08:43 apache2.d
drwxr-xr-x   4 root root 12288 juil.  8 06:18 abstractions
drwxr-xr-x   2 root root  4096 juil. 12 21:40 cache
drwxr-xr-x   2 root root  4096 juil. 12 21:40 local
drwxr-xr-x   2 root root  4096 juil. 12 21:42 disable
drwxr-xr-x 151 root root 12288 juil. 12 21:42 ..
drwxr-xr-x   9 root root  4096 juil. 12 21:43 .

*****************************************second try*********************

root@debian:/etc/apparmor.d# apt purge thunderbird
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances
Lecture des informations d'état... Fait
Les paquets suivants seront ENLEVÉS :
  lightning* lightning-l10n-fr* thunderbird* thunderbird-l10n-fr*
0 mis à jour, 0 nouvellement installés, 4 à enlever et 0 non mis à jour.
Après cette opération, 115 Mo d'espace disque seront libérés.
Souhaitez-vous continuer ? [O/n]
(Lecture de la base de données... 208083 fichiers et répertoires déjà 
installés.)
Suppression de lightning-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
Suppression de lightning (1:52.2.1-4) ...
Suppression de thunderbird-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
Suppression de thunderbird (1:52.2.1-4) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour mime-support (3.60) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour desktop-file-utils 
(0.23-1) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.7.6.1-2) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour gnome-menus (3.13.3-9) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour hicolor-icon-theme 
(0.15-1) ...
(Lecture de la base de données... 207497 fichiers et répertoires déjà 
installés.)
Purge des fichiers de configuration de thunderbird (1:52.2.1-4) ...
root@debian:/etc/apparmor.d# apt install lightning lightning-l10n-fr 
thunderbird thunderbird-l10n-fr
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances
Lecture des informations d'état... Fait
Paquets suggérés :
  calendar-google-provider fonts-lyx
Les NOUVEAUX paquets suivants seront installés :
  lightning lightning-l10n-fr thunderbird thunderbird-l10n-fr
0 mis à jour, 4 nouvellement installés, 0 à enlever et 0 non mis à jour.
Il est nécessaire de prendre 0 o/42,6 Mo dans les archives.
Après cette opération, 115 Mo d'espace disque supplémentaires seront utilisés.
Sélection du paquet thunderbird précédemment désélectionné.
(Lecture de la base de données... 207493 fichiers et répertoires déjà 
installés.)
Préparation du dépaquetage de .../thunderbird_1%3a52.2.1-4_amd64.deb ...
Dépaquetage de thunderbird (1:52.2.1-4) ...
Sélection du paquet lightning précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../lightning_1%3a52.2.1-4_amd64.deb ...
Dépaquetage de lightning (1:52.2.1-4) ...
Sélection du paquet lightning-l10n-fr précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../lightning-l10n-fr_1%3a52.2.1-4_all.deb ...
Dépaquetage de lightning-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
Sélection du paquet thunderbird-l10n-fr précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../thunderbird-l10n-fr_1%3a52.2.1-4_all.deb ...
Dépaquetage de thunderbird-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour mime-support (3.60) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour desktop-file-utils 
(0.23-1) ...
Paramétrage de thunderbird (1:52.2.1-4) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.7.6.1-2) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour gnome-menus (3.13.3-9) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour hicolor-icon-theme 
(0.15-1) ...
Paramétrage de thunderbird-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
Paramétrage de lightning (1:52.2.1-4) ...
Paramétrage de lightning-l10n-fr (1:52.2.1-4) ...
root@debian:/etc/apparmor.d# ls *thunderbird*
usr.bin.thunderbird
*******************************************************good 
************************************
root@debian:/etc/apparmor.d# aa-disable thunderbird
Disabling /usr/bin/thunderbird.
root@debian:/etc/apparmor.d# cd local
root@debian:/etc/apparmor.d/local# ls *thunderbird*
usr.bin.thunderbird
root@debian:/etc/apparmor.d/local# ls -alrt usr.bin.thunderbird
-rw-r--r-- 1 root root 126 juil. 12 21:47 usr.bin.thunderbird
root@debian:/etc/apparmor.d/local# cd ../disable
root@debian:/etc/apparmor.d/disable# ls -alrt usr.bin.thunderbird
lrwxrwxrwx 1 root root 35 juil. 12 21:48 usr.bin.thunderbird -> 
/etc/apparmor.d/usr.bin.thunderbird


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