Re: [Rio-pm] aprendendo ao corrigir provas

2017-06-28 Por tôpico Nicole Scherer
implicit alias for each item in the list that you're looping over. Segue a referência da documentação:  http://perldoc.perl.org/perlsyn.html#For-Loops 2017-06-28 11:07 GMT-04:00 Nicole Scherer : Olá Monges! Estou chocada!Acabei de descobrir que alterar o valor de $item dentro de um loop  forea

Re: [Rio-pm] Bio::Filter

2014-05-12 Por tôpico Nicole Scherer
Oi Aureliano, para filtrar flat files do UniprotKB e do Genbank eu criei meus próprios scripts, usando programação estruturada (há uns bons anos), pois não conseguia me entender bem com o BioPerl e a orientação a objetos. Também tenho scripts para trabalhar saídas de alinhamentos e do hmmer. Co

Re: [Rio-pm] nota de falecimento

2014-05-12 Por tôpico Nicole Scherer
Que triste notícia, Breno. A Diana era uma dos poucos mongers (difícil concordância) que eu conhecia pessoalmente, e era um dos rostos que montava a minha imagem deste grupo. Difícil de aceitar que tenha acontecido isto. Muito ruim! Abraços e força aos que terão que conviver com o espaço vazio d

Re: [Rio-pm] Configuração de usuário não root no cpan & Perl Roll em Rocks Cluster

2014-01-30 Por tôpico Nicole Scherer
para o .bashrc/.profile, o Perl "se sentirá em casa" no $HOME :) O cpanminus é opcional; única coisa absolutamente necessária é que "perl -Mlocal::lib" seja rodado para inicializar o $HOME/perl5, e que as variáveis de ambiente estejam definidas do jeito que o "perl -Mlocal

Re: [Rio-pm] Configuração de usuário não root no cpan & Perl Roll em Rocks Cluster

2014-01-30 Por tôpico Nicole Scherer
gar a configuração: . $HOME/.profile 3.5. Prosseguindo com a configuração/teste do CPAN e do cpanm (essa configuração faz as dependências serem instaladas automaticamente): $ cpan cpan[1]> o conf prerequisites_policy follow cpan[2]> o conf commit cpan[3]> install App::cpanminus cpan[4]&g

[Rio-pm] Configuração de usuário não root no cpan & Perl Roll em Rocks Cluster

2014-01-29 Por tôpico Nicole Scherer
Boa tarde, queridos Mongers, eu não queria importuná-los com problemas simples, mas após três dias batendo a cabeça e vasculhando fóruns na internet sem solução para algumas das perguntas, recorro a vocês. Vou tentar explicar a novela. Montamos um cluster HPC para pesquisa usando o Rocks 6.1 (

Re: [Rio-pm] Gene-analysis firms reach for the cloud

2013-03-22 Por tôpico Nicole Scherer
asil desse ano, mas não custa nada >deixar claro pra nós reles mortais que não trabalham na área :-) > >[]s > >-b > > >On Thu, Mar 21, 2013 at 2:55 PM, Nicole Scherer > wrote: >> Nature | News >> >> Gene-analysis firms reach for the cloud >>

[Rio-pm] Gene-analysis firms reach for the cloud

2013-03-21 Por tôpico Nicole Scherer
Nature| News Gene-analysis firms reach for the cloud Online bioinformatics companies rush to provide genomics platforms and software for hospitals. * Erika Check Hayden 19 March 2013 http://www.nature.com/news/gene-analysis-firms-reach-for-the-cloud-1.12634?WT.ec_id=NATURE-20130321__

Re: [Rio-pm] Perl 5 Maven em Português.

2013-03-13 Por tôpico Nicole Scherer
Legal, Felipe! Vou passar para os nossos alunos. []'s Nicole De: Felipe Leprevost Para: Curitiba Perl Mongers ; Rio Perl Mongers ; São Paulo Perl Mongers ; Brasil Perl Mongers Enviadas: Quarta-feira, 13 de Março de 2013 8:30 Assunto: [Rio-pm] Perl 5 Mave

Re: [Rio-pm] reflexão, revolução, anyone? :)

2013-03-11 Por tôpico Nicole Scherer
:-) Oi Nuba. Uma sociedade anárquica verdadeira seria perfeita, porém a diversidade humana é tal que sempre haverá indivíduos que preferem seguir um líder a ter de tomar decisões autônomas. E sempre haverá indivíduos que preferem decidir por todos (o que claramente não é o teu caso). Espero

