Hola...Gracias por la respuesta. Exactamente lo que esperaba era que en la
carpeta que ejecuto el calculo me eparescan los archivos de los cuales me
habla, sin embargo estos no aparecen. He estado ejecutando una prueba ahora
con la molecula CH3 y pasan horas sin que los archivos aparescan en la
carpeta. Estoy ejecutando en paralelo con 6 procesadores. Al iniciar el
calculo la ventana de la terminal queda congelada en este estado aunque al
observar el rendimiento de los procesadores me aparece que efectivamente el
preoceso siesta esta ejecutandose, aunque en la carpeta de calculo no
aparece ningun archivo de salida asociado.
Este es el mensaje que me aparece al iniciar el calculo.
*
gcarden...@cluster6:~/CH3$ mpirun -np 6 siesta ch3.fdf ch3.out
--------------------------------------------------------------------------
A deprecated MCA parameter value was specified in the environment or
on the command line. Deprecated MCA parameters should be avoided;
they may disappear in future releases.
Deprecated parameter: pls_rsh_agent
--------------------------------------------------------------------------
Siesta Version: siesta-2.0.2
Architecture : x64-pc-linux-openmpi-pgi
Compiler flags: /opt/mpi/bin/mpif90 -g -fast -tp p7-64
PARALLEL version
NetCDF-capable
* Running on 6 nodes in parallel
>> Start of run: 22-MAR-2008 15:50:56
***********************
* WELCOME TO SIESTA *
***********************
reinit: Reading from standard input
************************** Dump of input data file
*****************************
Desde ya muchas gracias por su respuesta y ojala pudiera ayudarme con esta
duda sobre el programa, y revelar si acaso existe algun problema con la
instalacion.
Diego
2010/10/7 Marcos Veríssimo Alves <marcos.verissimo.al...@gmail.com>
> Diego,
>
> As far as I know Siesta has no temporary files, at least no relevant ones.
> Most of the output you need to check the current status of your calculation
> will be in the redirection of the standard output you do to disk as you run
> siesta:
>
> siesta < filename.fdf > filename.out
>
> The output file filename.out will contain most of the information you need
> for following the development of your calculation.
>
> Marcos
>
> On Thu, Oct 7, 2010 at 6:33 PM, Diego Cortes Arriagada <
> diego.cort...@usach.cl> wrote:
>
>> Hello
>>
>> I am a new user of siesta. I would like to know if siesta saves temporary
>> files in any folder during the development of a calculation, in order to
>> checking the status of calculation
>>
>> Thanks In advance .
>>
>> --
>> Diego Cortés A.
>> Laboratorio de Química Teórica
>> Facultad de Química y Biología
>> USACH
>> 7181138
>> 08-2034358
>>
>
>
--
Diego Cortés A.
Laboratorio de Química Teórica
Facultad de Química y Biología
USACH
7181138
08-2034358
