Got it!
:D
2014-11-07 21:31 GMT-02:00 Aureliano Guedes :
> Eu conheço o BioPerl. Mas eu preciso fazer essas pequenas rotinas eu
> mesmo. Porque alem de serem pequenas pra necessitar de módulos externos,
> fica mais portável para sistemas que nao possuem o BioPerl instalado. E
> também são exer
Eu conheço o BioPerl. Mas eu preciso fazer essas pequenas rotinas eu mesmo.
Porque alem de serem pequenas pra necessitar de módulos externos, fica mais
portável para sistemas que nao possuem o BioPerl instalado. E também são
exercícios.
Mesmo assim obrigado.
Andre Carneiro escreveu:
Aurelian
Aureliano,
Você considerou usar Bioperl, para auxiliá-lo na 'lida' com bioinformática?
É uma biblioteca bastante madura e amplamente usada. Seria bom dar uma
olhada - http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page
https://metacpan.org/pod/distribution/BioPerl/BioPerl.pm
Atenciosamente
2014-11-07 20:35
Saudações Aureliano,
On Fri, Nov 07, 2014 at 02:03:08PM +, Aureliano Guedes wrote:
[...]
> o fato é que ainda não aprendi bem regex então não conhecia \w.
[...]
Sendo regexp uma limitação, você poderia fazer a manipulação de strings
sem o uso de regexp neste caso. Dois exemplos (de
--------------
>> Date: Fri, 7 Nov 2014 11:47:06 -0200
>> From: leprevos...@gmail.com
>> To: rio-pm@pm.org
>> Subject: Re: [Rio-pm] Dúvida com split
>>
>>
>> Oi Aureliano,
>>
>> tenta o seguinte:
>>
>> my @codons = $rna =~ m/\w{3
uedes :
>
> Funcionou, o fato é que ainda não aprendi bem regex então não conhecia o
>> \w. Mas compreendi completamente o código.
>> Obrigado.
>>
>> --------------
>> Date: Fri, 7 Nov 2014 11:47:06 -0200
>> From: leprevos...@gmail.com
>>
que ainda não aprendi bem regex então não conhecia o
> \w. Mas compreendi completamente o código.
> Obrigado.
>
> --
> Date: Fri, 7 Nov 2014 11:47:06 -0200
> From: leprevos...@gmail.com
> To: rio-pm@pm.org
> Subject: Re: [Rio-pm] Dúvida com split
>
Funcionou, o fato é que ainda não aprendi bem regex então não conhecia o \w.
Mas compreendi completamente o código.
Obrigado.
Date: Fri, 7 Nov 2014 11:47:06 -0200
From: leprevos...@gmail.com
To: rio-pm@pm.org
Subject: Re: [Rio-pm] Dúvida com split
Oi Aureliano
Oi Aureliano,
tenta o seguinte:
my @codons = $rna =~ m/\w{3}/g;
abraços
On 07-11-2014 11:44, Aureliano Guedes wrote:
Ola monges,
Tenho uma dúvida simples.
Digamos que eu tenha uma string com uma sequencia de RNA:
$rna = 'AUGACGAAGCGUUGAUCC';
Só hipotético mesmo.
Então quero agrupar de 3 em
Ola monges,
Tenho uma dúvida simples.
Digamos que eu tenha uma string com uma sequencia de RNA:
$rna = 'AUGACGAAGCGUUGAUCC';
Só hipotético mesmo.
Então quero agrupar de 3 em 3 letras (nucleotídeos) formando codons:
AUG ACG AAG CGU UGA UCC
Para isso eu acho conveniente colocar em um array, e faço
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