Re: [Rio-pm] obtendo dados do HTTP header atraves de proxy

2013-03-11 Por tôpico Nicole Scherer
: Bad hostname 'ftp://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/ce4/database/' at teste_proxy.pl line 18. --- Alguma ideia, sobre o que estou fazendo errado? []'s Nicole De: Renato Santos Para: Nicole Scherer Cc: Perl Mon

Re: [Rio-pm] obtendo dados do HTTP header atraves de proxy

2013-03-08 Por tôpico Nicole Scherer
. []'s Nicole De: Renato Santos Para: Nicole Scherer ; Perl Mongers Rio de Janeiro Enviadas: Sexta-feira, 8 de Março de 2013 17:01 Assunto: Re: [Rio-pm] obtendo dados do HTTP header atraves de proxy Existe a possibilidade do seu proxy não estar repas

[Rio-pm] obtendo dados do HTTP header atraves de proxy

2013-03-08 Por tôpico Nicole Scherer
Oi Mongers, venho humildemente consultar o vasto conhecimento de vocês em prol da pesquisa científica. Preciso consultar o tamanho de um arquivo em um servidor ftp, antes de decidir se o arquivo deverá ou não ser baixado. Eu estava usando o LWP::Simple::head($url) para isto, e estava funcionand

Re: [Rio-pm] IDE para Perl

2013-03-01 Por tôpico Nicole Scherer
olher com calma as interfaces necessarias. >>> >>>2013/3/1 Gabriel Vieira : >>> >>>> Fui desenvolvedor do Padre por um tempo (comecei como usuário - parece >>>> papo de drogas, né?). >>>> >>>> Hoje utilizo o Sublime Text

[Rio-pm] IDE para Perl

2013-03-01 Por tôpico Nicole Scherer
Oi Mongers, nunca usei estas coisas, mas estou precisando de uma agora. Existe alguma IDE com suporte para Perl? Tipo Eclipse. O que vocês usam? Abraços, Nicole___ Rio-pm mailing list Rio-pm@pm.org http://mail.pm.org/mailman/listinfo/rio-pm

Re: [Rio-pm] Perl POD

2012-12-18 Por tôpico Nicole Scherer
apresentação sobre o uso do POD para meus colegas do laboratório. Se for implementado por todos, vai nos facilitar muito a vida. []'s Nicole PS: Não sei como não entrei no rio-pm antes... é tão bom De: Nicole Scherer Para: "rio-pm@pm.org"

[Rio-pm] Perl POD

2012-12-18 Por tôpico Nicole Scherer
Oi Mongers, vocês usam o perl POD para documentar seus scripts e pacotes, ou há outra estratégia de documentação mais recomendada. Pergunto, porque já usei (bem pouquinho) o POD, só que com ele eu perco a gambiarra de comentar pedaços grandes de código usando o =begin ... =cut. Existe outra est

Re: [Rio-pm] [Passatempo] Interpretador para BrainFuck

2012-12-13 Por tôpico Nicole Scherer
Caros, se entendi bem, o given e o when, assim como o case, são mais das formas alternativas ("há muitas maneiras de se fazer a mesma coisa em Perl") de se fazer "if-elsif-else" com linguagem mais coloquial. Certo? Seria o mesmo que: my $var = 'Carneirao'; if ($var eq 'Carneirao'){say "Opa,

Re: [Rio-pm] ES 13/dez · Hackathon 15/dez

2012-12-11 Por tôpico Nicole Scherer
Oi Monges, Se até quinta eu curar da tosse braba, vou querer participar também. Posso? Esse Heavy Duty é aquele do "pior atendimento do mundo"? É perigoso chegar a pé sozinha? Até que horas vocês costumam ficar? []'s Nicole De: Eduardo Maia Para: Perl Mongers

Re: [Rio-pm] Comparação de arquivos

2012-11-26 Por tôpico Nicole Scherer
> > >Criaste um hash de nome %+ > >É uma variável reservada? >Qual o valor que assume $mirna aqui? >Na primeira vez que entra no if, $mirna está vazio, não? Como pode ser key do >hash %dados assim? > > >[]'s >Nicole Scherer > > > > > > &g